Geri Dön

Mezial temporal skleroz patolojisinde apoptotik ve sağ kalım cevaplarının mRNA ekspresyonu seviyesinde analizi

mRNA expression analysis of apoptotic and survival responses in mesial temporal sclerosis pathology

  1. Tez No: 157804
  2. Yazar: FİLİZ ÖZBAŞ GERÇEKER
  3. Danışmanlar: PROF. DR. MERAL ÖZGÜÇ
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2004
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 103

Özet

V ÖZET Özbaş-Gerçeker, F. Mezial Temporal Skleroz patolojisinde apoptotik ve sağkalım cevaplarının mRNA ekspresyonu seviyesinde analizi, Hacettepe Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Tıbbi Biyoloji Programı Doktora Tezi, Ankara 2004. Mezial Temporal Lob Epilepsisi (MTLE) insanda sık rastlanan, iyi tanımlanmış semptomatik, lokalizasyon-bağımlı parsiyel bir epilepsi türüdür. En belirgin patofîzyolojik özelliği Cornu Ammonis bölgesinde seçici nöron kaybı ve reaktif gliozis ile karakterize edilebilen hipokampal sklerozdur. Bu çalışmanın amacı“Serial Analysis of Gene Expression”(SAGE) teknolojisi kullanarak kontrol ve sklerotik hipokampus dokularında transkriptomun karakterizasyonu ve kıyaslanması ile epileptogenez/hipokampal skleroz patolojisinde rol alan genlerin/hücresel mekanizmaların aydınlatılmasıdır. SAGE geniş ölçekli sekans analizinden faydalanarak hücresel gen ekspresyon kalıplarının dijital analizlerle kantitatif profilini elde etmemizi sağlayan bir tekniktir. Klinik ve patolojik bulguları uyumlu 6 hasta ve otopsi ile elde edilen 1 kontrol hipokampus dokusunda SAGE uygulanmıştır. Çalışmanın verileri USAGE ve SAGEstat programlan ile analiz edilerek kontrol ve MTLE hipokampus transkriptomları karşılaştınlmıştır. Kontrol hipokampus dokusunda toplam 28,228 tag (9206 farklı transkript) tanımlanırken sklerotik hipokampusta 25,932 tag (9599 farklı transkript) karakterize edilmiştir. Kontrol ve sklerotik hipokampus transkriptomları incelendiğinde her ikisinde de genel hücresel transkriptlerin ekspresyon seviyesinin dokuya özgül genlere oranla yüksek olduğu gözlendi. İki kütüphanenin tag frekansları kullanılarak yapılan istatistiksel analizler sonucunda ekspresyon seviyesi anlamlı düzeyde farklılık gösteren 767 gen/transkript tanımlandı (p

Özet (Çeviri)

VI ABSTRACT Özbaş-Gerçeker, F. mRNA Expression Analysis of Apoptotic and Survival Responses in Mesial Temporal Sclerosis Pathology, Hacettepe University, Institute of Health Sciences, PhD Thesis in Medical Biology, Ankara 2004. Mesial Temporal Lobe Epilepsy (MTLE) is the most common, and best-defined form of symptomatic localization-related epilepsies. The typical pathological finding is hippocampal sclerosis which is characterized by selective neuronal loss in Cornu Ammonis region and reactive gliosis. The aim of this study is to define the genes and cellular mechanisms playing role in epileptogenesis/hippocampal sclerosis by characterization and comparison of hippocampal transcriptome in normal and sclerotic hippocampus by using Serial Analysis of Gene Expression (SAGE) technology. SAGE is a high-throughput sequencing-based technique that allows the quantitative and simultaneous analysis of a large number of transcripts, enabling a global view on the gene expression. Hippocampal tissue obtained from six patients of similar pathological and clinical features and an autopsy control were used in this study. USAGE and SAGEstat programs were used to analyze the data and compare the normal and sclerotic hippocampus transcriptome. A total of 28,228 tags (9206 unique transcripts) for control hippocampus and 25,932 tags (9599 unique transcripts) for sclerotic hippocampus were identified. It is observed that in both SAGE libraries the expression level of general cellular transcripts were higher than that of tissue-specific transcripts. By comparing tag frequencies, 767 differentially expressed genes (58 % downregulation, 42 % downregulation) were identified (p

Benzer Tezler

  1. Mezial temporal lob epilepsi (MTLE) patolojisinde wnt yolağı genlerinin ekspresyon düzeylerinin incelenmesi

    Expression analysis of wnt pathway genes in mesial temporal lobe epilepsy (MTLE) pathology

    AYŞE YÜZBAŞIOĞLU

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    BiyoteknolojiAnkara Üniversitesi

    Temel Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ASUMAN SUNGUROĞLU

  2. Mezial temporal skleroz olgularında korpus kallozumun ve beyin korteksinin antropometrik ölçümlerle değerlendirilmesı

    Evaluation of the corpus callosum and brain cortex in patient with mesial temporal sclerosis with anthropometric measurements

    HAMDULLAH ERK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Radyoloji ve Nükleer TıpSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Radyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HAKAN ÖNDER

  3. Mezial temporal skleroz'lu hastalarda mezolimbik yapıların hacim değişikliklerinin incelenmesi

    Investigation of volume changes in mesolimbic structures in patients with mesial temporal sclerosis

    NURİYE ÖZ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    AnatomiAkdeniz Üniversitesi

    Anatomi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NİGAR KELEŞ ÇELİK

  4. Temporal lob epilepsisinde hipokampüsün volümetrik MR incelemesi

    Volumetric MR study of hippocampus in temporal lobe epilepsy

    F. SÜMER GÜLLAP

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    1999

    NörolojiGazi Üniversitesi

    Nöroloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ERHAN BİLİR

  5. Mezial temporal sklerozlu hastalarda entorinal korteks ve hipokampal volum ölçümlerinin karşılaştırılması

    Comparison of entorhinal cortex and hippocampal volume measurements of patients with mesial temporal sclerosis

    NAZAN CANBULAT

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2006

    NörolojiUludağ Üniversitesi

    Nöroloji Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. İBRAHİM BORA