Geri Dön

HANEIN-1, a novel conserved eukaryotic protein ubiquitously expressed in human tissues

HANEIN-1, tüm insan dokularında ifadesi görülen korunmuş yeni bir ökaryotik protein

PDF İndir

  1. Tez No: 177190
  2. Yazar: SERAP ERKEK
  3. Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. UYGAR H. TAZEBAY
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2008
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi
  10. Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 63

Özet

HANEIN-1 Na+/I- simporter geninin 3' regulasyon elementleri araştırılırken keşfedilen yeni bir gendir. Bu yeni protein bütün ökaryot canlılarda korunmakla birlikte, bilinen hiçbir proteinle ortak işlevsel bölgelere sahip değildir. Veritabanlarında kıvrım-kıvrım (coiled-coil) bölge içeren-124 hipotetik proteini olarak tanımlanmakta ve 223 amino asit içeren bir protein olduğu tahmin edilmektedir. Bu projededeki amaç HANEIN-1 proteinini çeşitli biyoinformatik ve biyokimyasal analiz yöntemleriyle karakterize etmekti. HANEIN-1 proteinin amino acid dizi benzerliği analizi, bu proteinin memelilerde %75, böcek ve nematodlarda ise % 50 oranında korunduğunu gösterdi. Gen ifade analiz yöntemleri ile HANEIN-1 ifadesinin en fazla iskelet kasında olduğu tespit edildi. Bunun yanı sıra, northern blot analizi ile HANEIN-1 transcript büyüklüğü yaklaşık 1000 bp olarak belirlendi. Western blot tekniği ile protein düzeyinde yapılan çalışmalar, HANEIN-1 geninin 33 kDa büyüklüğünde bir proteini kodladığını ve proteini N-son ucu ve C-son ucu Flag epitopu ile işaretlemenin protein stabilitesini farklı şekilde etkilediğini gösterdi. Laboratuvarımızda yapılan maya ikili-hibrid deneyleriyle, HANEIN-1 proteinin henüz tam olarak karakterize edilmemiş, bir guanin nükleotit değişim faktörü (Guanine Exchange Factor) olan RASGEF1B proteiniyle etkileştiği bulunmuştur. Gen ifade analizleri RASGEF1B ve HANEIN-1 ifade profilleri arasında ters bir bağlantı olduğunu göstermiştir. Son olarak, serin-tarayıcı mutasyon analizleriyle, 194. konumdaki serin mutasyonunun protein stabilitesini önemli ölçüde değiştirdiği saptanmıştır.

Özet (Çeviri)

HANEIN-1 was first identified in a study investigating 3? transcriptional regulatory elements of the Na+/I- symporter gene. The protein is highly conserved among eukaryotes and bears no domain similarities with any known proteins. In databases, it is described as coiled coil containing-124 hypothetical protein and predicted to encode a 223 amino acid-protein. In this project, our aim was to characterize this highly conserved protein by using several bioinformatics and biochemical methodologies. Sequence similarity search analysis showed that it had around 75% identity in mammals, 50% identity with insects and nematodes. Expressional analysis revealed that HANEIN-1 was expressed in all tissues ubiquitously with a remarkable expression status in skeletal muscle. Beside providing information about expression status of HANEIN-1, northern blotting showed that HANEIN-1 transcript size was approximately 1000 bp. Regarding protein level expression, western blotting revealed that HANEIN-1 encoded a 33 kDa protein and protein stability was affected in a different way upon labeling with Flag epitope at N-ter and C-ter. Yeast double hybrid screening performed in our laboratory showed that HANEIN-1 interacted with RASGEF1B, which was a guanine nucleotide exchange factor not fully characterized. Expressional analysis displayed that RASGEF1B expression profile inversely correlated with HANEIN-1. Finally, serine-scanning mutagenesis analysis showed that site-directed mutagenesis of serine at position 194 significantly affected the stability of the protein.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    793527

    Identification of novel PARP1 inhibitors based on structural similarities of FDA approved drugs

    FDA onaylı ilaçların yapısal benzerliklerine dayalı yeni PARP1 inhibitörlerinin tanımlanması

    HANEEN AMMURI

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    BiyomühendislikBahçeşehir Üniversitesi

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SERDAR DURDAĞI

  2. Tez No

    477162

    İlyas Esenberlin'in Altın Orda (1. Cilt) adlı eserinin Kazak Türkçesi'nden Türkiye Türkçesi'ne çevirisi ve dil incelemesi

    Altın Orda, wriitten by İlyas Esenberlin, is the traslation from Kazakh to Turkish and linguistic analysis

    MEHMET ALİ ŞAHİN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    DilbilimOrdu Üniversitesi

    Türk Dili ve Edebiyatı Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İSMAİL DOĞAN

  3. Tez No

    765370

    Assessment of depression in breast cancer patients

    Meme kanserli hastalarda depresyonun değerlendirilmesi

    HANEEN BADR SHANSHOOL SHANSHOOL

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    HemşirelikÇankırı Karatekin Üniversitesi

    Hemşirelik Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ SEHER GÖNEN ŞENTÜRK

  4. Tez No

    208076

    Nevşehir'de Türk dönemi mimari eserleri

    Architectural buildings of Turkish era in Nevşehir

    MEHMET EKİZ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2006

    MimarlıkAnkara Üniversitesi

    Sanat Tarihi Ana Bilim Dalı

    DOÇ.DR. MEHMET TUNÇEL

  5. Tez No

    23983

    Süne (Eurygaster spp.) zararlı buğdayların ekmeklik kalitesinin buharla tavlama metodu ile arttırılması üzerine araştırmalar

    A study on the improvement of bread making quality suni bug (Eurygaster spp.) damaged wheat by steam tempering method

    HARUN DIRAMAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    1994

    Gıda MühendisliğiTrakya Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. MEHMET DEMİRCİ

Geri Dön