Türkiye denizlerindeki tirsilerin (Alosa spp.) moleküler sistematiği
The molecular systematic of shads (Alosa spp.) in Turkish seas
- Tez No: 212526
- Danışmanlar: PROF. DR. CEMAL TURAN, YRD. DOÇ. DR. CEM ÇEVİK
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Su Ürünleri, Aquatic Products
- Anahtar Kelimeler: Türkiye denizleri, Tirsi türleri, Mitokondrial DNA, PCR-RFLP, Moleküler sistematik, Turkish seas, Shad species, Mitochondrial DNA, PCR-RFLP, Molecular systematic
- Yıl: 2007
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Çukurova Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Su Ürünleri Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu çalışmada Türkiye denizlerinde bulunan 5 tirsi türü (Alosa caspia, Alosa fallax nilotica, Alosa maeotica, Alosa pontica, Alosa tanaica) arasındaki genetik ilişkinin şekli ve derecesi mtDNA PCR-RFLP yöntemi kullanılarak analiz edilmiştir. MtDNA'nın ND 5/6 gen bölgesi PCR yöntemi ile çoğaltılarak 6 sınırlama enzimi BsurI, AluI, EheI, Hin6I, RsaI, XhoI) ile kesilmiştir. RFLP sonucunda 5 tirsi türünde toplam 13 haplotip saptanmıştır. Türlerin içerisinde ortalama haplotip çeşitliliği 0.6000 ve nükleotit çeşitliliği 0.005331 olarak bulunmuştur. Türlerin kendi aralarında karşılaştırılmalarında ise ortalama nükleotit çeşitliliği 0.008024 ve ortalama nükleotit farklılığı 0.002693 olarak gözlemlenmiştir. Türler arasındaki genetik uzaklık değerlerine bakıldığında en yüksek değerin A. pontica ile A. caspia arasında 0.009599'luk bir değer olduğu, en düşük değerin ise, A. maeotica ve A. tanaica türleri 0.000007 arasında olduğu görülmektedir. Monte-Carlo (X2) İkili Karşılaştırma Analizi sonucu bütün türler arasında önemli derecede farklılıklar olduğu belirlenmiştir (p<0.001). UPGMA soyağacı analizine göre, A. tanaica ve A. maeotica türleri birbirine genetik olarak en yakın bulunmuş, A. pontica ise türler içerisinde en farklı tür olarak göze çarpmıştır.
Özet (Çeviri)
In this study mitochondrial DNA polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) assay was used to analyse the phylogenetic relationships among five shad species (Alosa caspia, A. fallax nilotica, Alosa maeotica, Alosa pontica, Alosa tanaica) from Turkish seas. The complete NADH 5/6 gene region of mtDNA amplified by PCR were digested with six restriction enzymes, BsurI, AluI, EheI, Hin6I, RsaI, XhoI respectively. A total of 13 haplotypes were detected from five shad species. The average haplotype diversity and nucleotid diversity within species were 0.6000 and 0.005331 respectively. The average nucleotid diversity and nucleotide divergence among species were 0.008024 and 0.002693 respectively. The highest genetic divergence was observed between A. pontica to A. caspia (0.009599) and lowest, between A. maeotica and A. tanaica (0.000007). Monte Carlo (X2) pairwise found determined significant differences between all species, depending on the mtDNA regions examined (p<0.001). In the UPGMA (Unweighhed Pair Group Method) dendogram, A. tanaica and A. maeotica exhibited closest genetical similarity and A.pontica showed highest genetical differantiation within Alosa genus.
Benzer Tezler
- Türkiye denizlerindeki Cladophora Kützing (Chlorophyta) üyelerinin sistematik karakterizasyonu
Systematic characterization of members of Cladophora Kützing (Chlorophyta) in Turkey sea
MELİKE ÖZTÜRK
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
BotanikÇanakkale Onsekiz Mart ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. HÜSEYİN ERDUĞAN
- Türkiye denizlerindeki tekir (Mullus surmuletus L.) türünün genetik stoklarının belirlenmesi
Genetic stock identification of striped red mullet (Mullus surmuletus L.) in the seas of Turkey
DOĞAN TUNCAY
- Türkiye denizlerindeki rüzgar enerjisi potansiyeli ve deniz üstü rüzgar santralleri kurulabilecek bölgelerin belirlenmesi
Determination of offshore wind farm locations of Turkey based on wind energy potential assessment
VOLKAN YERCİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
Elektrik ve Elektronik MühendisliğiMevlana ÜniversitesiElektrik-Elektronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. MEHMET ARGIN
- Türkiye denizlerindeki seyir emniyet durumunun belirlenmesi
Determining navigational safety status at Turkey seas
ALPEREN ERDOĞAN
Doktora
Türkçe
2019
Denizcilikİstanbul Üniversitesi-CerrahpaşaDeniz Ulaştırma İşletme Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. GÖKHAN KARA
- Türkiye denizlerindeki iskorpit (Scorpaena spp.) türlerinin moleküler, morfometrik ve otolit biyometrisi yöntemleriyle ayrımı
Discrimination of scorpionfish (Scorpaena spp.) species in turkish seas by molecular, morphometric and otolith biometry methods
SERDAR YEDİER
Doktora
Türkçe
2020
GenetikOrdu ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. DERYA BOSTANCI