Diffusion tensor field visualization
Difüzyon tensör alanı görselleştirme
- Tez No: 179031
- Danışmanlar: DR. ALİ VAHİT ŞAHİNER
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrol, Computer Engineering and Computer Science and Control
- Anahtar Kelimeler: Difüzyon, Görselleştirme, Tensör alanı, Diffusion, Visualization, Tensor field
- Yıl: 2008
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Boğaziçi Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Bilgisayar Mühendisliği Bölümü
- Bilim Dalı: Bilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
MR resimleme vasıtasıyla difuzyonun sınırlandırıldığı alanlarda, mesela insan beyninin içindeki sinir ağlarında, görselleştirilmesi alttaki mikro yapıyı anlamamızı sağlar ve onu daha detaylı incelememize izin verir. Ancak 3 boyutta tensör alanı görselleştirme bir çok meydan okumayı içinde barındırır.Bu calışmada, 3 boyutlu difuzyon tensör alanı görselleştirmek için interaktif bir uygulama sunulmuştur. Uygulama iki yaklaşım içermektedir. Birincisi, Tensör Boyama, komşu tensor çiftlerinin lokal bağlılık tanımlarına dayanmaktadır. Lokal bağlılık değerleri, eşik değerleri ile birlikte bir tensörün kendisine ulaşan boyayı komşu tensörlere ulaştırıp ulaştırmayacağını belirler. Tensör boyama birçok değişik bağlılık tanımını kullanır. Bu tanımların hepsi, difuzyon tensörünün, hareket eden parçacıkların uzaysal dağılımını açıklayan 3 boyutlu Gaussian PDF lerin ortak değişinti matrisi olarak yorumlanmasına dayanır. Ikinci yaklaşım tensör alanına uygun olarak beyazgürültü imgesinin düzenlenmesine dayanır. Bunun için akış görselleştirmede çok sık kullanılan Line Integral Convolution(LIC) tekniğinden faydalanılmıştır. LIC metodunda, lokal akış çizgilerinin hesaplanmasının ardından evrişim filtresi kullanılır.Bu çalışmada, önce difuzyon tensörünün görselleştirilmesinin gereklilikleri ele alındı ve ardından geliştirilen uygulama sunuldu. İki phantom difuzyon tensör alanı üzerinden elde edilen sonuçların ve değerlendirmelerinin sunumu ve yorumlama kısmı bunları takip etti.
Özet (Çeviri)
Visualization of dffusion in restricted media, such as the fiber network in human brain, via MR imaging provides a better understanding of the underlying micro structure and allows us to study it in detail. However, 3D tensor field visualization presents several challenges.In this study, we present an interactive tool for visualizing 3D diffusion tensor fields. The tool is composed of two approaches. The first one, the Tensor Paint, is based on the definition of local connectivity between neighboring tensor pairs. The connectivity value together with a threshold determines whether a tensor passes the paint it has received to its neighbors or not. Tensor paint employs a number of different connectivity definitions. They are all based on the interpretation of the diffusion tensors as the covariance matrices of the 3D Gaussian PDFs representing the spatial distribution of moving particles. The second approach is based on the modulation of an input white noise texture by the tensor field. For this purpose, we have utilized the Line Integral Convolution (LIC) technique which is a widely used technique in flow visualization. In LIC, the application of a convolution filter follows local streamline computation.In the study, we first discuss the requirements for the visualization of diffusion tensor fields and then present our tool. Presentation of the results and evaluations obtained on two phantom diffusion tensor fields and a discussion follows this.
Benzer Tezler
- Diffusion tensor fiber tracking with self-organizing feature maps
Öz düzenleyici haritalar ile difüzyon tensör yolak takibi
DİLEK GÖKSEL DURU
- Sağlıklı bireylerde 3 Tesla MR cihazından elde edilen difüzyon tensör görüntüleme verilerinde traktografi analizi ile beynin yapısal bağlantısallığının incelenmesi
Examination of the brain's structural connectivity in healthy individuals with tractography analysis of diffusion tensor imaging data obtained from 3 Tesla MRI scanner
HİLAL KOLENOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2025
Fizik ve Fizik MühendisliğiAnkara ÜniversitesiMedikal Fizik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. METEHAN ÇİÇEK
- Futbolcularda tekrarlayan hafif kafa darbelerinin beyaz cevherdeki etkilerinin multi-shell difüzyon tensör görüntüleme ile araştırılması
Investigation of the effects of repetitive subconcussive head impacts on white matter in soccer players with multi-shell diffusion tensor imaging
DEMET KÜÇÜK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
Radyoloji ve Nükleer TıpOndokuz Mayıs ÜniversitesiRadyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HÜSEYİN AKAN
- Serebral palsili çocuklarda beyaz madde yolaklarının yolak tabanlı uzaysal istatistik ile değerlendirilmesi
Evaluation of the white matter tract injury with tract-based spatial statistics in children with cerebral palsy
SELİN ÖZCAN
- Models for magnetic resonance observation of diffusion in cellular environments
Hücresel ortamlardaki yayınımın manyetik rezonans gözlemi için modeller
MUHAMMET MEMİÇ
Yüksek Lisans
İngilizce
2015
Fizik ve Fizik MühendisliğiBoğaziçi ÜniversitesiFizik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. EVREN ÖZARSLAN