Bazı zeytin klonlarında RAPD markerleri kullanılarak genetik ilişkinin belirlenmesi
Determination of genetic diversity from some olive cultivar using RAPD markers
- Tez No: 131620
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. FERAY KÖÇKAR
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2003
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Balıkesir Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 81
Özet
Zeytin ağacı {Olea europaea L.) temelde Akdeniz bölgesinde bulunan kültüre alınmış bir bitkidir. Edremit, zeyincilik ve zeytinyağı üretimi açısından Türkiye'de en önemli bölgelerden birisidir. Bölgede sayısız kültüre alınmış zeytin klordan bulunmakta ve bunların büyük çoğunluğunun morfolojik olarak ayırımı yapılamamaktadır. Bu yüzden, moleküler markerların kullanımı özellikle zeytin klonlanım ayırt edilmesi ve genetik ilişkilerinin belirlenmesi açısından gereklidir. Bu çalışmada, Edremit Zeytincilik Fidan Üretme Merkezinden elde edilen zeytin klordan arasındaki genetik ilişki RAPD-PCR tekniği kullanılarak incelenmiştir. RAPD markerleri bitki türleri ve diğer organizmalar arasındaki genetik ilişkiyi belirlemede kullanılan bir teknikdir. Fakat bitkilerden yüksek saflıkda DNA izolasyonu, farklı bitkilerin yüksek düzeyde polisakkarit ve polifenolik bileşikler içerdikleri için zordur. Bu yüzden, farklı yöntemler kullanılarak RAPD-PCR için uygun olabilecek modifiye DNA izolayon yöntemi geliştirildi. En iyi reaksiyon koşullanın belirlemek amacıyla RAPD-PCR reaksiyonları optimize edildi. Farklı zeytin klonlanmn modifiye prosedürle elde edilen DNA' lan ve 9 farklı 10 bazlık primer kullanılarak RAPD-PCR reaksiyonlan gerçekleştirildi. Jel elektroforezi sonucunda elde edilen amfiliye edilen bantlar arasında var ve yok olan bantlar değerlendirildi. Zeytin klordan arasında genetik ilişkinin belirlenmesi içinde ayrıca Pairwise Distance analiz de yapıldı ve UPGMA algoritması kullanılarak bir fenogram oluşturuldu.ANAHTAR SÖZCÜKLER: Olea europaea, Türkiye, Zeytin, RAPD, genetik çeşitlilik.
Özet (Çeviri)
Olive tree (Olea europaea L.) is a cultivated plant mainly localized in Mediterranean region. Edremit is one of the most important regions in Turkey for the production of olive and oil olive oils. There are numerous cultivars in the region, which most of them cannot be identified by phenotypic markers. Therefore, the use of the molecular markers is required for identification and genetic relationship for the olive clones. In this study, genetic relationships of six olive clones obtained from Edremit Olive Germplasm Center were investigated using RAPD markers. Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD)-PCR is a technique that can distinguish the genetic relationship amongst plant species and other organisms. However, isolation of high quality DNA from plant is difficult due to high level of polysaccharides and other substances that can interfere particularly RAPD-PCR reactions. Therefore, the genomic DNA suitable for RAPD-PCR reaction was optimized using different methods. The RAPD-PCR reaction parameters were optimized in order to obtain the best reaction conditions. The genomic DNA of different olive clones obtained from a modified procedure were subjected to RAPD PCR reaction using nine 10-mer primers. The absence and presence of the bands have been determined amongst the amplified patterns obtained from agarose gel electrophoresis. Pairwise Distance analysis have been also performed in order to evaluate the genetic relationship between olive clones and fenogram has been obtained using UPGMA algorithms.KEY WORDS: Olea Europaea, Turkey, Olive, RAPD, genetic diversity.
Benzer Tezler
- Bazı önemli muz klonlarının doku kültürü yöntemi ile çoğaltılması ve klonlar arasındaki varyasyonların biyoteknolojik yöntemlerle saptanması üzerinde araştırmalar
Investigations propagation of some important banana clones by tissue culture and determination of variations among clones by biotechnological methods
HAMİDE GÜRBÜK
- Yeni bazı muz çeşit ve klonlarında fenolojik ve pomolojik özellikler ile bitki besin maddeleri ve hormonların dönemsel değişimlerinin belirlenmesi
Determination of phenological and pomological features and seasonal changes of nutrient and hormones in some new banana clones
DİLEK GÜVEN
- Gemlik zeytini klonları ve bazı melez tiplerin morfolojik özelliklerinin belirlenmesi
Morphological characterization of 'Gemlik' clones and some hybrid types
KÜBRA ÖZER
- Mudanya mübadilleri, ekonomik ve sosyal uyumları
Mudanya exchanges economic and social cohesion
HATİCE AYSER SOĞUKSU
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
TarihYeditepe ÜniversitesiAtatürk İlkeleri ve İnkılap Tarihi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. TÜLAY ALİM BARAN
- Mudanya'da kentleşme süreci ve kentsel gelişimi etkileyen faktörler
Factors affecting urbanization process and urban development in Mudanya
SİNAN ALBAYRAK