Polimeraz zincirleme reaksiyonu (PCR) ve floresans enerji transferi (FRET) yöntemleri kullanılarak mycobacterum tuberculosis suşlarında embB 306. kodon mutasyonu ile oluşan etambütol direncinin araştırılması
Investigation of embB codon 306 mutations in ethambutol resistant mycobacterium tuberculosis strains by polymerase chain reaction (PCR) and fluorescence resonance energy transfer (FRET) methods
- Tez No: 118441
- Danışmanlar: PROF. DR. AYFER GÜNALP
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: M. tuberculosis, etambütol, direnç, embB, real-time PCR, M. tuberculosis, ethambutol, resistance, embB, real-time PCR
- Yıl: 2002
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
V ÖZET Yurdakul, P. Polimeraz Zincirleme Reaksiyonu (PCR) ve Floresans Rezonans Enerji Transferi (FRET) yöntemleri kullanılarak Mycobacterium tuberculosis suşlarında embB 306. kodon mutasyonu ile oluşan etambütol direncinin araştırılması. Hacettepe Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Mikrobiyoloji Yüksek Lisans Tezi. Ankara, 2002. Mycobacterium tuberculosis, dünya genelinde tek başına ölüme sebebiyet veren en önemli enfeksiyöz ajandır. Dünya nüfusunun yaklaşık üçte biri Mycobacterium tuberculosis ile enfektedir. AİDS epidemisi ve bir ya da birden çok antimikobakteriyel ilaca dirençli Mycobacterium tuberculosis izolatlarındaki artış, hastalığı yeniden önemli bir halk sağlığı problemi haline getirmiştir. Tüberkülozu kontrol altına almanın en etkin yolu, hastalığın ve dirençli suşların, kolay ve erken tanısından geçmektedir. Geleneksel yöntemler ile ilaç duyarlılığının belirlenmesinin uzun zaman aldığı göz önünde bulundurulduğunda, direncin hızlı saptanmasında kullanılacak moleküler yöntemler çok değerlidir. Bu çalışmada, etambütole direnç gösteren Mycobacterium tuberculosis suşlarında en sık rastlanan mutasyon olan embB geni 306. kodon mutasyonları, PCR- FRET yöntemi kullanılarak araştırılmıştır. FRET probları yardımı ile, embB geni mutasyonlarının %63.4'ü başarılı bir şekilde 306. kodon mutasyonu olarak saptanabilmiştir. FRET probları ile mutasyonların hızlı bir şekilde saptanması sadece ilacın gereksiz yere kullanılarak yan etkilerini göstermesini engellemek ile kalmayıp, tedavi rejiminin uygun zamanda değiştirilmesi için de güçlü bir belirleyici olabilecektir.
Özet (Çeviri)
VI ABSTRACT Yurdakul, P. Investigation of embB codon 306 mutations in ethambutol resistant Mycobacterium tuberculosis strains by Polymerase Chain Reaction (PCR) and Fluorescence Resonance Energy Transfer (FRET) methods. Hacettepe University Health Sciences Institute, Ms. Thesis in Microbiology. Ankara, 2002. Mycobacterium tuberculosis is the greatest single infectious cause of mortality worldwide. Estimates indicate that one third of the world population is infected with Mycobacterium tuberculosis. The synergy between tuberculosis and the AIDS epidemic and the surge of multi-drug resistant clinical isolates of Mycobacterium tuberculosis have reaffirmed the disease as a primary public health threat. The effective, easy and early diagnosis of tuberculosis and resistant strains remains the most efficient way to control the disease. Given the long turn around times required to complete conventional antituberculosis drug susceptibility testing, molecular detection methods are of tremendous value in the rapid detection of drug resistance. In this study, the most frequent mutation, embB codon 306, leading to ethambutol resistance in Mycobacterium tuberculosis strains was investigated by PCR-FRET. With the help of FRET probes, %63.4 of embB mutations were successfully identified as embB codon 306 mutations. This method takes less than two hours and it is easy to perform. An early detection of ethambutol resistance with FRET probes would not only abolish risks of adverse reactions of the drug, it would also give a strong indication for the need of a modification of the therapy regimen.
Benzer Tezler
- Mycobacterium tuberculosis suşlarında rpsL 43. kodon mutasyonu ile oluşan streptomisin direncinin polimeraz zincirleme reaksiyonu ve floresans rezonans enerji transferi kullanılarak hızlı şekilde saptanması
Rapid detection of streptomycin resistance associated with rpsL codon 43 mutation in mycobacterium tuberculosis strains by using polymerase chain reaction and fluorescence resonance energy transfer
E. NİGAR ERDEM
- Erken çocukluk çağı çürüklerinde farklı remineralizasyon ajanlarının antibakteriyel ve remineralizasyon etkisinin incelenmesi
Investigation of antibacterial and remineralization effects of different remineralization agents on early childhood caries
CEREN ÖZŞAHİN
Diş Hekimliği Uzmanlık
Türkçe
2020
Diş HekimliğiMarmara ÜniversitesiPedodonti Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. FİGEN EREN GİRAY
- Bronkoalveolar lavaj (BAL) ve bronşial lavaj (BL) yapılan hastalardaki pneumocystis jirovecii kolonizasyonu ve tanıda kullanılan yöntemlerin karşılaştırması
The pneumocystis jirovecii colonization in bronchoalveolar lavage (BAL) and bronchial washing and the comparasion of methods which are used in diagnosis.
AHMET ÖZMEN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2011
Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiUludağ ÜniversitesiEnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. REŞİT MISTIK
- Pneumocystis jirovecii'nin kantitatif PCR yöntemi ile tanımlanması ve diğer tanı yöntemleri ile karşılaştırılması
Detection of pneumocystis jirovecii BY quantitative pcr and comparison with other diagnostic methods
TUBA SEYHAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
MikrobiyolojiSelçuk ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. DUYGU FINDIK
- Ege Bölgesindeki glukoz-6-fosfat dehidrogenaz (G6PD) eksikliğine yol açan Akdeniz mutasyonunun DNA teknolojisi ile araştırılması
Screening of G6PD Mediterranean mutation causing to severe glucose-6-phosphate dehydrogenase deficiency in the aegean region by using DNA technology
SELİM UZUNOĞLU
Doktora
Türkçe
1995
Tıbbi BiyolojiDokuz Eylül ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
PROF.DR. ORHAN TERZİOĞLU