Geri Dön

Mycobacterıum tuberculosıs bakterisinin rifampine karşı geliştirdiği direnç mutasyonlarının elektrokimyasal dna biyosensörü ile saptanması

The detection of mycobacterium tuberculosis resistance mutations to rifampin treatment with electrochemical dna biosensor

  1. Tez No: 229924
  2. Yazar: SEDA ÇAVDAR
  3. Danışmanlar: PROF. DR. M. E. ŞENGÜN ÖZSÖZ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoteknoloji, Eczacılık ve Farmakoloji, Biotechnology, Pharmacy and Pharmacology
  6. Anahtar Kelimeler: Elektrokimya, biyosensör, kalem grafit elektrot, biotin-avidin etkileşimi, diferansiyel puls voltametri, yüzey plazmon rezonans, Electrochemistry, biosensor, pencil graphite electrode, biotin-avidin interaction, differential pulse voltammetry, surface plasmon resonance
  7. Yıl: 2008
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ege Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Analitik Kimya Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 121

Özet

Bu çalışmada, biotin?avidin etkileşimine dayalı elektrokimyasal bir genosensör tasarımı yapıldı. Yapılan genosensörün gerçek hasta örneklerine uygulanabildiği gösterildi.Çalışamada tek kullanımlık kalem grafit elektrotlar kullanıldı. 5' ucunda amino-hekzil işaretli prob diziler elektrot yüzeyine kovalent olarak bağlandı. Prob dizi ile kaplı elektrotların, biotinli olarak çoğaltılmış ve denatüre edilerek tek iplikli hale getirilmiş PCR ürünü hedef dizi ile hibridizasyona tabi tutulup ExtrAvidin?Alkalen Fosfataz ve 1?Naftil Fosfat çözeltilerinde bekletilmesinin ardından oluşan naftolün yükseltgenme sinyalleri değerlendirildi. PCR ürünü hedef dizilerin mutasyon içeren ve içermeyen bölgelerine karşılık gelen prob diziler ile hibridizasyonu sonucu alınan naftol yükseltgenme sinyalleri arasındaki farklılıklar, tasarlanan genosensörün seçimliliğini gösterdi.Çalışmadaki Mycobacterium tuberculosis bakterisinin tayini basamağını desteklemek için yüzey plazmon rezonans (SPR) yardımıyla geliştirilen optik genosensör ile de bir çalışma yapıldı. Bu çalışmada ise sentetik prob dizi ile sentetik hedef dizi hibridizasyona tabi tutularak Mycobacterium tuberculosis bakterisinin tayini gerçekleştirildi.Çalışmada altın sensör yüzeyine tiyol işaretli prob dizi tuturuldu ve prob dizilerin yüzeyde dik konumda kalması için aradaki boşluklar 6?merkapto 1?hekzanol ile dolduruldu. Daha sonra rasgele hedef dizi ve prob dizinin karşılığı olan sentetik hedef dizi ile hibridizasyon gerçekleştirildi. Bağlanma ve yıkama sonrası kırılma indisi değerlerindeki farklılanmalar analizin gerçekleşmesini sağladı.

Özet (Çeviri)

In this study, an electrochemical genosensor was designed based on biotin?avidin interaction. The applicability of this genosensor on real samples from patients was showed.Disposable pencil graphite electrodes (PGE) were used in the study. 5? aminohexyl labeled probe sequences were covalently immobilized on to PGE surfaces. The oxidation signals of naphtol that formed after the hybridization between probe and denaturated and biotinylated PCR product and waiting in ExtrAvidin?Alkaline Phosphatase and 1?Naphthyl Phosphate solutions were considered. The differences between responses obtained after hybridization with complementary and mutation reigons proved the selectivity of the genosensor.For supporting the step of detection of Mycobacterium tuberculosis bacterium, an other study was made with surface plasmon resonance (SPR). In this study, the detection of Mycobacterium tuberculosis bacterium was realized with hybridization between synthetic prob and target oligonucleotides.In the study, the thiolated probe is insisted onto the Au surface and the holes between probes were filled with 6?mercapto?1?hexanol for holding probes perpendicular. After that, hybridization was performed between probe and complementary target and non?complementary target. The differences between responses of refractive indexes after binding and washing processes provided the realization the analysis.

Benzer Tezler

  1. Klinik tanıya yönelik DNA hibridizasyonuna dayalı elektrokimyasal genosensör tasarımı

    An electochemical genosensor design for clinical analysis based on DNA hybridization detection

    PINAR KARA KADAYIFCILAR

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    BiyomühendislikEge Üniversitesi

    Analitik Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. MEHMET EMİN ŞENGÜN ÖZSÖZ

  2. Rutin laboratuvar ve gaz kramatografisi yöntemleriyle tanımlanan mycobacterium türlerinin anti tüberkülo ilaçlara ve ofloksasine in vitro duyarlılığı

    Başlık çevirisi yok

    SELİM GÖRGÜN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2000

    MikrobiyolojiAtatürk Üniversitesi

    Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. OSMAN AKTAŞ

  3. TLR4 VE IL28B genleri polimorfizmlerinin tüberküloz enfeksiyonlarının insidansı ve gelişimine etkisi

    Impact of TLR4 VE IL28B gene polymorphisms on their incidence of tuberculosis infection

    AHMED KAMIL BUNIYA BUNIYA

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    BiyolojiÇankırı Karatekin Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ MÜGE FIRAT

  4. Predicting the existence of mycobacterium tuberculosis on patients by data mining approach

    Hastalarda mycobacterium tuberculosis bakterisinin varlığının veri madenciliği yaklaşımı ile tahmini

    TAMER UÇAR

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2009

    Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve KontrolBahçeşehir Üniversitesi

    Bilgisayar Mühendisliği Bölümü

    DOÇ. DR. ADEM KARAHOCA

  5. Bir üniversite hastanesinde tüberkülozlu hastalardan izole edilen mycobacterium tuberculosis kompleks izolatlarının moleküler yöntemler ile genotiplendirilmesi

    Genotyping of mycobacterium tuberculosis complex isolates isolated from tuberculosis patients in A University Hospital by molecular methods

    NURCİHAN BİLTEKİN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    MikrobiyolojiMersin Üniversitesi

    Farmasötik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ MAHMUT ÜLGER