Production and characterization of a thermostable xylanase from a thermophilic soil bacterium
Isıya dayanıklı bir toprak bakterisinden ısıya dayanıklı ksilanaz üretimi ve karakterizasyonu
- Tez No: 116091
- Danışmanlar: DOÇ. DR. UFUK BAKIR, PROF. DR. TÜLİN GÜRAY
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Ksilanaz, termofilik bakteri, ısıya dayanıklı ksilanaz, fermentasyon optimizasyonu, biyokimyasal karakterizasyon. VI, Xylanase, thermophilic bacteria, thermophilic xylanase, fermentation optimization, biochemical characterization. IV
- Yıl: 2001
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 138
Özet
ÖZISIYA DAYANIKLI BİR TOPRAK BAKTERİSİNDEN ISIYA DAYANHCLI KSİLANAZ ÜRETİMİ VE KARAKTERİZASYONU Eyüboğlu, Banu Yüksek Lisans, Biyoteknoloji Bölümü Tez Yöneticisi: Doç. Dr. Ufuk Bakır Yardımcı Tez Yöneticisi: Prof. Dr. Tülin Güray Eylül 2001, 121 sayfa Kara bitkilerinin kuru ağırlıklarının %30'undan fazlasını oluşturan ksilan bitki hücre duvarında bulunan hemiselülozik polisakkaritlerin en sık rastlanan çeşididir. Ksilan depolimerizasyonu için en gerekli enzim olan P-1,4- endoksilanaz (EC 3.2.1.8), ksilanın yapısında bulunan iç glikozidik bağları parçalar.Bu çalışmada, ısıya dayanıklı bir toprak bakterisinden ısıya dayanıklı ksilanaz üretilmiş ve farklı lignoselülozik ziraii yan ürünlerin, azot kaynaklarının ve sıcaklığın enzim üretimi üzerine etkileri araştırılmıştır. En yüksek tekrarlanabilir enzim aktivitesi karbon kaynağı olarak %2 ksilan kullanıldığında 5.4 U/ml olarak elde edildi. Biyokimyasal karakterizasyon çalışmaları için ksilan 70% amonyum sülfat fraksiyonunda çöktürülmüş ve üç kat saflaştırma elde edilmiştir. Ksilanaz aktivitesi için optimum sıcaklık ve pH 75°C ve pH 7.7 olarak bulunmuştur. Enzim 50°C de 1 saat bekletildiğinde özgün aktivitesinin %90'ını korumuş, pH 9.5'te 1 saat bekletildiğinde aktivitesinin %22.5'ini kaybetmiştir. Kn, ve Vmax değerleri Lineweaver-Burk grafiğinden 20 mg ksilan/ml ve 8.9 umol ksiloz/dak.mg olarak bulunmuştur. %10 SDS-PAGE kullanılarak yapılan ölçümlerde ksilanazın moleküler ağırlığı 130 kDa olarak tahmin edilmiştir. Enzimin izoelektrik noktası ise 6.73 olarak bulunmuştur.
Özet (Çeviri)
ABSTRACT PRODUCTION AND CHARACTERIZATION OF A THERMOSTABLE XYLANASE FROM A THERMOPHILIC BACTERIUM Eyüboğlu, Banu M.S., Department of Biotechnology Supervisor: Assoc. Prof. Dr. Ufuk Bakır Co-supervisor: Prof. Dr. Tülin Güray September 2001, 121 pages Xylans are the most represented hemicellulosic polysaccharides found in the cell walls of land plants in which they may constitute more than 30% of the dry weight. p-l,4-endoxylanase (EC 3.2.1.8), crucial enzyme for general xylan depolymerization, cleaves internal glycosidic bonds within the xylan backbone. mIn this study, thermostable xylanases were produced by using a thermophilic soil bacterium and the effects of different lignosellulosicagricultural by-products, nitrogen sources and temperature on enzyme production were investigated. The highest reproducible enzyme activity was obtained as 5.4 U/ml when birchwood xylan was used as a carbon source. The highest reproducible enzyme activity was obtained as 5.4 U/ml when 2% birchwood xylan was used as a carbon source. For biochemical characterization studies, xylanases were precipated at 70% ammonium sulfate saturation and three fold purification was achieved. The optimum temperature and pH of the xylano lytic activity were found to be 75°C and pH 7.7, respectively. The enzyme retained around 90% of its original activity when it was incubated at 50°C for 1 h. The enzyme lost 22.5% of its activity at pH 9.5 for 1 h incubation. The Km and Vmax values were found as 20 mg xylan/ml and 8.9 umole xylose/min.mg from Lineweaver-Burk plot. The molecular weight of xylanase was estimated to be around 130 kDa by using 10% SDS-PAGE. Isoelectric point was determined as 6.73.
Benzer Tezler
- Cellulase-free alkaline xylanase enzim üreticisi Bacillus sp. suşlarının izolasyonu, enzim üretimi, karakterizasyonu ve biyoteknolojik kullanım olanaklarının araştırılması
Isolation of cellulase-free xylanase Bacillus sp. strains, enzyme production, characterization and investigation of biotechnological applications
ZELİHA NURDAN SARAÇOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2010
BiyoteknolojiÇukurova ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BURHAN ARIKAN
- Bacillus subtilis'ten termostabil lipaz üretimi ve karakterizasyonu
Production and characterization of a thermostable lipase from Bacillus subtilis
DENİZ TANRISEVER
Yüksek Lisans
Türkçe
2011
BiyoteknolojiÇukurova ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HATİCE KORKMAZ GÜVENMEZ
- Expression, purification and characterization of high-fidelity DNA polymerase
Yüksek-duyarlı DNA polimeraz enziminin üretilmesi, saflaştırılması ve karakterizasyonu
KÜBRA TÜRK
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
Biyoteknolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GİZEM DİNLER DOĞANAY
- Termofilik bakterilerden lipaz üretimi ve karakterizasyonu
Production and characterization of lipase by thermophilic bacteria
ALİ KOÇYİĞİT
- Termofilik geobacillus üyelerinin hücresiz süpernatantlarının antimikrobiyal etkilerinin taranması ve potansiyel bakteriyosin benzeri bir termostabil peptidin kısmi karakterizasyonu
Screening of antimicrobial effects of cell-free supernatants of members of thermophilic geobacillus and partial characterization of a potential bacteriocine-like a thermostable peptide
DENİZ ABACI
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
MikrobiyolojiAnkara ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ARZU ÇÖLERİ CİHAN