Geri Dön

İnsan meme ve kolon karsinomu hücre hatlarının karyotipik ve moleküler sitogenetik karakterizasyonu

Karyotipic and molecular cytogenetic characterization of human breast and colon carcinoma cell lines

  1. Tez No: 107607
  2. Yazar: İLKNUR YILMAZ
  3. Danışmanlar: Y.DOÇ.DR. OĞUZ ALTUNGÖZ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Kolon Kanseri, Meme Kanseri, Sitogenetik, Moleküler Sitogenetik VI, Colon Cancer, Breast Cancer, Cytogenetics, Molecular Cytogenetics VII
  7. Yıl: 2001
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Dokuz Eylül Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 753

Özet

ÖZET Tümör hücrelerindeki genetik değişikliklerin kompleks ve heterojen yapıda oluşu, bu anomalilerin kanser hücreleri popülasyonunda tam olarak karakterize edilmesini, mikroskobik düzeydeki değişikliklerin moleküler temelinin anlaşılmasını ve bu olguların biyolojik süreçlerle ilişkilendirilmesini güçleştirmektedir. Bu çalışmada bir meme adenokarsinomu (MDA-MB-468) ve bir kolon adenokasinomu hücre hattının (SW-480) tam olarak karakterize edilmesi hedeflenmiştir. G-bantlama, komparatif genomik hibridizasyon (CGH), kromozom boyama kombine olarak kullanılmıştır. SW-480'de G-bantlamada literatürle benzer sonuçlar elde edilmesine karşın, marker kromozom olarak belirtilen bir kromozomun 18 no'lu kromozomun bir parçası olduğu, 18 no'lu kromozomun uzun kolunda kopya sayısı kaybı olduğu saptanmıştır. Aym hücre hatanda ins(7;?) olarak saptanan anomalinin, 7 no'lu kromozomun uzun kolunda belli segmentlerin amplifikasyonu olduğu CGH eğri profilleri ile saptanmıştır. Bu hücre hattının tam karyotipi: 57,X,+X,-Y,t(l;9) (q21;qll), +der(2)t(2;12) (q33;ql2), +der(3)del(3) (ql2), t(5;20) (ql5;pl2), +der(7)inv(7) (q22q36) t(7;14)(q22;q22),t(7;13)(q36;ql4),+7,der(8)t(8;?)(ql 1 ;?), +der(8) t(8;9) (qll;qll), der(10) t(3;10;12) (3qter->3q21::12ql4->12qll::10pl5-> 10qter),+ll, iso(12) (plO), +13, -14, +17,del(18) (ql2),der(19)add(19)(ql3),+der(20) t(5;20) (ql5;pl2), +20, +marl, +mar2 olacak şekilde belirlenmiştir. MDA-MB-468 hücre hatanda modal kromozom sayısının 59-61 olduğu saptanmıştır. Kromozom anomalileri çok kompleks olduğundan karyotip tam olarak çözümlenememiştir. Marker kromozomlarının yapısının belirlenmesinde CGH peek profili, wcp problanyla yapılan FISH deneylerinin verileri ve G-bantlama ile elde edilen karyotipik veriler ortak olarak değerlendirilmiştir. Ancak, kromozom anomalilerinin oldukça kompleks olması nedeni ile nomenklatür sistemine göre ayrıntılı karyotipik tanımlama yapılamamıştır. Tüm veriler biribirini destekler özelliktedir. Karyotip tam olarak çözümlenemediğinden, bu hücre hattının analizi CGH peek profilinden yola çıkılarak yapılmışlar. CGH peek profillerinde lp34-»qter, 2pl4->pter, 6q25-»pter, 7q21-»pter, 18qll.2-»pter bölgelerinde DNA kopya sayısı artışı; 3pl2-»pter, 5ql2-»q23, 18q bölgelerinde DNA kopya sayısı yitimi gözlenmiştir. Her iki hücre hattında da 18q'da yitim, 18p'de artış saptanmıştır.

