Geri Dön

Genetic polymorphisms of alcohol inducible CYP2E1 in Turkish population

Türk popülasyonunda alkol ile indüklenebilen CYP2E1 genetik polimorfizmi

  1. Tez No: 153667
  2. Yazar: GÜLEN ULUSOY
  3. Danışmanlar: PROF. DR. ORHAN ADALI, PROF. DR. EMEL ARINÇ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyokimya, Biochemistry
  6. Anahtar Kelimeler: SitokromP4502El, genetik polimorfizm, Türkiye popülasyonu, C-1019T / G-1259C, T7678 tek bazlık polimorfızmler, RsaVPstI RFLP, Dral RFLP. vı, SitokromP4502El, genetik polimorfizm, Türkiye popülasyonu, C-1019T / G-1259C, T7678 tek bazlık polimorfızmler, RsaVPstI RFLP, Dral RFLP. vı
  7. Yıl: 2004
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyokimya Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

oz Türkiye populasyonunda alkol ile induklenebelen cyp2ei genetik polimorfizmi ULUSOY, Gülen Yüksek Lisans, Biyokimya Bölümü Tez Yöneticisi: Prof. Dr. Orhan ADALI Yardımcı Tez Yöneticisi: Prof. Dr. Emel ARINÇ Ocak, 2004, 123 sayfa Sitokrom P450 süperailesinin etanol ile indüklenebilen izoformu olan sitokrom P4502E1 (CYP2E1); etanol, aseton, asetaminofen ve klorzokzazon gibi ilaçlar, pek çoğu kanserojen olan endüstriyel çözücüler (benzen ve stiren gibi ) de dahil olmak üzere düşük moleküler ağırlıklı pek çok endojen ve egzojen maddeleri katalize eder. Bunun yanısıra CYP2E1, reaktif oksijen türlerinin oluşmasında da etkindir. Bu izoform, etanol ve izoniazid gibi maddeler ve diyabet ve açlık gibi bazı patofizyolojik durumlarda indüklenir. CYP2E1 geni, kimyasallarla indüklenen kanser gibi pek çok hastalığa maruz kalma riskinde gözlemlenen bireyler arası değişkenlikte etkili olduğu düşünülen genetik polimorfızmler göstermektedir. CYP2E1 polimorfızm frekanslarının çeşitli etnik ve ırksal gruplar arasında değişkenlik gösterdiği kanıtlanmıştır. Bu çalışmada da, önemli iki CYP2E1 polimorfizminin; genin 5'- ucundaki C-1019T / G-1259C ve intron 6'daki T7678A tek bazlık polimorfızmlerinin, Türkiye popülasyonundaki frekansı belirlenmiştir. Bu amaç doğrultusunda, Türkiye popülasyonunu temsil eden 132 sağlıklı gönüllüden kan örnekleri toplanmış ve bu örneklerden genomik DNA parçalanmamış halde izoleedilmiştir. Genotipler, bahsedilen bölgelerin polimeraz zincir reaksiyonu ile çoğaltılmasıyla elde edilen gen fragmanlarının, restriksiyon endonükleazlar Rsal, Pstl (C-1019T / G-1259C polimorfızmleri için) ve Dral (T7678A polimorfızmi için) ile kesilmesiyle belirlenmiştir. C-1019T / G-1259C tek bazlık polimorfızmleri yeni jenerasyonlara birbirlerine bağlı olarak aktarılırlar. Bu polimorfızmi erin genotipi 116 DNA örneği için belirlenmiştir ve frekans dağılımı homozigot yabanıl (cl/cl) genotip için %97,4, heterozigot (cl/c2) genotipi için %2,6 ve homozigot mutant (c2/c2) genotipi için %0,0 olarak bulunmuştur. Buna denk düşen alel frekansları yabanıl alel (el) için %98,7 ve mutant alel (c2) için %1,3 olarak hesaplanmıştır. T7678A tek bazlık polimorfızmin genotipi 108 DNA örneği için belirlenmiştir ve genotip frekansları homozigot yabanıl (DD) için %80,6, heterozigot (CD) için %19,4 ve homozgiot mutant (CC) için %0,0 olarak bulunmuştur. Yabanıl (D) alel frekansı %90,3, mutant (C) alel frekansı da %9,7 olarak hesaplanmıştır. Her iki polimorfik bölgenin genotip frekans dağılımının Hardy- Weinberg denklemine uygun olduğu, ve cinsiyete bağımlı bir farklılık göstermediği bulunmuştur. Bu çalışmada belirlenen her iki polimorfızmin genotipik dağılımı, Fransız, İsveç, Alman ve İtalyan gibi diğer Kafkas popülasyonlarıyla Ki-kare testi (x2-testi) uygulanarak karşılaştırıldığında önemli bir farklılık göstermezken, Şili, Japon, Tayvan ve Çin popülasyonlarından önemli derecede farklılık göstermiştir.

