Genetic polymorphisms of alcohol inducible CYP2E1 in Turkish population
Türk popülasyonunda alkol ile indüklenebilen CYP2E1 genetik polimorfizmi
- Tez No: 153667
- Danışmanlar: PROF. DR. ORHAN ADALI, PROF. DR. EMEL ARINÇ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyokimya, Biochemistry
- Anahtar Kelimeler: SitokromP4502El, genetik polimorfizm, Türkiye popülasyonu, C-1019T / G-1259C, T7678 tek bazlık polimorfızmler, RsaVPstI RFLP, Dral RFLP. vı, SitokromP4502El, genetik polimorfizm, Türkiye popülasyonu, C-1019T / G-1259C, T7678 tek bazlık polimorfızmler, RsaVPstI RFLP, Dral RFLP. vı
- Yıl: 2004
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyokimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 138
Özet
oz Türkiye populasyonunda alkol ile induklenebelen cyp2ei genetik polimorfizmi ULUSOY, Gülen Yüksek Lisans, Biyokimya Bölümü Tez Yöneticisi: Prof. Dr. Orhan ADALI Yardımcı Tez Yöneticisi: Prof. Dr. Emel ARINÇ Ocak, 2004, 123 sayfa Sitokrom P450 süperailesinin etanol ile indüklenebilen izoformu olan sitokrom P4502E1 (CYP2E1); etanol, aseton, asetaminofen ve klorzokzazon gibi ilaçlar, pek çoğu kanserojen olan endüstriyel çözücüler (benzen ve stiren gibi ) de dahil olmak üzere düşük moleküler ağırlıklı pek çok endojen ve egzojen maddeleri katalize eder. Bunun yanısıra CYP2E1, reaktif oksijen türlerinin oluşmasında da etkindir. Bu izoform, etanol ve izoniazid gibi maddeler ve diyabet ve açlık gibi bazı patofizyolojik durumlarda indüklenir. CYP2E1 geni, kimyasallarla indüklenen kanser gibi pek çok hastalığa maruz kalma riskinde gözlemlenen bireyler arası değişkenlikte etkili olduğu düşünülen genetik polimorfızmler göstermektedir. CYP2E1 polimorfızm frekanslarının çeşitli etnik ve ırksal gruplar arasında değişkenlik gösterdiği kanıtlanmıştır. Bu çalışmada da, önemli iki CYP2E1 polimorfizminin; genin 5'- ucundaki C-1019T / G-1259C ve intron 6'daki T7678A tek bazlık polimorfızmlerinin, Türkiye popülasyonundaki frekansı belirlenmiştir. Bu amaç doğrultusunda, Türkiye popülasyonunu temsil eden 132 sağlıklı gönüllüden kan örnekleri toplanmış ve bu örneklerden genomik DNA parçalanmamış halde izoleedilmiştir. Genotipler, bahsedilen bölgelerin polimeraz zincir reaksiyonu ile çoğaltılmasıyla elde edilen gen fragmanlarının, restriksiyon endonükleazlar Rsal, Pstl (C-1019T / G-1259C polimorfızmleri için) ve Dral (T7678A polimorfızmi için) ile kesilmesiyle belirlenmiştir. C-1019T / G-1259C tek bazlık polimorfızmleri yeni jenerasyonlara birbirlerine bağlı olarak aktarılırlar. Bu polimorfızmi erin genotipi 116 DNA örneği için belirlenmiştir ve frekans dağılımı homozigot yabanıl (cl/cl) genotip için %97,4, heterozigot (cl/c2) genotipi için %2,6 ve homozigot mutant (c2/c2) genotipi için %0,0 olarak bulunmuştur. Buna denk düşen alel frekansları yabanıl alel (el) için %98,7 ve mutant alel (c2) için %1,3 olarak hesaplanmıştır. T7678A tek bazlık polimorfızmin genotipi 108 DNA örneği için belirlenmiştir ve genotip frekansları homozigot yabanıl (DD) için %80,6, heterozigot (CD) için %19,4 ve homozgiot mutant (CC) için %0,0 olarak bulunmuştur. Yabanıl (D) alel frekansı %90,3, mutant (C) alel frekansı da %9,7 olarak hesaplanmıştır. Her iki polimorfik bölgenin genotip frekans dağılımının Hardy- Weinberg denklemine uygun olduğu, ve cinsiyete bağımlı bir farklılık göstermediği bulunmuştur. Bu çalışmada belirlenen her iki polimorfızmin genotipik dağılımı, Fransız, İsveç, Alman ve İtalyan gibi diğer Kafkas popülasyonlarıyla Ki-kare testi (x2-testi) uygulanarak karşılaştırıldığında önemli bir farklılık göstermezken, Şili, Japon, Tayvan ve Çin popülasyonlarından önemli derecede farklılık göstermiştir.
