Geri Dön

Analysis of methanogenic archael populations in anoxic sediments of the Marmara sea using fluorescent in situ hybridization

Marmara denizinin anoksik sedimentlerindeki metanojenik arkeal populasyonun floresanlı yerinde hibritleşmeyle analizi

PDF İndir

  1. Tez No: 222050
  2. Yazar: AYŞEGÜL DENİZ
  3. Danışmanlar: PROF.DR. ORHAN İNCE
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoteknoloji, Çevre Mühendisliği, Biotechnology, Environmental Engineering
  6. Anahtar Kelimeler: FISH, Marmara Denizi, Moleküler Yöntemler, Arkeler, FISH, Marmara Sea, Molecular Methods, Archae
  7. Yıl: 2006
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: İstanbul Teknik Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Çevre Mühendisliği Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 100

Özet

Bu çalısmada, Marmara Denizi'ndeki farklı noktalardan alınan (Gemlik Körfeziİzmit Körfezi ve Küçükçekmece) anoksik sedimentlerde metanojenik arkealpopulasyonlar kültürden bagımsız moleküler metot, floresanli yerindehibritlesme (FISH), kullanılarak sayıldı ve tanımlandı. Ayrıca sedimentörneklerinin organik ve inorganik içerikleri arastırıldı ve sonuçlar sedimentörneklerinin arkeal topluluk yapısıyla tarıtısıldı.Gemlik Körfezi, Izmit Körfezi (Iz17), Izmit Körfezi (Iz25) ve Küçükçekmece'denalınan sedimentlerdeki DAPI ile boyanmıs toplam mikroorganizmaların sırasıyla67%±8%, 62%±5%, 77%±11% ve 80%±7%'i universal prob kullanılarak tespitedildi. FISH sonuçlarına göre Gemlik Körfezi, Izmit Körfezi (Iz17), IzmitKörfezi (Iz25) ve Küçükçekmece'den alınan sedimentlerdeki arkeal hücreleringöreceli bollugu sırasıyla 32%±4%, 23%±3%, 33%±2% ve 29%±7%'dir.Gemlik Körfezi, Izmit Körfezi (Iz17), Izmit Körfezi (Iz25) ve Küçükçekmece'denalınan anoksik sedimentlerdeki toplam metanojenlerin 19%, 21%, 23% ve 20%'si H2 kullanan metanojenlerdir buna karsi bunlarin 7%, 9%, 10% ve 11%' iasetoklastik metanojenlerdir. Bu sonuçlar Marmara Denizi'ndeki anoksiksedimentlerde aktif bir arkeal populasyonun oldugunu ve baskın olarakH2+CO2'ye bagımlı metanojenesisin önemli seviyelerde gerçeklestiginigöstermektir

Özet (Çeviri)

In this study, methanogenic archaeal populations in anoxic sediments fromdifferent regions of the Marmara Sea (Gemlik Bay, Izmit Bay andKucukcekmece) were identified and quantified using a cultivation independentmolecular method, Fluorescent in situ hybridization (FISH). Organic andinorganic content of the sediment samples were also investigated and the resultswere discussed along with the archaeal community structure of the sedimentsamples.67%±8%, 62%±5%, 77%±11% and 80%±7% of DAPI stained totalmicroorganisms in sediments from Gemlik Bay, Izmit Bay (Iz17), Izmit Bay(Iz25) and Kucukcekmece respectively were detected using universal probe inthis study. According to FISH results, relative abundances of archaeal cellswithin the sediments from Gemlik Bay, Izmit Bay (Iz17), Izmit Bay (Iz25) andKucukcekmece are 32%±4%, 23%±3%, 33%±2% and 29%±7% respectively.19%, 20%, 21% and 23% of the total methanogens in anoxic sediments fromGemlik Bay, Kucukcekmece, Izmit Bay (Iz17) and Izmit Bay (Iz25) are H2utilizing methanogens whereas 7%, 11%, 9% and 10% of them are acetoclasticmethanogens. . These results revealed that there are active archaeal populationswithin the the anoxic sediments from the Marmara Sea, and methanogenesisoccurs in the sediments at important levels , dominantly H2+CO2 dependent

Benzer Tezler

  1. Tez No

    152446

    Analysis of archaeal diversity in the Black Sea sediments by flourescence in situ hybridization technique

    Karadeniz sedimentlerinde arkeal çeşitliliğin florasanlı yerinde hibritleşme tekniğiyle analizi

    AYŞE EYİGÖR

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2004

    Çevre MühendisliğiBoğaziçi Üniversitesi

    Çevre Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. BAHAR İNCE

  2. Tez No

    310391

    Sulfate reducers and methanogens in Marmara sea sediments

    Marmara denizi sedimentlerindeki, sülfat indirgeyiciler ve methanojenler

    BAHAR ÖZTULUNÇ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2010

    Çevre Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Çevre Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ORHAN İNCE

  3. Tez No

    139498

    Determination of archeal populations in anaerobic reactors using molecular techniques

    Anaerobik reaktörlerde arkeal toplulukların moleküler teknikler kullanılarak belirlenmesi

    ALPER TUNGA AKARSUBAŞI

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2003

    BiyolojiBoğaziçi Üniversitesi

    Çevre Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. BAHAR KASAPGİL İNCE

    PROF. DR. BETÜL KIRDAR

  4. Tez No

    200438

    Analiysis of archaeal community dynamics in full scale anaerobic reactors using fluorescent in situ hybridization

    Tam ölçekli anaerobik reaktörlerdeki arkeyal komünite dinamiklerinin flüoresanlı yerinde melezleme tekniği ile aanalizi

    SAİR SİNAN KESTELLİ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2006

    MikrobiyolojiBoğaziçi Üniversitesi

    Çevre Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. BAHAR KASAPGİL İNCE

  5. Tez No

    222619

    Changes in archaeal and bacterial 16S rRNA gene sequences in a full-scale anaerobic reactor

    Gerçek ölçekli bir anaerobik reaktördeki arkeal ve bakteriyel 16S rRNA gen dizilimlerindeki değişimler

    ŞÜKRİYE ÇELİKKOL

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2007

    Biyoteknolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Çevre Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ORHAN İNCE

Geri Dön