Kuartz kristal mikrobalans ile DNA hibridizasyon tayini ve bazı maddelerin DNA ile etkileşiminin biyosensörlerle algılanması
Determination of DNAhybridization by quartz crystal microbalance and sensation of interactions of some substances with DNA by biosensors
- Tez No: 229935
- Danışmanlar: PROF. DR. MEHMET ŞENGÜN ÖZSÖZ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Eczacılık ve Farmakoloji, Biotechnology, Pharmacy and Pharmacology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2008
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ege Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Analitik Kimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 158
Özet
Bu tez çalışması iki farklı sistem ve konuyu içermektedirBirinci çalışmada; bazı maddelerin çift sarmal DNA ile Grafit Kalem Elektrot (PGE) yüzeyinde, Diferansiyel Puls Voltametrisi (DPV) kullanılarak guanin yükseltgenme sinyali ve eğer varsa madde sinyallerine dayanarak çalışılmıştır. Yenilenebilir kalem elektrotla, madde konsantrasyonu ve madde etkileşim süresi gibi deney parametreleri değiştirilerek çalışıldı. Etkileşim, elektrot yüzeyi ve çözelti ortamında olmak üzere iki farklı yöntemle gerçekleştirildi. Bu çalışmalar bize; madde-DNA etkileşim süresi ve madde konsantrasyonu arttıkça guanin yükseltgenme sinyalinin düştüğünü gösterdi. Etkileşim sonrası guanin bazına ait yükseltgenme sinyalindeki bu düşüş guanin bazının hasara uğradığını göstermektedir. Ayrıca madde sinyalinde de etkileşim sonrasında düşüş gözlemlenmiştirSonuç olarak yapılan birinci çalışmada; DNA ile etkileşim gösteren voltametrik özellikli birçok maddenin kemoterapi uygulamalarında kullanılabileceği gözlemlenmiştir. Böylece yeni sentezlenmiş maddelerin DNA ile etkileşim mekanizmalarının aydınlatılması, doğal ilaç tasarımında faydalı olacaktır.İkinci çalışmada bir piezoelektrik sistem olan Kuartz Kristal Mikrobalans (QCM) kullanıldı. Bu yöntem kütleye duyarlı bir yöntemdir. Altın yüzeye iki şekilde ss DNA bağlayarak biyosensör tasarlandı. Birinci yöntemde direk SH-modifiye ss DNA gönderilerek, ikinci yöntemde çeşitli kimyasal bağlama ajanları kullanılarak yüzey kaplandıktan sonra ss DNA bağlandıİkinci çalışmada sonuç olarak DNA hibridizasyonu gerçekleştirildi. Hibridizasyon basamakları gerçek zamanlı olarak izlendi. Hastalık teşhisi, bakteri ve virüs tespiti gibi çalışmalarda, QCM yüksek duyarlıklı bir sistemdir.
Özet (Çeviri)
This thesis includes two different systems and subjectsIn the first study; interaction of some substances with fish sperm double-stranded DNA was studied electrochemically rely on the oxidation signals of guanine and signals of substances (if they have) by using Differential Pulse Voltammetry (DPV) with Pencil Graphite Electrode(PGE) was studied. The changes of experimental parameters were performed as the concentration, accumulation time of substance by using renewable pencil graphite electrode. The electrochemical procedure for the detection of interaction is based on two methods as; interaction at electrode surface and interaction at solution phase. It was shown that; after the interaction of substance and DNA oxidation signals of guanine was appeared to be reduced when the accumulation time and concentration of substance were increase. The oxidation signals after interaction of subtance and DNA were indicated there could be damage to guanine bases. Also we have detected that some of these substances had oxidation signals. These signals have decreased after interaction with DNAAs a result; detecting the voltammetric behavior of several substances that interact with DNA would be valuable in the design of sequence-specific DNA binding molecules for application in chemotherapy. Progress in this laboratory is towards the goal of determining the voltammetric behavior of newly synthesized substances with DNA, thus introducing the electrochemical methods to solve the phenomenal drug-DNA interaction mechanismsIn the other study; the system which is a piezoelectric, Quartz Crystal Microbalance (QCM) was used. This method is intended for mass sensitive. The biosensors were designed with two procedures of immobilization onto gold electrode. First procedure was directly immobilization SH-modified ssDNA, second procedure was immobilization NH-modified ss DNA after coated various binding agentsFinally in second study DNA hybridization was determined both of two procedures. The hybridization was observed at the same time. QCM is a high sensitive system for diagnosis of disease, bacteria and virus.
Benzer Tezler
- Altın nanopartiküllerin üretim ve bu partiküllerin kuartz kristal mikrobalans sisteminde kullanımı
Production of gold nanoparticles and it's use in quartz crystal microbalance sistem
AMİR PARVİZ FARSHCHY TABRİZİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2005
BiyomühendislikHacettepe ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. HAKAN AYHAN
- Etiketsiz aptamer immobilizasyonu için yeni bir yöntemin araştırılması
Investigation of a novel technique for ?tag-free? aptamer immobilization
OZAN SELVİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2009
BiyolojiHacettepe ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET MUTLU
- Centri-voltammetric molybdenum determination and electrochemical polyoxomolybdate formation and its characterization
Santri-voltammetrik molibden tayini ve elektrokimyasal polioksomolibdat oluşumu ve karakterizasyonu
SÜLEYMAN KOÇAK
- Memeli hücrelerinin farklı substrat yüzeyler üzerine adezyonunun kuartz kristal mikrobalans sistemi ile eş-zamanlı belirlenmesi
Real-time determination of the adhesion of mammalian cells on different substrate surfaces by quartz crystal microbalance system
ŞÜKRAN ŞEKER
- Kuartz kristal yüzeyine protamin immobilizasyonu
Immobilization of protamine to the surface of quartz crystal
SEMİHA İREM AKAY
Yüksek Lisans
Türkçe
2009
BiyomühendislikBaşkent ÜniversitesiBiyomedikal Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MUSTAFA KOCAKULAK