Özet (Çeviri)

oz Türkiye populasyonunda alkol ile induklenebelen cyp2ei genetik polimorfizmi ULUSOY, Gülen Yüksek Lisans, Biyokimya Bölümü Tez Yöneticisi: Prof. Dr. Orhan ADALI Yardımcı Tez Yöneticisi: Prof. Dr. Emel ARINÇ Ocak, 2004, 123 sayfa Sitokrom P450 süperailesinin etanol ile indüklenebilen izoformu olan sitokrom P4502E1 (CYP2E1); etanol, aseton, asetaminofen ve klorzokzazon gibi ilaçlar, pek çoğu kanserojen olan endüstriyel çözücüler (benzen ve stiren gibi ) de dahil olmak üzere düşük moleküler ağırlıklı pek çok endojen ve egzojen maddeleri katalize eder. Bunun yanısıra CYP2E1, reaktif oksijen türlerinin oluşmasında da etkindir. Bu izoform, etanol ve izoniazid gibi maddeler ve diyabet ve açlık gibi bazı patofizyolojik durumlarda indüklenir. CYP2E1 geni, kimyasallarla indüklenen kanser gibi pek çok hastalığa maruz kalma riskinde gözlemlenen bireyler arası değişkenlikte etkili olduğu düşünülen genetik polimorfızmler göstermektedir. CYP2E1 polimorfızm frekanslarının çeşitli etnik ve ırksal gruplar arasında değişkenlik gösterdiği kanıtlanmıştır. Bu çalışmada da, önemli iki CYP2E1 polimorfizminin; genin 5'- ucundaki C-1019T / G-1259C ve intron 6'daki T7678A tek bazlık polimorfızmlerinin, Türkiye popülasyonundaki frekansı belirlenmiştir. Bu amaç doğrultusunda, Türkiye popülasyonunu temsil eden 132 sağlıklı gönüllüden kan örnekleri toplanmış ve bu örneklerden genomik DNA parçalanmamış halde izoleedilmiştir. Genotipler, bahsedilen bölgelerin polimeraz zincir reaksiyonu ile çoğaltılmasıyla elde edilen gen fragmanlarının, restriksiyon endonükleazlar Rsal, Pstl (C-1019T / G-1259C polimorfızmleri için) ve Dral (T7678A polimorfızmi için) ile kesilmesiyle belirlenmiştir. C-1019T / G-1259C tek bazlık polimorfızmleri yeni jenerasyonlara birbirlerine bağlı olarak aktarılırlar. Bu polimorfızmi erin genotipi 116 DNA örneği için belirlenmiştir ve frekans dağılımı homozigot yabanıl (cl/cl) genotip için %97,4, heterozigot (cl/c2) genotipi için %2,6 ve homozigot mutant (c2/c2) genotipi için %0,0 olarak bulunmuştur. Buna denk düşen alel frekansları yabanıl alel (el) için %98,7 ve mutant alel (c2) için %1,3 olarak hesaplanmıştır. T7678A tek bazlık polimorfızmin genotipi 108 DNA örneği için belirlenmiştir ve genotip frekansları homozigot yabanıl (DD) için %80,6, heterozigot (CD) için %19,4 ve homozgiot mutant (CC) için %0,0 olarak bulunmuştur. Yabanıl (D) alel frekansı %90,3, mutant (C) alel frekansı da %9,7 olarak hesaplanmıştır. Her iki polimorfik bölgenin genotip frekans dağılımının Hardy- Weinberg denklemine uygun olduğu, ve cinsiyete bağımlı bir farklılık göstermediği bulunmuştur. Bu çalışmada belirlenen her iki polimorfızmin genotipik dağılımı, Fransız, İsveç, Alman ve İtalyan gibi diğer Kafkas popülasyonlarıyla Ki-kare testi (x2-testi) uygulanarak karşılaştırıldığında önemli bir farklılık göstermezken, Şili, Japon, Tayvan ve Çin popülasyonlarından önemli derecede farklılık göstermiştir.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    353811

    Kolorektal kanserli hastalarda COX-2 geni -1195 A>G ve 8473 T>C polimorfizmleri ve periferal kan monositlerindeki mRNA düzeyleri arasındaki ilişkinin araştırılması

    Investigation of relationship between -1195 A>G, 8473 T>C polymorphisms of COX-2 gene and mRNA levels of COX-2 gene in human peripheral blood monocyte in colorectal cancer patients

    HİCRAN ŞENLİ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    GenetikMersin Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ETEM AKBAŞ

  2. Tez No

    351135

    Kolorektal kanser riski ile hipoksiyle indüklenen faktör-1alfa (HIF-1α) ve von hippel lindau (VHL) gen polimorfizmleri arasındaki ilişki

    Colorectal cancer risk in relation to hypoxia inducible factor-1α (HIF-1α) and von hippel-lindau (VHL) gene polymorphisms

    HASAN SAYGIN DEMİREL

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    Tıbbi BiyolojiNecmettin Erbakan Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. AHMET BÜLENT TURHAN

  3. Tez No

    426692

    Akut pankreatitli hastalarda INOS geni Rs2297518 polimorfizmi bir risk faktörü mü?

    Is INOS gene Rs2297518 polymorphism a risk factor for acute pancreatitis patients

    NURETTİN AY

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    GastroenterolojiÇukurova Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. OĞUZ ÜSKÜDAR

  4. Tez No

    314340

    MikroRNA oluşum yolağında yer alan gen polimorfizmlerinin alkol bağımlılığı riski üzerine olası etkilerinin araştırılması

    A research on possible effects of gene polymorphisms in microRNA biogenesis pathway on alcohol dependence

    HÜSEYİN GEDİK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    Tıbbi BiyolojiMersin Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET EMİN ERDAL

  5. Tez No

    193772

    Alkol düzeyi belirleme yönteminin validasyonu ve toplumumuzda alkol metabolize eden enzim polimorfizmi

    Validation of alcohol determination method and polymorphisms of alcohol metabolizing enzymes in our population

    ŞEBNEM ŞEFİKA ÇEÇEN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2006

    Adli TıpAnkara Üniversitesi

    Adli Tıp Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)

    PROF.DR. TÜLİN SÖYLEMEZOĞLU

Geri Dön