Geri Dön

Patates kahverengi çürüklük hastalığı etmeni Ralstonia solanacearum (ırk-3)'un tespit yöntemlerinin karşılaştırılması

Comparison of detection methods of potato brown rot disease organism Ralstonia solanacearum (race-3)

  1. Tez No: 131440
  2. Yazar: MERİÇ ÖZAKMAN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. SALİH MADEN
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Ziraat, Agriculture
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2003
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ankara Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Bitki Koruma Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 53

Özet

ÖZET Doktora Tezi PATATES KAHVERENGİ ÇÜRÜKLÜK HASTALIĞI ETMENİ Ralstonia solanacearum ORK-3)' UN TESPİT YÖNTEMLERİNİN KARŞILAŞTIRILMASI Meriç ÖZAKMAN Ankara Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Bitki Konuna Anabilim Dalı Danışman: Prof. Dr. Salih MADEN Kahverengi Çürüklük Hastalığı etmeni Ralstonia solanacearum çoğunlukla latent olarak tohumluk patateslerle taşınmaktadır. Hastalıkla mücadelede ilk adım etmenden ari tohumluk patates kullanılmasıdır. Bu nedenle de tespit yöntemlerinin hassasiyet seviyeleri çok önem taşımaktadır. Bu çalışma kapsamında IFAS ve ELISA gibi çok kullanılan tespit yöntemleri karşılaştırılmıştır. Ayrıca, yeni dizayn edilen primer ve prob kullanılarak yeni bir Real Time PCR yöntemi de tarif edilmiştir.. R. solanacearum eklenmiş patates ekstraktlarının kullanılması sonucunda IFAS' in tespit seviyesi 8xl04 hücre/ml olarak belirlenmiştir. Yapay olarak inokule edilmiş patates bitkilerinden elde edilen ve hastalık belirtisi göstermeyen patates yumrularından ise yine IFAS ile 3,7x1ü3 hücre/ml tespit edilebilmiştir. IFAS ile karşılaştırıldığında ELISA daha düşük hassasiyete sahip olmuştur. IACR-278 poliklonal antiserum kullanılarak yapılan indirekt ELISA ile 105 hücre/ml bakteri içeren patates homejenatından pozitif sonuç alınabilmiştir. Ancak hastalık belirtisi göstermeyen yumrulardan pozitif sonuç elde edilememiştir. Hastalık belirtisi göstermeyen ve serin iklim şartlarına adapte olmuş R. solanacearum ırk 3 (biovar 2)' un Bio-PCR ile tespiti için bu çalışmada yeni dizayn edilen RealTime PCR primerleri ve prob tan çok hassas sonuç elde edilmiştir. Bakteri ilave edilmiş patates ekstraktından 30 hücre/ml bakteriyi tespit etmek mümkün olmuştur. Hastalık belirtisi göstermeyen 14 patates yumrusundan 2 tanesinde bu çalışmada tarif edilen RealTime Bio-PCR ile pozitif sonuç alınabilmiştir. 2003, 44 sayfa ANAHTAR KELİMELER: Patates, Kahverengi Çürüklük, Ralstonia solanacearum, RealTime PCR, Bio-PCR, IFAS, ELISA

Özet (Çeviri)

ABSTRACT Ph.D. Thesis COMPARISON OF DETECTION METHODS OF POTATO BROWN ROT DISEASE ORGANISM, Ralstonia solanacearum (RACE-3) Meriç ÖZAKMAN Ankara University Graduate School of Natural and Applied Sciences Department of Plant Protection Supervisor: Prof. Dr. Salih MADEN Ralstonia solanacearum, the causal agent of brown rot of potato, is often carried latently in seed potato tubers. The first step for controlling of disease is having pathogen free seed potatoes. Therefore, the sensitivity of the detection method is very important. Some of the detection methods were compared in this study such as IFAS and ELISA. Additionally a new method was described using newly designed RealTime primers and probe. In R. solanacearum spiked potato extracts, the detection level of IFAS was 8xl04 cell/ml. Using the potato extract yielded from artificially inoculated potato plants and having no symptom of disease, 3,7xl03 cell/ml could be detected by IFAS. ELISA had a lower sensitivity compared to IFAS and a positive result from the suspension from a potato homogenate containing 105 cells/ml was obtained using IACR-278 polyclonal antiserum. However no positive result from symptomless potato tubers was obtained. RealTime PCR primers and a probe designed in this study are highly sensitive in BIO-PCR assay for specific detection of the cool climate adapted race 3, biovar (bv) 2 strain of R. solanacearum in asymptomatic potato tubers. Using undiluted potato tuber extract spiked with R. solanacearum bv-2, as few as 30 cells/ml extract could be detected. Two of 14 naturally infected potato tubers with no disease symptoms were positive by the newly described real-time BIO-PCR assay whereas none was positive with a standard RealTime PCR assay. 2003, 44 pages KEY WORDS: Potato, Brown Rot, Ralstonia solanacearum, RealTime PCR, Bio-PCR, IFAS, ELISA

Benzer Tezler

  1. Development of evagreen real-time PCR assay for the molecular identification of potato brown rot disease causing agent R. solanacearum

    Patateste kahverengi çürüklük hastalığına sebep olan R. solanacearum'un moleküler tanısının evagreen gerçek-zamanlı PZR yöntemiyle geliştirilmesi

    ZEHRA EKİNCİ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2014

    BiyomühendislikFatih Üniversitesi

    Genetik ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MUSTAFA FATİH ABASIYANIK

  2. Patateste kahverengi çürüklük hastalığı etmeni Ralstonia solanacearum'un endofitik bakterilerle biyolojik mücadele olanaklarının araştırılması

    Investigations of biological control facilities of potato brown rot disease caused by Ralstonia solanacearum using endopyhtic bacteria

    NEZİHA GÜVEN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    ZiraatEge Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HATİCE ÖZAKTAN

  3. Konya ve Karaman illerindeki önemli patates ekim alanlarında karşılaşılan fungal ve bakteriyel hastalıkların belirlenmesi

    Determination of fungal and bacterial diseases encountered in major potato fields in Konya and Karaman provinces

    OSMAN TOKETTİ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    ZiraatHatay Mustafa Kemal Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SONER SOYLU

  4. Patateste bakteriyel halka çürüklüğü (Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus), bakteriyel solgunluk ve kahverengi çürüklük (ralstonia solanacearum) etmenlerinin tespit yöntemleri üzerinde araştırmalar

    Studies on the detection methods of bacterial ring rot (Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus), bacterial wilt, and brown rot (Ralstonia solanacearum) pathogens on potato

    DUYGU YILDIZ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    ZiraatAydın Adnan Menderes Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. KEMAL BENLİOĞLU