Yerel durum buğdayı çeşitlerinde (Triticum durum Desf. ) RAPD PCR tekniği ile genetik çeşitlilik analizi
Analysis of genetic diversity in landraces of macoroni wheat (Triticum durum Desf. ) by RAPD PCR technique
- Tez No: 183837
- Danışmanlar: DOÇ.DR. AFİFE İZBIRAK
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Durum buğdayı, genetik çeşitlilik, polimorfizm, RAPD-PCR, UPGMA, PCA, Durum wheat, genetic diversity, polymorphism, RAPD-PCR, UPGMA, PCA
- Yıl: 2006
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 113
Özet
YEREL DURUM BUĞDAYI ÇEŞİTLERİNDE (Triticum durum Desf.) RAPD-PCRTEKNİĞİ İLE GENETİK ÇEŞİTLİLİK ANALİZİMehmet KarcıcıoÖZMoleküler biyoloji tekniklerindeki son gelişmeler, canlı türleri üzerinde yapılansistematik ve evrimsel çalışmalara büyük bir hız kazandırmıştır. Bu tekniklerdenbirisi olan RAPD (Rasgele Çoğaltılmış Polimorfik DNA), buğdaylar ve diğertahıllarda genetik çeşitliliğin saptanmasında kullanılan etkin bir metotdur. Genetikçeşitlilik çalışmaları ıslah programlarında olduğu kadar, germplazmların korunmasıve karakterizasyonunda da önemlidir.Bu çalışmanın amacı, tetraploid durum buğdaylarına ait germplazmlarda RAPDbant modellerindeki varyasyonu ve bunlar arasındaki sistematik ilişkileri ortayaçıkarmaktır. Bu amaçla 25 farklı durum buğday çeşidi RAPD tekniği kullanılarakanaliz edilmiştir. Rasgele seçilmiş 42 primerden 26'sı informatif bulunmuştur.Polimorfik primerlerden elde edilen toplam 176 PCR ürününden 81'i polimorfikbulunmuş ve çalışılan durum buğdayı çeşitlerinde polimorfizm oranı % 46.02olarak saptanmıştır. Bütün veriler, Aritmetik Ortalamayı Kullanan Ağırlıksız ÇiftGrup Metodu'yla (UPGMA) değerlendirilmiş ve fenogram bu yöntemle çizilmiştir.Ayrıca durum çeşitleri arasındaki genetik varyasyonun tespit edilmesi için TemelBileşenler Analizi (PCA) kullanılmıştır. UPGMA analizi Kızıltan 91 ve Kunduru1149'un en yakın, Pınar 2001 ve Ankara 98'in ise en uzak çeşitler olduğunugöstermektedir. PCA sonuçları ise, bu çalışmada kullanılan çeşitlerin genetikvaryasyon bakımından dört ana grup oluşturduğuna işaret etmektedir.
Özet (Çeviri)
ANALYSIS OF GENETIC DIVERSITY IN LANDRACES OF MACORONI WHEAT(Triticum durum Desf.) BY RAPD-PCR TECHNIQUEMehmet KarcıcıoABSTRACTRecent advances in molecular biology have provided a variety of new tools to infersystematic or evolutionary relationships among plant species. RAPD (RandomAmplified Polymorphic DNA) is one of those techniques that used as effectivemethod for detecting genetic variation in wheat and various other crops. The studyof genetic diversity is important in a breeding program for the selection of suitablydiverse parents to obtain hybrids as well as for the conservation andcharacterization of germplasm.The objective of this study is evaluating genetic diversity in a set of germplasm intetraploid durum wheat, to establish variation in RAPD band patterns and itsusefulness in systematic relationship. For this purpose collection of 25 differentdurum wheat landraces were analyzed by using RAPD technique. Randomlyselected 26 primers were informative out of 42. Of the totally amplificationproducts (176 loci) scored in the RAPD analysis, 81 were polymorphic. Durumlandraces showed 46.02 % polymorphic band patterns. All the data wereemployed to construct phenograms using an unweighted pair-group method witharithmetical averages (UPGMA). However, principle component analysis (PCA)were used in order to detect genetic variation among durum landraces. TheUPGMA analysis indicated the highest similarity among Kızıltan 91 and Kunduru1149 cultivars, whereas, the genetic distance between Pınar 2001 and Ankara 98was the highest. Using PCA analysis, four different groups with genetic variationwere detected among the cultivars used in this study.
Benzer Tezler
- Türkiye'de yetiştirilen yerel makarnalık buğday çeşitlerinde genetik farklılığın polimorfik DNA analizi ile belirlenmesi
Determination of genetic diversity in Turkish durum wheat landraces by rapd analysis
TANER AKAR
- Bazı yerel ve ıslah edilmiş makarnalık buğday çeşitlerinde (Triticum durum desf.) tuz ve su stresinin karbohidrat ve proline etkilerinin incelenmesi
Başlık çevirisi yok
HAFİZE ÇAVDAR
Yüksek Lisans
Türkçe
1997
BiyolojiÇukurova ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. SEMA DÜZENLİ
- Klorofilmetrenin makarnalık buğday (Triticum durum Desf.) açılma kuşaklarında azot kullanım etkinliği ve tane verimi yönünden seleksiyon aracı olarak kullanılabilirliği
Availability of chlorophyll meters as a selection instrument for nitrogen use efficiency and grain yield in durum wheat (Triticum durum Desf.)segregation populations
FERHAT KIZILGEÇİ
- Horasan buğdayının (Triticum turanicum jakubz) farklı ekim zamanlarına ve ekim sıklıklarına tepkisinin belirlenmesi
Response of khorasan wheat (Triticum turanicum jakubz)to different sowing dates and sowing densities
MURAT ÇALIŞKAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2007
ZiraatKahramanmaraş Sütçü İmam ÜniversitesiTarla Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF.DR. TEVRİCAN DOKUYUCU
- Seçilmiş yerel buğday çeşitlerinin karşılaştırmalı transkriptomik analizi ve çinko uygulamasının bazı enzim genlerinin ifade düzeyine olan etkisi
Comparative transcriptome analysis of selected local wheat varieties and effects of zinc treatment on expression levels of some enzyme genes
AYŞEGÜL BİLGE UĞUZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
BiyoteknolojiHacettepe ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. REMZİYE YILMAZ
DR. AYTEN SALANTUR