Geri Dön

Matris teorisinin biyokimyasal kinetiğe uygulanması

Application of matrices theory to biochemical kinetics

  1. Tez No: 105309
  2. Yazar: HAKAN YETİŞKİN
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. MUSTAFA BAYRAM
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Matematik, Mathematics
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2001
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Atatürk Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Matematik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 35

Özet

ÖZET Metabolik ağların kinetiğinin incelenmesinde sisteme ait matematiksel modelin kurulması önemlidir. Biyokimyasal kinetik teoride, bir Xt metabolitinin konsantrasyonunu gösteren xi nin reaksiyon boyunca değişim hızı her biri Xi metabolitinin stokiyometri katsayısı ile çarpımına karşılık gelen r-tane reaksiyon hızının toplamına eşittir, v -hız vektörü, N metabolitin sistem bileşenine nasıl katıldığını temsil eden stokiyometri matrisi ve x de konsantrasyon vektörü olmak üzere, bir metabolik sistemin kinetiğinin matematiksel modeli dx Ar - = Nv dt şeklinde lineer olmayan diferansiyel denklem takımı ile ifade edilir. Sistemin kinetiği lineer olmayan diferansiyel denklemlerden oluştuğu için çözümü genellikle zordur. Bu nedenle sistem için matematiksel modelin kurulmasında korunum bağıntılarının kullanılması ayrıca önemlidir. Bir metabolik sistem için korunum bağıntılarının çıkarılması temel olarak Af stokiyometri matrisinin alt matrislere parçalanmasına dayanır. Bu çalışmada bir metabolik sistemin korunum bağıntılarının çıkarılışı için bir teori verilmiş olup bu teori kullanılarak verilen rasgele bir sistem ve stokiyometri matrisi için korunum bağıntılarını sembolik olarak hesaplayan bir MAPLE programı geliştirilmiştir. Bu program ile sonlu olmayan sayıda ara ürün ve reaksiyon içeren ağlar için korunum bağıntıları yazılabilir.

Özet (Çeviri)

11 SUMMARY In order to make kinetic analysis of a metabolic pathway, construction of mathematical model describing its kinetics is a major part of the work. In the framework of biochemical kinetic theory, it is assumed that the rate of changes in the concentration xt of a metabolite Xt is the sum of the r reaction rates, each weighted by corresponding stoichiometric coefficient of Xi. Using v and x to denote the rate vector and concentration vector respectively, mathematical model for kinetics of a system can be written as dx.T - = Nv dt where N is stoichiometric matrix which represents how the metabolites involved in the system combine. Derivation of conservation relationships which mainly depends on decomposition of stoichiometric matrix N plays important roles in constructing mathematical model of the system. In present the study, we have developed a computer program in MAPLE in order to derive all of the conservation relationships for a given metabolic pathway automatically that can be applied to any pathways which may include unlimited steps and intermediate metabolites.

Benzer Tezler

  1. A framework for gene co-expression network analysis of lung cancer

    Akciğer kanserinin gen ortak ifade analizi için bir yöntem

    ERHAN AKDEMİR

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2013

    BiyolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoenformatik Bölümü

    DOÇ. DR. TOLGA CAN

    YRD. DOÇ. DR. YEŞİM AYDIN SON

  2. Matris oyunları teorisinin bazı problemleri

    Some problems of matrix games theory

    AYKUT OR

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    MatematikÇanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi

    Matematik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. YAKUP HACI

  3. The roles of matrix norms in the game theory

    Matris normlarının oyun teorisindeki rolleri

    MURAT ÖZKAYA

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2018

    Matematikİstanbul Teknik Üniversitesi

    Matematik Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ BURHANEDDİN İZGİ

  4. Mutlak matris toplanabilme metodları

    Absolute matrix summability methods

    HATİCE NEDRET ÖĞDÜK

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    MatematikErciyes Üniversitesi

    Matematik Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. HİKMET ÖZARSLAN

  5. Özel rölativite teorisinin ve lorentz dönüşümlerinin clıfford cebirleriyle incelenmesi

    Invetigations of special theory of relativity and lorentz transformations with clifford algebras

    HALUK ÖZENİR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2006

    Fizik ve Fizik MühendisliğiAnadolu Üniversitesi

    Fizik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. KUDRET ÖZDAŞ

    YRD. DOÇ. DR. SÜLEYMAN DEMİR