Investigation of as a multi-tumor suppressor gene
ATBF1 geninin bir multi-tümör baskılayıcı gen olarak incelenmesi
- Tez No: 198974
- Danışmanlar: Y.DOÇ.DR. CENGİZ YAKICIER
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: hepatoselüler karsinom, tümör baskılayıcı gen, kromozom16q, LOH, hepatocellular carcinoma, tumor suppressor gene, chromosome16q, LOH
- Yıl: 2005
- Dil: İngilizce
- Üniversite: İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi
- Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 45
Özet
ÖZETATBF1 GENİNİN BİR MULTİ-TÜMÖR BASKILAYICI GENOLARAK İNCELENMESİÖzkan AydemirMoleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü Yüksek LisansıDanışman: Dr. M. Cengiz YakıcıerAğustos 2005, 34 SayfaATBF1, Myb onkoproteinini baskılayan ve p21 promotor aktivitesini arttıran birtranskripsiyon faktörüdür. Değişik organ kanserlerinde sıklıkla delesyonauğrayan 16q22.3-23.1 bölgesinde yer alan ATBF1 geninin prostat kanserlerindetümor baskılayıcı gen olduğu ve sıklıkla mutasyona uğradığı gösterilmiştir.16q22.3-23.1 bölgesinin prostat kanserlerinin yanısıra hepatoselüler karsinom,meme kanserleri, glial tümörler ve kolorektal kanserler dahil olmak üzere birçok kanser çeşidinde kaybolduğu gösterilmiştir. Bu çalışmada amacımız,ATBF1 geninin hepatoselüler karsinom, meme kanserleri, glial tümörler vekolorektal kanserlerin gelişimindeki rolünü incelemektir. Bunun için sözkonusukanser örneklerinde ATBF1 geninde mutasyonların olup olmadığıaraştırılmıştır. Çalışmamız ATBF1 geninin prostat kanserlerinde sık mutastonauğrayan bölgelerine odaklanmıştır. Çalışmamızda sözkonusu genininglutaminden zengin, olası transaktivasyon bölgelerinde sıklıkla 3 ve 6 bazpolimofizmler taşıdığını gösterilmiştir. 3 örnekte, bu polimorfizmlerin tümördokularında homozigot, normal dokularda ise heterozigot olduğu; dolayısıylaATBF1 geninin Knudson Hipotezi'ne göre bu tümörlerde tumor baskılayıcı genolarak görev yapıyor olabileceği gösterilmiştir. Ayrıca, ATBF1 geninde aminoasit değişikliklerine sebep olan tek baz değişiklikleri de gösterilmiştir.Çalışmalarımızın sonuçlarına dayanarak, ATBF1 geni ile ilgili daha fazlaçalışma yapılması gerektiğini ve ATBF1 geninin bir multi-tümör baskılayıcı genolduğu hipotezini öne sürüyoruz.
Özet (Çeviri)
ABSTRACTINVESTIGATION OF ATBF1 AS A MULTI-TUMOR SUPPRESSORGENEÖzkan AydemirM.S. in Molecular Biology and GeneticsSupervisor: Dr. M. Cengiz YakıcıerAugust 2005, 34 pagesATBF1 is a transcription factor which inhibits Myb oncoprotein and increasesp21 promoter activity. Recently, ATBF1 gene was shown to be expressionallydownregulated and harbored frequent mutations in prostate cancers. ATBF1resides on chromosome 16q22.3-23.1 which is deleted recurrently in numeroustypes of tumors including hepatocellular carcinoma, breast cancers, glial tumorsand colorectal cancers. In this study we aimed to assess ATBF1 gene?sinvolvement in HCC, breast cancer, glial cancers and colorectal cancersdevelopment. We analyzed the DNA samples of these tumors for ATBF1 genemutations. We focused on the regions which harbored high frequency ofmutations in prostate cancers. Our study revealed frequent 3 and 6 bppolymorphisms on glutamine rich, and therefore possible transactivationdomains. We showed homozygous 3 and 6 bp alterations were heterozygous inthe matching histologically normal tissues in 3 cases; supporting the tumorsuppressor role of ATBF1 gene in tumors tested, according to Knudson?s two-hit hypothesis. In addition, we were able to identify single base pairsubstitutions on ATBF1 gene, and one of them is highly likely to be somatic.Based on our results, we hypothesize that ATBF1 gene is a multi-tumorsuppressor gene, although further investigation of this gene is necessary.
Benzer Tezler
- Investigation of the candidate tumor suppressor gene CTCF using multi-omics data mining
CTCF aday tümör süpresör geninin multi-omik veri madenciliği ile araştırılması
ESRA DURSUN
Yüksek Lisans
İngilizce
2021
Biyoistatistikİstanbul Medipol ÜniversitesiBiyomedikal Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ KIVANÇ KÖK
- ATP2B4 ve ATP5B genlerinin kolorektal kanser ile ilişkisinin araştırılması
Investigation of the association between ATP2B4 and ATP5B genes with colorectal cancer
ESRA GEYİK
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
Tıbbi BiyolojiGaziantep ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. YUSUF ZİYA İĞCİ
- Stromal Antijen 1 (STAG 1) geninin hücre proliferasyonu, transformasyonu ve DNA hasar yanıtındaki fonksiyonel rolünün belirlenmesi
Determining the functional role of Stromal Antigen 1 (STAG 1) gene in cell proliferation, transformation and DNA damage responses
NİHAL AKTAŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2010
OnkolojiÇukurova Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MELEK KÖKSAL ERKİŞİ
- Over kanserinde kullanılmak üzere polimer ilaç nanokonjugatı geliştirilmesi ve kanser tedavi potansiyelinin araştırılması
Development of polymer DRUG nanoconjugate for USE in ovarian cancer and investigation of cancer treatment potential
BUKET ÖZEL
Doktora
Türkçe
2022
Tıbbi BiyolojiEge ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. NUR SELVİ GÜNEL
- Mezenşimal kök hücrelerin immün modülatör etkisinin hemofagositik sendrom klinik uygulamalarına temel oluşturmak üzere in vitro modelde incelenmesi
Investigation of the immune modulator effect of mesenchymal stem cells in in vitro model as the basis for hemophagocytic syndrome clinical applications
HANDAN SEVİM