Elektrokimyasal DNA biyosensörleri ile Vitamin D reseptör genindeki polimorfizmlerin saptanması
Detection of polymorphisms in the Vitamin D receptor gene with an electrochemical DNA biosensor
- Tez No: 192885
- Danışmanlar: PROF. DR. MEHMET ŞENGÜN ÖZSÖZ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Eczacılık ve Farmakoloji, Genetik, Tıbbi Biyoloji, Biotechnology, Pharmacy and Pharmacology, Genetics, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2008
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ege Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Analitik Kimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 142
Özet
Çalışmada, vitamin D reseptöründe (VDR'de) görülen Apa I tek nokta polimorfizminin elektrokimyasal olarak tayinine yönelik hibridizasyona dayalı yenilenebilir bir biyosensör geliştirilmiştir. Biyosensör, Apa I polimorfizmine ait 21 bazlık sentetik tek sarmal (prob) dizilerin ve PCR ürünü dizilerinin biyosensör yüzeyine bağlanmasına ve bu oligonükleotidlerin tam karşılığı ve tek bazı hedeften farklı olan dizilerle kalem grafit üzerindeki hibridizasyonuna dayanmaktadır. Elektrokimyasal hibridizasyon indikatörü olarak çift sarmal DNA arasına interkale olan Meldola Mavisi (MDB) kullanılmıştır. dsDNA, ssDNA ve SNP içeren dizinin tayini DPV tekniği kullanılarak MDB'nin -0.130 V ± 0.005'daki voltametrik indirgenme sinyalinin değişiminin ölçülmesiyle gerçekleştirilmiştir. Çalışmada MDB sinyalini etkileyen prob ve hedef konsantrasyonu, hibridizasyon, bağlanma ve yıkama zamanı gibi birçok parametre incelenmiştir.Çalışmamızda, geliştirmiş olduğumuz elektrokimyasal DNA biyosensörü VDR'deki Apa I polimorfizminin saptanmasına yönelik hızlı ve güvenilir sonuçlar vermiştir. Literatürde bu mutasyonun elektrokimyasal biyosensörle tayinine yönelik kayıta rastlanmamıştır.
Özet (Çeviri)
In this study, a hybridization-based disposable electrochemical DNA biosensor for the electrochemical detection of an Apa I single nucleotide polymorphism (SNP) in the vitamin D receptor (VDR) gene was developed. The biosensor is based on the immobilization of the 21-base single-stranded oligonucleotides (probe) and PCR amplicons related to the Apa I polymorphism sequences, and hybridization of these oligonucleotides to their perfectly complementary target sequences and to target sequences containing single mismatches on a pencil graphite electrode (PGE). An electroactive Meldola's Blue (MDB), which intercalates between the base pairs in a hybrid duplex, was used as an electrochemical indicator. The discrimination of dsDNA, ssDNA, DNA containing a single mismatch was achieved by measuring changes in the voltammetric reduction signal of MDB at -0.130 V ± 0.005 using DPV. We investigated several factors affecting the MDB signal, such as probe concentration, target concentration, hybridization time, accumulation time, and washing time.In this study, an electrochemical DNA biosensor is described that offers fast and reliable results for the detection of the Apa I polymorphism in the vitamin D receptor. In literatüre, this is the first study demonstrating the electrochemical detection of the Apa I polymorphism in the VDR gene.
Benzer Tezler
- Derin ven trombozlu hastalarda faktör V leiden ve protrombin 20210A mutasyonlarının araştırılması ve elektrokimyasal DNA biyosensörleri ile faktör V leiden analizi
Incestigating factor V leiden and prothrombin 20210A mutations in patients with deep vein thrombosis and analysis of factor V leiden by electrochemical DNA biosensor
BERRİN TUĞRUL
Doktora
Türkçe
2003
Tıbbi BiyolojiEge ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NEJAT TOPÇUOĞLU
- İyonik sıvı temelli kompozitlere dayalı elektrokimyasal biyosensörlerin geliştirilmesi
Development of electrochemical biosensors based on ionic liquid composites
HAMDİ AYDIN
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
KimyaEge ÜniversitesiMalzeme Bilimi ve Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. KADRİYE ARZUM ERDEM GÜRSAN
- Eritromisinin elektrokimyasal davranışlarının DNA biyosensörleri ile incelenmesi
Investigation of electrochemical behaviour of erythromycin with DNA biosensor
FATMA BUDAK
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
KimyaSivas Cumhuriyet ÜniversitesiAnalitik Kimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÜLTEKİN GÖKÇE
- İlaç DNA etkileşiminin elektrokimyasal sensörler ile incelenmesi ve geliştirilmesi
Analaysing and developing medicine-DNA interaction with electrochemical sensors
EBRU POLAT
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
KimyaCumhuriyet ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ADİL ELİK
DOÇ. DR. GÜLTEKİN GÖKÇE
- Çeşitli kimyasal maddelerin DNA ile etkileşmesine yönelik elektrokimyasal DNA biyosensörlerinin geliştirilmesi
Development of electrochemical DNA biosensors for interaction of various chemical substances with DNA
EFSUN YALIM