Geri Dön

Cancer-testis gene expression as a biomarker of the genetic variation in the one carbon metabolic pathway

Bir karbon metabolik yolundaki genetik farklılıkların belirleyicisi olarak kanser-testis gen ifadesi

PDF İndir

  1. Tez No: 177189
  2. Yazar: AHMET RASİM BARUTÇU
  3. Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. ALİ OSMAY GÜRE
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2008
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi
  10. Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 87

Özet

İnsanlarda bütün biyolojik tepkimelerde kullanılan tek metil grubu vericisi S-adenozilmetiyonin (SAM)'dir. SAM üretimi için gereken folik asit tüketimi, deoksitimidin monofosfat (dTMP) sentezi için gereklidir ve her iki olay da bir karbon metabolik yolundaki enzimler sayesinde gerçekleşir. Bu enzimlerde sıkça görülen aleller kanser dâhil birçok hastalık ile ilişkilendirilmiştir. Ancak, bu enzimlerde görülen polimorfizmlerin SAM üretimine olan kümülatif etkisi şu ana kadar çalışılmamıştır. Bir karbon metabolik yolundaki enzim alellerinin kümülatif etkisine duyarlı ve buna cevap verebilecek biyolojik bir belirleyicinin teşhisi, bu alanda ilerleme kaydedilmesi için önemlidir. Hipotezimize göre transkripsiyonları DNA demtilasyonu ile ilişkili olan Kanser-Testis (KT) genleri, böyle bir biyolojik belirteç olabilir. Bu çalışmada, küçük hücre dışı akciğer kanserinde (KHDAK) KT gen ifadesi ile bir karbon metabolik yolundaki, metilentetrahidrofolat redüktaz (MTHFR), metiyonin sentaz (MS), indirgenmiş folat taşıyıcısı (RFC) ve metiyonin sentaz redüktaz (MTRR) enzim alelleri ilişkiyi araştırdık. Sonuçlarımız, enzim alelleri arasında linkage disequilibrium olduğunu göstermiş, ayrıca belli bir haplotip ile CT gen ifadesi arasındaki ilişkiyi açığa çıkarmış ve izlenecek adımlarda önemli noktaları aydınlatmıştır.

Özet (Çeviri)

S-adenosyl methionine (SAM) is the sole methyl donor for all biological reactions in humans. Folate consumption, required for SAM generation, is also essential for dTMP synthesis and both events occur via enzymes of the one-carbon pathway. Frequently occurring alleles of these enzymes have occasionally been associated with several diseases including cancer. However, the cumulative effects of the polymorphic variants of these enzymes on S-adenosylmethionine production have not been studied. Tbelirleyicisi he identification of a biomarker that can reflect the collective effect of these allelic variants is critical in moving the field forwards. We hypothesized that Cancer-Testis (CT) genes, whose expression strongly correlates with DNA hypomethylation, could be such a biomarker. In this study, we have pursued an extensive correlation of CT expression and allelic variants of the several one-carbon pathway enzyme genes , including methyltetrahydrofolatereductase (MTHFR), methionine synthase (MS), reduced folate carrier (RFC) and methionine synthase reductase (MTRR) in non-small cell lung cancer. Our results revealed linkage disequilibrium among alleles as well as correlations between given genootypes and CT gene expression, and illuminate the critical next steps that need to be pursued.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    436345

    Cancer testis gene expression as a biomarker of one-carbon metabolic activity, drug sensitivity and phenotypic heterogeneity in non-small cell lung cancer and malignant melanoma

    Küçük hücre dışı akciğer kanseri ve malin melanom'da tek-karbon metabolik yolağı aktivitesi, ilaç hassasiyeti ve fenotipik heterojenite'nin biyo-belirteci olarak kanser-testis gen ifadesi

    KEREM MERT ŞENSES

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2016

    Moleküler Tıpİhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ALİ OSMAY GÜRE

  2. Tez No

    668367

    Oral kavitenin malin ve premalin lezyonlarında GBRC5C geninin genetik ve epigenetik profilinin incelenmesi

    Investigation of the genetic and epigenetic profile of the GPRC5C gene in malignant and premalignant lesions of the oral cavity

    KÜBRA GİZEM ESENTÜRK YAYLA

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    Genetikİstanbul Üniversitesi

    Temel Onkoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SEMRA DEMOKAN

  3. Tez No

    852607

    Kekik yağının mide kanserindeki antikanser rolünün epigenetik açıdan değerlendirilmesi

    Epigenetic evaluation of thyme oil anticancer effect in gastric cancer

    FATMA SÖĞÜTLÜ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Tıbbi BiyolojiEge Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ÇIĞIR BİRAY AVCI

  4. Tez No

    559850

    Oral kavitenin malign ve premalign lezyonlarında PAX1 geninin metilasyon ve ekspresyonunun araştırılması

    Examination of methylation and expression levels of PAX1 gene in oral malign and premalign lesions

    ARDA ÖZTAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Diş Hekimliğiİstanbul Üniversitesi

    Ağız Diş ve Çene Cerrahisi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GÜLSÜM AK

  5. Tez No

    521260

    Kronik miyeloid lösemili hastalardan tedaviye yanıtlı ve yanıtsız olanların BCR-ABL miktarı ile miRNA düzeylerinin karşılaştırılması

    Comparison of BCR-ABL and miRNA expression levels in treatmentresponsive and treatment-unresponsive patients with chronic myeloidleukemia

    MURAT YURT

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    BiyolojiDicle Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. HİLMİ İSİ

Geri Dön