Genomic profiling of microRNAs regulating translation in Drosophila melanogaster embryos
Drosophila melanogaster embriyolarında translasyonu düzenleyen mikroRNAların genomik profillenmesi
- Tez No: 233476
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. BÜNYAMİN AKGÜL
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Biyoloji, Genetics, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2008
- Dil: İngilizce
- Üniversite: İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü
- Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
mikroRNAlar protein sentezini negatif olarak kontrol eden ve transkripsiyon sonrası gen ifadelenmesinde öncül rol oynayan 21-23 nükleotid uzunluğunda olup küçük RNAlar sınıfında yer almaktadırlar. mikroRNAlar pekçok filumda metabolik olayları, hücrelerin kaderini belirleyen olayları, hücre ölümü ve gelişimi gibi olayları düzenlerler.Bu çalışmanın amaçları arasında microRNAlar tarafından düzenlenen translasyonal regülasyon mekanizmasını, gelişim açısından önemli olan mikroRNAları translasyonal statülerine gore profilleyerek aydınlatmaya çalışmak ve Drosophila embryogenezini model alarak translasyonu regüle eden yeni mikroRNAlar tanımlamak yer almaktadır. Farklı embryonal dönemlere ait örneklerden RNA saflaştırma işlemi sonrasında fraksiyonlara ayrılmış RNAlar mikroRNA mikroerey yöntemi ile analiz edildi. Ön sonuçlar 9 adet mikroRNA'nın iki embriyonal zamanda da var olduğunu göstermekte iken 60 tanesi 8 saatlik dilimde yoğunlaşmış durumdadır. Ayrıca her iki zaman dilimine ait embriyoların tüm RNA fraksiyonlarında 2 adet mikroRNA bulunmaktadır. Çoğu mikroRNA'nın geç embriyonal zamanda ifade edildiği ve farklı zamanlara ait embryoların RNA fraksiyonlarında mikroRNA profillerinin değişim göstermediği çıkarımı yapılabilir. Mikroerey analizinden elde edilen ön sonuçlara dayanarak mikroRNAların protein sentezini başlangıçtan önce ve başlangıç sırasında etkileyebileceği öne sürülebilir. Daha sonra yapılacak analizler ön sonuçları doğruluğunu kuvvetlendirecektir.
Özet (Çeviri)
Among the small RNAs, microRNAs are a particular class of 21 to 23 nucleotide RNAs that negatively regulate translation and play a pivotal role in post-transcriptional gene expression. microRNAs are found in many phyla that control such diverse events as metabolism, cell fate, cell death and development.The aim of this study is to investigate molecular mechanism of miRNA-mediated translational regulation by profiling developmentally important microRNAs according to their translational status and to identify new microRNAs that have roles in translational regulation during the embryogenesis of Drosophila. Following RNA purification from different embryonal stages the fractionated RNAs were analyzed by microRNA microarray. Preliminary results show that 9 miRNAs were expressed in both stages whereas 60 miRNAs were accumulated in RNA fractions of 8 hour embryos. Also there are 2 miRNAs in all fractions of both stages in Drosophila embryos. It can be concluded that most of them were expressed in late embryonal development and there does not appear to be a switch in microRNA profiles in fractions for different stages of embryos. The preliminary results suggest that microRNAs may suppress protein synthesis at pre-initiation and initiation phases based on the microarray data. Further studies are required to solidify the preliminary findings.
Benzer Tezler
- Herpes simplex tip 1 viruslara ait DNA'ların izolasyonu ve biyolojik aktivitelerinin saptanması
Başlık çevirisi yok
PERVİN DİNÇER
Yüksek Lisans
Türkçe
1988
MikrobiyolojiHacettepe ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. ŞÜKRİYE AYTER
- Human factor VIII HindIII RELP: Genotypic distrubution and use for carrier detection of hemophilia a in the Turkish population
Başlık çevirisi yok
YEŞİM GÖKMEN
Yüksek Lisans
İngilizce
1990
Tıbbi BiyolojiBoğaziçi ÜniversitesiMoleküler Biyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. NEJAT EĞİLMEZ
- Cloning and expression of glucose oxidase gene from aspergillus niger NRRL-3
Başlık çevirisi yok
FADEL AKRAM SHARİF
- The Molecular basis of beta-thalassemia in Turkey
Başlık çevirisi yok
HİLMİ ÖZÇELİK
Doktora
İngilizce
1991
Tıbbi BiyolojiBoğaziçi ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. A. NAZLI BAŞAK
- Sıçan beyni glutamat reseptör bağlanması üzerine lateralite, cinsiyet, östrus döngüsü ve kronik stresin etkileri
Başlık çevirisi yok
LÜTFİYE KANIT
- Virüslerin moleküler hibritleme tekniği ile belirtiminde tütün mozaik virüsü modeli
Başlık çevirisi yok
TİJEN TALAS