Geri Dön

Ceftazidime dirençli pseudumonas aeruginosa izolatlarında per-1 ve oxa-10 benzeri beta-laktamazların moleküler yöntemlerle belirlenmesi

Determination of per-1 and oxa-10-like beta-lactamases in ceftazidime-resistant pseudomonas aeruginosa isolates by molecular methods

PDF İndir

  1. Tez No: 203195
  2. Yazar: MEHTAP ÜNLÜ SÖĞÜT
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. ASUMAN BİRİNCİ, YRD. DOÇ. DR. TUBA YILDIRIM
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları, Mikrobiyoloji, Moleküler Tıp, Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Microbiology, Molecular Medicine
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2008
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ondokuz Mayıs Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Temel Tıp Bilimleri Bölümü
  12. Bilim Dalı: Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: 110

Özet

Pseudomonas aeruginosa'nın özellikle çoklu ilaca dirençli suşları hastane infeksiyonu etkenleri arasında önemli bir yere sahiptir. Beta-laktamaz üretimi, gram-negatif bakterilerde beta-laktam antibiyotiklere dirençte önemli bir mekanizmadır. Türkiye kaynaklı olan PER-1 ve OXA-10 grubu beta-laktamazlar (OXA-11/14/16) P. aeruginosa'da seftazidim direncine neden olurlar.Bu çalışmada, hastane infeksiyonu etkeni P. aeruginosa suşlarında seftazidim direncine neden olan PER-1 ve OXA-10 grubu beta-laktamaz enzimlerini moleküler yöntemler ile hızlı ve güvenilir olarak tanımlamak, görülme sıklıklarını ortaya koymak ve bu izolatların klonal yakınlıklarını saptayarak yeni oluşacak hastane infeksiyonu olgularını kontrol altına almak hedeflenmektedir.Seftazidime dirençli 50 adet P. aeruginosa izolatında PER-1 ve OXA-10 grubu gen bölgeleri PZR ile tespit edildi. Suşların klonal yakınlıkları RAPD-PZR yöntemiyle belirlendi ve PFGE ile epidemiyolojik analizleri yapıldı. PER ve OXA-10 grubu gen bölgelerinin restriksiyon analizleri yapılarak tipleri belirlendi.İncelenen suşlarda %46 oranında PER-1 ve %78 oranında OXA-10 enzimi tespit edildi. P. aeruginosa izolatları arasında saptanan dört ana klonun yüksek prevalanstan sorumlu olduğu RAPD-PZR sonuçları ile ortaya kondu. PFGE yönteminde de üç ana klonun belirlenmesi izolatların büyük oranda ilişkili olduğunu destekledi. RFLP analizi ile PER-1 ve OXA-11/14/16 enzim genotipleri tanımlandı. Ondokuz Mayıs Ünversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi'nde izole edilen seftazidim dirençli P. aeruginosa suşlarında PER-1 ve OXA-10 enzimlerinin yaygın olduğu ve bu enzimi üreten birçok suşun ?klonal ilişkili? oluşunun horizontal yayılıma işaret ettiği sonucuna varıldı.ABSTRACTDETERMINATION OF PER-1 AND OXA-10-LIKE BETA-LACTAMASES IN CEFTAZIDIME-RESISTANT PSEUDOMONAS AERUGINOSA ISOLATES BY MOLECULAR METHODSMehtap ÜNLÜ SÖĞÜT, Ph.D. ThesisUniversity of Ondokuz Mayıs Samsun, June 2008Pseudomonas aeruginosa strains, especially multidrug resistant, have great of importance among nosocomial infection isolates. Production of beta-lactamase is an important mechanism in gram-negative bacteria for resistance to beta-lactam antibiotics. PER-1 and OXA-10 like beta-lactamases (OXA-11-14-16) were first reported from Turkey, and caused ceftazidime resistance in P. aeruginosa.In this study, our aim was to identify PER-1 and OXA-10 like beta-lactamase enzymes which caused ceftazidime resistance in nosocomial P. aeruginosa strains as fast and correctly by molecular methods, to determine the prevalance of these enzymes and to get the nosocomial infections under control by determining their clonal relationship.PER-1 and OXA-10 presence was sought by PCR in 50 ceftazidime resistant P. aeruginosa strains. Clonal relationship of strains was determined by RAPD-PCR and epidemilogic analysis of isolates was investigated by PFGE. Types of PER-1 and OXA-10 like beta-lactamases were analysed by RFLP.PER-1 and OXA-10 like beta-lactamases were detected in 46 % and 78 % of P. aeruginosa strains, respectively. RAPD-PCR results releaved dissemination that the four main clones which were determined among P. aeruginosa isolates are responsible for the high prevalence. The determination of three main clones by PFGE also supported that the isolates are nearly related. PER-1 and OXA-10 11-14-16 types were identified by RFLP analyse. We concluded that, the prevalence of PER-1 and OXA-10 enzymes among ceftazidime resistant P. aeruginosa isolate was high in our hospital. PER-1 and OXA-10 producers were being transmitted horizontally as most of the isolates are clonally related.Key Word: Pseudomonas aeruginosa, beta-lactamases, PER-1, OXA-10, molecular epidemiology.

