Statistical optimization of the production of TagI endonuclease by recombinant E. coli cells using response surface methodology
Rekombinant E. coli hücrelerinde TagI endonükleaz üretiminin yanıt yüzeyi yöntemi kullanılarak istatistiksel eniyilemesi
- Tez No: 139464
- Danışmanlar: PROF. DR. BETÜL KIRDAR, YRD. DOÇ. DR. RAMAZAN YILDIRIM
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Kimya Mühendisliği, Chemical Engineering
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2003
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Boğaziçi Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Kimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
VI ÖZET REKOMBİNANT.E. coli HÜCRELERİNDE Taql ENDONÜKLEAZ ÜRETİMİNİN YANIT YÜZEYİ YÖNTEMİ KULLANILARAK İSTATİSTİKSEL ENİYİLEMESİ Bu çalışmada, besiyeri ortamını oluşturan bileşenlerin, Taql endonükleaz genini taşıyan rekombinant E. coli BL21 konakçı hücrelerinin biyokütle konsantrasyonuna etkileri, Yanıt Yüzeyi Yöntemi kullanılarak incelenmiştir. İkinci derece polinominal model kurmak üzere, merkezi kompozit dönel tasanm ilkesine uyan 29 deney yapılmıştır. Optimum besiyeri bileşimi 15 g/L glikoz, 6.6 g/L di-ammonyum hidrojen fosfat, 20.12 g/L potassyum di-hidrojen fosfat, ve 1.7 g/L of magnezyum sülfat olarak bulunmuştur. Oluşması beklenen biyokütle miktarı 2.720 gram kuru biyokütle/L olarak öngörülmüştür. Bu koşullarda, deneysel olarak 2.680 gram kuru biyokütle/L saptanmıştır. Sonuç olarak önerilen ikinci derece model denklemin sistemi iyi bir şekilde temsil ettiği belirlenmiştir. Besiyeri bileşiminin, kontrollü Taql endonükleaz üretimi üzeirndeki etkileri de aynı istatistiksel tasanm kullanılarak incelenmiştir. Optimum besiyeri bileşimi 6 g/L glikoz, 1.5 g/L di-ammonyum hidrojen fosfat, 8 g/L potassyum di-hidrojen fosfat, ve 0.8 g/L of magnezyum sülfat olarak bulunmuştur. Modelin öngördüğü enzim verimi (179.2*106 U/gram kuru biyokütle) ile deneysel bulguların (178.03 U/ gram kuru biyokütle) uyum içinde olduğu gözlenmiştir. Bu sonuçlar da göstermiştir ki, besiyerini oluşturan etmenlerin, fermentasyon karakteristiği üzerinde önemli bir etkisi vardır ve bu etki ikinci derece bir polinom ile ifade edilebilir. Ayrıca, maksimum biyokütle miktarı için ve maksimum enzim verimi için eniyilenen besiyeri bileşimi çalışılan deneysel alanda birbirinden farklıdır.
Özet (Çeviri)
ABSTRACT STATISTICAL OPTIMIZATION OF THE PRODUCTION OF Taql ENDONUCLEASE BY RECOMBINANT E. coli CELLS USING RESPONSE SURFACE METHODOLOGY In this study, the investigation of the design and optimization of the medium components on biomass concentration of recombinant E. coli cells carrying a plasmid encoding Taql endonuclease, were performed using Response Surface Methodology. 29 experiments according to central composite rotatable design (CCR Design) are conducted to construct a second order polynomial. Optimum medium composition were found as 15 g/L glucose, 6.6 g/L di-ammonium hydrogen phosphate, 20.12 g/L potassium di-hydrogen phosphate, and 1.7 g/L of magnesium sulfate, yielding a theoretical maximum biomass concentration of 2.720 gDCW/L. This result was experimentally validated as 2.680 gDCW/L indicating that the proposed second order model equation was adequately representing the system. The effects of medium composition on the controlled production of Taql endonuclease by the same system were also studied using the same statistical design. Optimum medium composition was found as: 6g/L glucose, 1.5 g/L di-ammonium hydrogen phosphate, 8g/L potassium di-hydrogen phosphate and 0.8g/L magnesium sulfate. The model prediction (179.2*106 U/gDCW) and the results of the validation experiment (178.03*106 U/gDCW) were also in close agreement. It was concluded that the medium components have a considerable effect on fermentation characteristics and mis effect could be modeled as a second order polynomial. It was also found that the optimum compositions for biomass concentration and enzyme yield were not the same within the experimental range studied.
Benzer Tezler
- Yapay sinir ağı tekniği kullanılarak polipropilen BCF ipliklerinin uzama, mukavemet ve kıvrımlılık değerlerinin tahminlemesi: Tekstil sektöründe bir uygulama
Estimation of the elongation, tensile strength and crimp values of polypropylene BCF yarns by using artificial neural network technique: An application in textile sector
EMİNE ÇOT
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
Endüstri ve Endüstri MühendisliğiOsmaniye Korkut Ata ÜniversitesiYönetim Bilişim Sistemleri Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ EMRE YAKUT
- Sayısal haritalama teknikleri kullanılarak DNA dizilimleri üzerinden lösemi hastalığının temel türlerinin yapay zeka tabanlı algoritmalar ile sınıflandırılması
Classification of main types of leukemia disease with artificial intelligence-based algorithms on the DNA sequences using digital mapping techniques
FATMA AKALIN
Doktora
Türkçe
2023
Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve KontrolSakarya ÜniversitesiBilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NEJAT YUMUŞAK
- An ensemble learning model for wide-area measurement based transient stability assessment in power systems
Güç sistemlerinde geniş alan ölçümlerine dayalı geçici hal kararlılık değerlendirmesi için bir topluluk öğrenme modeli
CAN BERK SANER
Yüksek Lisans
İngilizce
2019
Elektrik ve Elektronik Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiElektrik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. VEYSEL MURAT İSTEMİHAN GENÇ
- Patates kabuklarından izole edilen Priestia megaterium sfa ile amilaz üretiminin istatistiksel optimizasyonu, amilazın karakterizasyonu ve deterjan endüstrisi ile nanopartikül sentezinde potansiyel uygulamaları
Statistical optimization of amylase production by Priestia megaterium sfa isolated from potato peels, characterization of amylase and potential applications in the detergent industry and nanoparticle synthesis
FATMA AKBAŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
BiyolojiAtatürk ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SÜMEYRA GÜRKÖK
DOÇ. DR. MURAT ÖZDAL
- Dokunmuş havlu kumaşların üretim parametreleri ve performans özelliklerinin optimizasyonu
Optimization of the production parameters and performance properties of woven towels
BELKIS ZERVENT ÜNAL
Doktora
Türkçe
2007
Tekstil ve Tekstil MühendisliğiÇukurova ÜniversitesiTekstil Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF.DR. ERDEM KOÇ