Özet (Çeviri)

ABSTRACT It is not always possible to characterize microscopic genetic changes in cancer cells in detail and to relate these changes with biological behavior of the tumors, since the genetic changes in tumor cell population can be very complex and heterogeneous for some cancer types. In this study, our aim was to characterize a breast carcinoma cell line (MDA-MB-468) and a colon carcinoma cell line (SW-480) in detail. G-banding, comparative genomic hybridization (CGH) and whole chromosome painting (wcp) approaches have been used in a combined manner. Although our findings based on G-banding analysis for SW-480 cell line are similar to the previous reports, combinatorial analysis has revealed that the marker belongs to chromosome 18 and there is copy number loss on the long arm of chromosome 18. CGH peek profiles has displayed the amplification of particular segments of the long arm of chromosome 7 and the der(7) chromosome was positive for wcp 7 probe. Thus, the anomaly reported as ins(7;?) previously in this cell line was in fact the duplication of certain segments of chromosome 7. The karyotype of this cell line was determined as: 57,X,+X,-Y,t(l;9) (q21;qll), +der(2)t(2;12) (q33;ql2), +der(3)del(3) (ql2), t(5;20) (ql5;pl2), +der(7)inv(7) (q22q36) t(7;14)(q22;q22),t(7;13)(q36;ql4),+7,der(8)t(8;?)(qll;?), +der(8) t(8;9) (qll;qll), der(10) t(3;10;12) (3qter-»3q21::12ql4-»12qll::10pl5 -> lOqter), +11, iso(12) (plO), +13, - 14, +17,del(18) (ql2),der(19)add(19)(ql3),+der(20) t(5;20) (ql5;pl2), +20, +marl, +mar2. The modal chromosome number was detected to be 59-61 in MDA-MB-468 cell line. Since the structural chromosomal changes were extremely complex in this cell line, the karyotype could not be resolved completely. In detection of the structure of marker chromosomes, G-banding and wcp were used in combination with CGH. CGH peek profile has revealed DNA copy number increase at lp34-»qter, 2pl4-»pter, 6q25-»pter, 7q21-»pter, 18qll.2-»pter regions and copy number decrease at 3pl2-»pter, 5ql2-»q23, 18q regions. Interestingly, short arm of the chromosome 18 was found to be over-represented and long arm of the chromosome 18 was under-represented in both cell lines.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    787411

    Salvıa argentea L. etanolik ekstraktının kimyasal kompozisyonu, in vitro ve in vivo anti-inflamatuvar aktivitesi ve toksisite potansiyeli

    In vitro and in vivo anti-inflammatory activities and toxicity potential of Salvia argentea L. ethanolic extract

    ALMONTHER ALHAMEDİ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    BiyolojiEge Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NEFİSE ÜLKÜ KARABAY YAVAŞOĞLU

  2. Tez No

    180645

    Gene expression profiling of hedgehog pathway genes in epithelial cancers

    Epitel kanserlerde hedgehog yolağı genlerinin gen ifade profili

    ÖZLEM AKILLI ÖZTÜRK

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2006

    Biyolojiİhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. IŞIK YULUĞ

  3. Tez No

    473770

    Trıcholoma anatolıcum H. H. dogan & ıntını mantarı üzerinde farmakognozik araştırmalar

    Pharmacognosic researches on tricholoma anatolicum H. H. dogan & intini mushroom

    ÇAĞLAYAN KOCAKAYA

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    Eczacılık ve FarmakolojiErciyes Üniversitesi

    Farmakognozi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MÜBERRA KOŞAR

  4. Tez No

    507313

    Functional analysis of transgelin in breast cancer

    Meme kanserinde transgelin geninin fonksiyonel analizi

    NAZLI DEĞER

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2018

    Biyolojiİhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. IŞIK YULUĞ

  5. Tez No

    553672

    Bazı yeni heterosiklik bileşiklerin sentezi, yapı aydınlatmaları, antikanser etki, bilgisayar destekli ilaç tasarım çalışmaları

    Synthesis, structure elucidation, chemotherapeutic activity, computer aided drug desing studies of some new heterocyclic compounds

    ÖZÜM ÖZTÜRK

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Eczacılık ve FarmakolojiAnkara Üniversitesi

    Farmasötik Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ESİN AKI-YALÇIN

Geri Dön