Özet (Çeviri)

Pseudomonas aeruginosa strains, especially multidrug resistant, have great of importance among nosocomial infection isolates. Production of beta-lactamase is an important mechanism in gram-negative bacteria for resistance to beta-lactam antibiotics. PER-1 and OXA-10 like beta-lactamases (OXA-11-14-16) were first reported from Turkey, and caused ceftazidime resistance in P. aeruginosa.In this study, our aim was to identify PER-1 and OXA-10 like beta-lactamase enzymes which caused ceftazidime resistance in nosocomial P. aeruginosa strains as fast and correctly by molecular methods, to determine the prevalance of these enzymes and to get the nosocomial infections under control by determining their clonal relationship.PER-1 and OXA-10 presence was sought by PCR in 50 ceftazidime resistant P. aeruginosa strains. Clonal relationship of strains was determined by RAPD-PCR and epidemilogic analysis of isolates was investigated by PFGE. Types of PER-1 and OXA-10 like beta-lactamases were analysed by RFLP.PER-1 and OXA-10 like beta-lactamases were detected in 46 % and 78 % of P. aeruginosa strains, respectively. RAPD-PCR results releaved dissemination that the four main clones which were determined among P. aeruginosa isolates are responsible for the high prevalence. The determination of three main clones by PFGE also supported that the isolates are nearly related. PER-1 and OXA-10 11-14-16 types were identified by RFLP analyse. We concluded that, the prevalence of PER-1 and OXA-10 enzymes among ceftazidime resistant P. aeruginosa isolate was high in our hospital. PER-1 and OXA-10 producers were being transmitted horizontally as most of the isolates are clonally related.Key Word: Pseudomonas aeruginosa, beta-lactamases, PER-1, OXA-10, molecular epidemiology.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    663679

    Kastamonu eğitim ve araştırma hastanesinden izole edilen seftazidime dirençli Pseudomonas aeruginosa izolatlarında PER-1 ve OXA-10 benzeri genişlemiş spektrumlu βeta-laktamaz varlığının araştırılması

    Investigation of the presence of PER-1 and OXA-10 like extended spectrum βeta-lactamases in ceftazidime resistant Pseudomonas aeruginosa strains from Kastamonu training and research hospital

    SARAH AKAR ALI AL-OGAILI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    GenetikKastamonu Üniversitesi

    Genetik ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. YASEMİN ÇELİK ALTUNOĞLU

  2. Tez No

    336694

    Seftazidim dirençli Pseudomonas aeruginosa izolatlarında Beta laktamazların moleküler epidemiyolojisi

    Molecular epidemiology of Beta lactamases in ceftazidime resistant Pseudomonas aeruginosa isolates

    HALİL ER

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    MikrobiyolojiAfyon Kocatepe Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MUSTAFA ALTINDİŞ

  3. Tez No

    787825

    Karbapenem dirençli pseudomonas aeruginosa izolatlarının direnç ve virülans genlerinin taranması ve pfge ile moleküler epidemiyolojisinin incelenmesi

    Determination of the resi̇stance and virulence genes is carbapenem resistant pseudomonas aeruginosa isolates and investigation of its molecular epi̇demi̇ology by pfge

    HAMİYET BÜŞRA GÜNDOĞDU

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    MikrobiyolojiRecep Tayyip Erdoğan Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. OSMAN BİROL ÖZGÜMÜŞ

  4. Tez No

    266866

    Turgut Özal Tıp Merkezinde 2009 yılında nozokomiyal pseudomonas aeruginosa izolatlarında antibiyotik direnç, indüklenebilir beta-laktamaz ve metallo beta-laktamaz oranlarının belirlenmesi

    Determination of antibiotic resistance, inducible beta-lactamase and metallo beta-lactamase rates for nosocomial pseudomonas aeruginosa isolates in Turgut Özal Medical Center within 2009 year

    AHMET MANSUR

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2010

    Mikrobiyolojiİnönü Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SELMA AY

  5. Tez No

    397143

    Klinik Pseudomonas aeruginosa izolatlarında β-laktamaz direnç genlerinin taranması ve yeni bir metallo-β-laktamazın (VIM-38) karakterizasyonu

    Screening of β-lactamase resistance genes clinical isolates of Pseudomonas aeruginosa and characterization of a new metallo-β-lactamase (VIM-38)

    AZER ÖZAD DÜZGÜN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    BiyolojiRecep Tayyip Erdoğan Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. CEMAL SANDALLI

Geri Dön