MikroRNA oluşum yolağında yer alan gen polimorfizmlerinin alkol bağımlılığı riski üzerine olası etkilerinin araştırılması
A research on possible effects of gene polymorphisms in microRNA biogenesis pathway on alcohol dependence
- Tez No: 314340
- Danışmanlar: PROF. DR. MEHMET EMİN ERDAL
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Tıbbi Biyoloji, Genetics, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2012
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Mersin Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 70
Özet
Alkol bağımlılığı çevresel ve genetik faktörlerin birlikte rol aldığı kompleks kalıtsal bir nöropsikiyatrik hastalıktır. Alkol bağımlılığının etiyolojisinde genetik faktörler önemli ölçüde yer almaktadır. Protein kodlamayan transkriptlerden işlenerek oluşturulan küçük RNA molekülleri ailesinin bir üyesi olan miRNA'lar, nöropsikiyatrik hastalıklarda gen ekspresyonunun değişiminden sorumlu tutulmaktadır. miRNA oluşum yolağında yer alan gen polimorfizmlerinin toplu olarak miRNA seviyesinde değişime neden olabileceği hipotezi ortaya atılmıştır. Bu vaka-kontrol çalışmasında 123 alkol bağımlısı ve 135 sağlıklı kontrolden izole edilen DNA örnekleri üzerinde miRNA oluşum yolağı gen polimorfizmlerinin Real Time PCR ile genotipleme deneyi yapılmıştır. Ardından vaka- kontrol gruplarının allel ve genotip frekansı hesaplanıp istatistiksel analiz yapılmıştır.RNASEN, XPO5, RAN, DICER1 ve GEMIN3 polimorfizmlerinin genotip ve allel dağılımları ile alkol bağımlısı olma riski arasında anlamlı bir ilişki bulunamamıştır. AGO2 rs4961280 ve AGO1 rs595961 G allelinin alkol bağımlısı olma riskini anlamlı oranda değiştirdiği bulunurken (p=0,043) GEMIN4 rs910924 için T alleli ile alkol bağımlısı olma arasında da anlamlı bir ilişki bulunmuştur (p=0,021). AGO1 rs595961 (p=0,001) ve DGCR8 rs1640299 (p=0,002) genotip dağılımlarında hasta grubuyla kontrol grubu arasında anlamlı bir fark olduğu bulunmuştur.Sonuç olarak, klasik miRNA oluşum yolağındaki gen polimorfizmleri gen ekspresyonunda değişime neden olup alkol bağımlılığının ortaya çıkmasında rol alabileceği hipotezinden yola çıkarak polimorfizmlerin hastalık riski ile ilişkisi araştırılmıştır. Bu araştırma şu ana kadar polimorfizmlerin alkol bağımlılığı ile olan olası ilişkisini değerlendiren ilk hasta kontrol çalışmasıdır. Bağımsız bir çalışmada bu araştırmadaki bulguların tekrarlanması sonuçların doğrulanması açısından önemlidir. Çalışmanın sonuçları miRNA'nın alkol bağımlılığındaki rolünün ortaya çıkartılması amacıyla yapılacak araştırmalar için yol gösterici olacaktır.
Özet (Çeviri)
Alcohol dependence is a neuropsychiatric disorder to which both genetic and environmental factors contribute. Especially genetic factors are promising to explain the etiology of the alcohol dependence. MicroRNAs are members of a family of noncoding small RNAs which are thought to be responsible for the altered gene expression in neuropsychiatric disorders. We hypothesized that SNPs in miRNA biogenesis pathway may result in an overall change in miRNA levels of a cell. Real Time PCR genotyping experiment was conducted on DNA samples from 123 alcohol dependent patients and 135 healthy controls. This was followed by a statistical analysis to calculate allele and genotype frequencies of case-control groups.We did not find any significant association of RNASEN, XPO5, RAN, DICER1 and GEMIN3 polymorphisms with alcohol dependence risk. AGO2 rs4961280 and AGO1 rs595961 G alleles have significantly altered the risk of alcohol dependence (p=0,043), and also there is a significant association of GEMIN4 rs910924 T allele with the risk of alcohol dependence (p=0,021). We also found statistically significant difference in AGO1 rs595961 (p=0,001) and DGCR8 rs1640299 (p=0,002) genotype frequencies between case-control groups.In conclusion, polymorphisms in miRNA biogenesis may involve in increasing the alcohol dependence risk by changing the levels of miRNAs inside the cell. This is the first study to investigate the effects of SNPs in miRNA biogenesis pathway on alcohol dependence risk. An independent research on this subject should be conducted to verify our results. In the future, these results could be a guide to research on the role of miRNAs in alcohol dependence.
Benzer Tezler
- MikroRNA (miRNA) oluşum yolağında yer alan gen polimorfizmlerinin dikkat eksikliği ve hiperaktivite bozukluğu riski üzerine olası etkilerinin araştırılması
Investigation of the gene polymorphism's possible effect on the risk of attention deficit and hyperactivity disorder located in the microRNA (miRNA) formation pathway
ÜMİT KARAKAŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2012
Tıbbi BiyolojiMersin ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ÖZLEM İZCİ AY
- Expressions of some miRNAs in Alzheimer patients and investigation of polymorphisms in genes involved in the miRNA formation pathway
Alzheimer hastalarında bazı mikroRNA'ların ifadeleri ve oluşum yolağında rol oynayan genlerin polimorfizmlerinin araştırılması
ŞENAY GÖRÜCÜ YILMAZ
Doktora
Türkçe
2013
Tıbbi BiyolojiMersin ÜniversitesiTıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. M. EMİN ERDAL
- Çocukluk çağı hematolojik malignitelerinde mikrorna'ların prognostik etkisi
Prognostic effect of micrornas in hematological malignancies of childhood
FUNDA AKPINAR
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2015
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıPamukkale ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AZİZ POLAT
- Phenotypic analysis of pash-1ts mutant to understand the roles of miRNAs in UPRER
Mikro RNAların endoplazmik retikulumdaki katlanmamış protein tepkisi (KPTER)'ndeki rollerini anlamak için pash-1ts suşunun fenotipik analizi
GÜLKIZ BAYTEK
Yüksek Lisans
İngilizce
2015
BiyolojiKoç ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. FUNDA ŞAR
- Haşhaş (Papaver somniferum L.)'da tebain üretim mekanizmasının yeni nesil dizileme sistemi ile transkriptom düzeyinde incelenmesi
Transcriptome based analysis of the thebaine biosynthesis mechanism in opium poppy (Papaver somniferum L.) via next gereation sequencing
BEHCET İNAL
Doktora
Türkçe
2015
BiyolojiAnkara ÜniversitesiTemel Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEBAHATTİN ÖZCAN
DOÇ. DR. TURGAY ÜNVER