Tokat ve Kelkit havzası civarındaki illerde kene-kökenli Kırım Kongo Kanamalı Ateşi Virüsü'nün RT-PCR yöntemi ile teşhisi
Diagnosis of tick-borne Crimean Congo Haemorrhagic Fever Virus with Rt-PCR method in Tokat and the other cities of Kelkit basin
- Tez No: 179619
- Danışmanlar: DOÇ. DR. ŞABAN TEKİN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Polimeraz zincirleme reaksiyonu, Tokat, Polymerase chain reaction, Tokat
- Yıl: 2008
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Gaziosmanpaşa Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Kırım Kongo Kanamalı Ateşi (KKKA) hastalığı, insanlarda şiddetli kanamalar ve yüksek ateş gibi septomlarla seyreden, zoonoz karakterli bir hastalıktır. KKKA hastalığın etkeni negatif anlamlı, tek iplikçikli ve üç parça RNA molekülünden oluşan bir RNA virüsüdür. Tokat ili ve civarında yapılan arazi çalışmaları neticesinde toplanan kene ve serum örneklerindeki KKKA virüsü varlığı, virüsün S segmentine (Np) spesifik olarak dizayn edilen iki farklı primer seti kullanılarak Reverse Transkripsiyon Polimeraz Zincir Reaksiyonu (RT-PCR) yöntemiyle test edilmiştir ve pozitif örneklerin genetik analizleri yapılmıştır. Bu çalışmada test edilen bazı örneklerde KKKA virüsü varlığı RT-PCR yöntemiyle moleküler olarak belirlenmiş ve pozitif PCR numunelerinin 1423 baz çiftlik kısmının DNA dizi analizi yapılarak diğer KKKA virüsleriyle benzerliği ortaya çıkartılmıştır. BLAST homoloji araştırmalarının sonuçlarına göre, bu çalışmada bulunan ve EXPASY bilgi bankası analizlerine göre 467 amino asiti kodlayan 1423 baz çifti nükleotid dizisinin Bulgaristan, Rusya ve Kosova'da daha önceden belirtilmiş bazı KKKA viral nükleotid dizileri ile %97 oranında; Çin, Umman, Özbekistan, İran'da bulunanlarla ise %88 oranında benzerlik gösterdiği tespit edilmiştir. Buna göre, Tokat bölgesinde bulunan KKKA virüsünün muhtemelen Kuzey Avrupa, Balkanlar ve Rusya kökenli olduğu tahmin edilmektedir.
Özet (Çeviri)
Crimean Congo Haemorrhagic Fever (CCHF) is a zoonotic disease with symptoms of heavy haemorrage and high fever in humans. CCHF virus (CCHFV), the causative agent of disease, is an RNA virus with a negatif single stranded tri-parted RNA genom. In this study, the presence of CCHFV was tested by RT-PCR using CCHFV S segment (Np) specific primers in ticks and serum samples collected from Tokat and vicinity. The presence of the CCHFV was determined in some samples tested, positive samples with 1423 base pairs (bp) were sequenced and nucleotid homology of the sequences with previously found CCHFV S segments were compared. According to BLAST searches and EXPASY analyses, 1423 bp sequence coding 467 amino acid showed 97 % similarity with segments from and Bulgaria, Russia, and Kosovo, and 88 % similarity with segments from China, Omman, Ozbekistan, and Iran. These results indicates that CCHFV found in Tokat and vicinity is possibly originated from East Europe, Balkans, and Russia.
Benzer Tezler
- Bentonitlerde değişebilir katyonların katman yapısına etkilerinin x-ışınları kırınım yöntemi ile incelenmesi
Başlık çevirisi yok
İLHAN AKSOY
Doktora
Türkçe
1986
Fizik ve Fizik Mühendisliğiİnönü ÜniversitesiFizik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NİZAMETTİN ARMAĞAN
- Tokat ili merkez ilçesi tarım işletmelerinde işgücü varlığı ve değerlendirme durumu üzerine bir araştırma
Başlık çevirisi yok
KEMAL ESENGÜN
Yüksek Lisans
Türkçe
1987
ZiraatCumhuriyet ÜniversitesiTarım Ekonomisi Ana Bilim Dalı
PROF.DR. AHMET ERKUŞ
- Tokat merkez kazası vakıf kayıtları: H. 984 (M. 1576) tarihli Defter-i Efkaf-ı
Başlık çevirisi yok
FATMA ÜSTEK
- Domates tozu ve domates çorbalarında meydana gelen renk değişmeleri
Başlık çevirisi yok
MURAT EFEOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
1987
Gıda MühendisliğiEge ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AYDIN URAL