Development of evagreen real-time PCR assay for the molecular identification of potato brown rot disease causing agent R. solanacearum
Patateste kahverengi çürüklük hastalığına sebep olan R. solanacearum'un moleküler tanısının evagreen gerçek-zamanlı PZR yöntemiyle geliştirilmesi
- Tez No: 392419
- Danışmanlar: DOÇ. DR. MUSTAFA FATİH ABASIYANIK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyomühendislik, Biyoteknoloji, Ziraat, Bioengineering, Biotechnology, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2014
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Fatih Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Genetik ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 77
Özet
Ralstonia solanacearum, bitkilerde bakteriyel solgunluk olarak bilinen hastalığa yol açan toprakta ve suda yaşayan bir bakteri türüdür. Yaklaşık 50 botanik aileye mensup 200 bitki türünü etkilemektedir. Oldukça geniş yelpazedeki konukçular arasında süs bitkilerinden tarımda önemli olan ürünlere (patates, domates, patlıcan, tütün ve muz gibi) kadar birçok bitki türü bulunmaktadır. Bakteriyel solgunluk agresifliği, geniş coğrafi dağılımı ve alışmışın dışında geniş konukçu aralığından dolayı en yıkıcı bitki hastalıkları arasında yer almaktadır. R. solanacearum birçok Avrupa ülkesinde karantina etmeni olarak listeye dahil edilmiştir (OEPP / EPPO, 2004). Amerika'da da 2002 biyoterörizm yasasına göre seçkin ajan sayılmıştır. Özellikle, soğuk iklimlerde dahi yaşamını sürdürebilen ve patateste kahverengi çürüklük hastalığına neden olan R. solanacearum PIIB-1(Şilotip IIB, sekvar 1 [eski adıyla; ırk 3 biyovar 2]) suşu, patates endüstrisi için büyük bir tehdit olarak görülmektedir. Sadece patatesteki kahverengi çürüklük hastalığı, dünya genelinde yılda yaklaşık 950 milyon dolar zarara yol açmaktadır. Şimdiye kadar, kahverengi çürüklük hastalığı ülkemizin farklı bölgelerinde de görülmüştür. Bu projede hızlı ve ekonomik teknik olan EvaGreen gerçek-zamanlı PZR yöntemi geliştirilmiştir. Bu tekniğin R. solanacearum'u erken ve kesin teşhis ederek, patojenin ülkeye girişini ve yayılımını önleyecek tedbirlerin alınmasında yardımcı olabileceği düşünülmektedir.
Özet (Çeviri)
Ralstonia solanacearum is a soil-borne and water-borne gram-negative bacterium which causes bacterial wilt disease on more than 200 plant species from 50 botanical families including ornamental plants and essential crops such as potato, tomato, eggplant, pepper, tobacco and banana. Bacterial wilt is considered one of the most destructive bacterial plant diseases due to its severe aggressiveness, worldwide geographic distribution, and unusual wide host range. R. solanacearum has been listed as a quarantine organism in Europe (OEPP/EPPO, 2004) and a Select Agent in the USA according to the Agricultural Bioterrorism Protection Act of 2002. Especially the strain phylotype IIB, sequevar 1 (historically known as; race 3 biovar 2), mainly infects potato, can survive at cooler climates and is considered as a serious threat to potato industry. Bacterial wilt of potato causes approximately $950 million losses in each year worldwide. To date, there have been several confirmed outbreaks of brown rot disease caused by R. solanacearum PIIB-1 in Turkey. We have developed a rapid, reliable and cost effective EvaGreen-based quantitative real-time PCR assay for R. solanacearum. This technique enables early and accurate detection of the bacteria that will be useful to prevent the disease dissemination by eliminating introduction of the quarantine pathogen into the country.
Benzer Tezler
- Development of fast and economic QPCR-based method for meat species detection
Hızlı ve ekonomik et tür tayini için QPCR tabanlı bir yöntem geliştirilmesi
EDA ÇİFTÇİ
Yüksek Lisans
İngilizce
2013
Genetikİstanbul Teknik ÜniversitesiBiyoloji Bölümü
DOÇ. DR. GİZEM DİNLER DOĞANAY
DR. MUSTAFA KOLUKIRIK
- Gıda patojenlerinin tespiti için floresan temelli ekonomik DNA test yöntemlerinin geliştirilmesi
Development of economical flourescence based DNA test methods for foodborne pathogen detection
AHMET KAYNAK
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
BiyomühendislikÇanakkale Onsekiz Mart ÜniversitesiBiyomühendislik ve Malzeme Mühendisliği Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ERGÜN ŞAKALAR
- Development of a fast simple profiling methodfor sample screening using HRM of Y-STRs
Y-STR'lerin yüksek çözünürlük erime (HRM) tekniği kullanılarak örnek tarama için hızlı ve basit profilleme yöntemi geliştirilmesi
HATİCE NUR AYDIN
Yüksek Lisans
İngilizce
2015
Adli TıpFatih ÜniversitesiGenetik ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MUSTAFA FATİH ABASIYANIK
- Kuzeydoğu Karadeniz bölgesi doğal odunsu taksonlarının peyzaj mimarlığı yönünden değerlendirilmesi üzerine araştırmalar
Başlık çevirisi yok
MUSTAFA VAR
Doktora
Türkçe
1992
Peyzaj MimarlığıKaradeniz Teknik ÜniversitesiPeyzaj Mimarlığı Ana Bilim Dalı
PROF.DR. SÜMER GÜLEZ