Özet (Çeviri)
oz Türkiye populasyonunda alkol ile induklenebelen cyp2ei genetik polimorfizmi ULUSOY, Gülen Yüksek Lisans, Biyokimya Bölümü Tez Yöneticisi: Prof. Dr. Orhan ADALI Yardımcı Tez Yöneticisi: Prof. Dr. Emel ARINÇ Ocak, 2004, 123 sayfa Sitokrom P450 süperailesinin etanol ile indüklenebilen izoformu olan sitokrom P4502E1 (CYP2E1); etanol, aseton, asetaminofen ve klorzokzazon gibi ilaçlar, pek çoğu kanserojen olan endüstriyel çözücüler (benzen ve stiren gibi ) de dahil olmak üzere düşük moleküler ağırlıklı pek çok endojen ve egzojen maddeleri katalize eder. Bunun yanısıra CYP2E1, reaktif oksijen türlerinin oluşmasında da etkindir. Bu izoform, etanol ve izoniazid gibi maddeler ve diyabet ve açlık gibi bazı patofizyolojik durumlarda indüklenir. CYP2E1 geni, kimyasallarla indüklenen kanser gibi pek çok hastalığa maruz kalma riskinde gözlemlenen bireyler arası değişkenlikte etkili olduğu düşünülen genetik polimorfızmler göstermektedir. CYP2E1 polimorfızm frekanslarının çeşitli etnik ve ırksal gruplar arasında değişkenlik gösterdiği kanıtlanmıştır. Bu çalışmada da, önemli iki CYP2E1 polimorfizminin; genin 5'- ucundaki C-1019T / G-1259C ve intron 6'daki T7678A tek bazlık polimorfızmlerinin, Türkiye popülasyonundaki frekansı belirlenmiştir. Bu amaç doğrultusunda, Türkiye popülasyonunu temsil eden 132 sağlıklı gönüllüden kan örnekleri toplanmış ve bu örneklerden genomik DNA parçalanmamış halde izoleedilmiştir. Genotipler, bahsedilen bölgelerin polimeraz zincir reaksiyonu ile çoğaltılmasıyla elde edilen gen fragmanlarının, restriksiyon endonükleazlar Rsal, Pstl (C-1019T / G-1259C polimorfızmleri için) ve Dral (T7678A polimorfızmi için) ile kesilmesiyle belirlenmiştir. C-1019T / G-1259C tek bazlık polimorfızmleri yeni jenerasyonlara birbirlerine bağlı olarak aktarılırlar. Bu polimorfızmi erin genotipi 116 DNA örneği için belirlenmiştir ve frekans dağılımı homozigot yabanıl (cl/cl) genotip için %97,4, heterozigot (cl/c2) genotipi için %2,6 ve homozigot mutant (c2/c2) genotipi için %0,0 olarak bulunmuştur. Buna denk düşen alel frekansları yabanıl alel (el) için %98,7 ve mutant alel (c2) için %1,3 olarak hesaplanmıştır. T7678A tek bazlık polimorfızmin genotipi 108 DNA örneği için belirlenmiştir ve genotip frekansları homozigot yabanıl (DD) için %80,6, heterozigot (CD) için %19,4 ve homozgiot mutant (CC) için %0,0 olarak bulunmuştur. Yabanıl (D) alel frekansı %90,3, mutant (C) alel frekansı da %9,7 olarak hesaplanmıştır. Her iki polimorfik bölgenin genotip frekans dağılımının Hardy- Weinberg denklemine uygun olduğu, ve cinsiyete bağımlı bir farklılık göstermediği bulunmuştur. Bu çalışmada belirlenen her iki polimorfızmin genotipik dağılımı, Fransız, İsveç, Alman ve İtalyan gibi diğer Kafkas popülasyonlarıyla Ki-kare testi (x2-testi) uygulanarak karşılaştırıldığında önemli bir farklılık göstermezken, Şili, Japon, Tayvan ve Çin popülasyonlarından önemli derecede farklılık göstermiştir.
Benzer Tezler
- Kolorektal kanser riski ile hipoksiyle indüklenen faktör-1alfa (HIF-1α) ve von hippel lindau (VHL) gen polimorfizmleri arasındaki ilişki
Colorectal cancer risk in relation to hypoxia inducible factor-1α (HIF-1α) and von hippel-lindau (VHL) gene polymorphisms
HASAN SAYGIN DEMİREL
Doktora
Türkçe
2014
Tıbbi BiyolojiNecmettin Erbakan ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. AHMET BÜLENT TURHAN
- Kolorektal kanserli hastalarda COX-2 geni -1195 A>G ve 8473 T>C polimorfizmleri ve periferal kan monositlerindeki mRNA düzeyleri arasındaki ilişkinin araştırılması
Investigation of relationship between -1195 A>G, 8473 T>C polymorphisms of COX-2 gene and mRNA levels of COX-2 gene in human peripheral blood monocyte in colorectal cancer patients
HİCRAN ŞENLİ
- Alkol düzeyi belirleme yönteminin validasyonu ve toplumumuzda alkol metabolize eden enzim polimorfizmi
Validation of alcohol determination method and polymorphisms of alcohol metabolizing enzymes in our population
ŞEBNEM ŞEFİKA ÇEÇEN
Doktora
Türkçe
2006
Adli TıpAnkara ÜniversitesiDisiplinlerarası Adli Tıp Ana Bilim Dalı
PROF.DR. TÜLİN SÖYLEMEZOĞLU
- Denizli ve yöresinde baş, boyun ve oral kavite tümörlü bireylerde CYP2E1 ve ALDH2 genetik polimorfizmlerinin hastalığa yatkınlıkla ilişkisinin incelenmesi
Examination of the susceptibility to disease of the CYP2E1 and ALDH2 genetic polymorphisms in individuals with head, neck and oral cavity tumors in Denizli and its region
METİN DENİZ KARAKOÇ
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
Eczacılık ve FarmakolojiPamukkale ÜniversitesiTıbbi Farmakoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SELİM KORTUNAY
- Türk iskemik inmeli hastalarda ısı şok protein 70 gen polimorfizmlerinin araştırılması
Investigation of heat shock protein 70 gene polymorphisms in ischemic stroke Turkish patients
DİDEM BAKAY