Genomic profiling of microRNAs regulating translation in Drosophila melanogaster embryos
Drosophila melanogaster embriyolarında translasyonu düzenleyen mikroRNAların genomik profillenmesi
- Tez No: 233476
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. BÜNYAMİN AKGÜL
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Genetik, Biology, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2008
- Dil: İngilizce
- Üniversite: İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü
- Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 46
Özet
mikroRNAlar protein sentezini negatif olarak kontrol eden ve transkripsiyon sonrası gen ifadelenmesinde öncül rol oynayan 21-23 nükleotid uzunluğunda olup küçük RNAlar sınıfında yer almaktadırlar. mikroRNAlar pekçok filumda metabolik olayları, hücrelerin kaderini belirleyen olayları, hücre ölümü ve gelişimi gibi olayları düzenlerler.Bu çalışmanın amaçları arasında microRNAlar tarafından düzenlenen translasyonal regülasyon mekanizmasını, gelişim açısından önemli olan mikroRNAları translasyonal statülerine gore profilleyerek aydınlatmaya çalışmak ve Drosophila embryogenezini model alarak translasyonu regüle eden yeni mikroRNAlar tanımlamak yer almaktadır. Farklı embryonal dönemlere ait örneklerden RNA saflaştırma işlemi sonrasında fraksiyonlara ayrılmış RNAlar mikroRNA mikroerey yöntemi ile analiz edildi. Ön sonuçlar 9 adet mikroRNA'nın iki embriyonal zamanda da var olduğunu göstermekte iken 60 tanesi 8 saatlik dilimde yoğunlaşmış durumdadır. Ayrıca her iki zaman dilimine ait embriyoların tüm RNA fraksiyonlarında 2 adet mikroRNA bulunmaktadır. Çoğu mikroRNA'nın geç embriyonal zamanda ifade edildiği ve farklı zamanlara ait embryoların RNA fraksiyonlarında mikroRNA profillerinin değişim göstermediği çıkarımı yapılabilir. Mikroerey analizinden elde edilen ön sonuçlara dayanarak mikroRNAların protein sentezini başlangıçtan önce ve başlangıç sırasında etkileyebileceği öne sürülebilir. Daha sonra yapılacak analizler ön sonuçları doğruluğunu kuvvetlendirecektir.
Özet (Çeviri)
Among the small RNAs, microRNAs are a particular class of 21 to 23 nucleotide RNAs that negatively regulate translation and play a pivotal role in post-transcriptional gene expression. microRNAs are found in many phyla that control such diverse events as metabolism, cell fate, cell death and development.The aim of this study is to investigate molecular mechanism of miRNA-mediated translational regulation by profiling developmentally important microRNAs according to their translational status and to identify new microRNAs that have roles in translational regulation during the embryogenesis of Drosophila. Following RNA purification from different embryonal stages the fractionated RNAs were analyzed by microRNA microarray. Preliminary results show that 9 miRNAs were expressed in both stages whereas 60 miRNAs were accumulated in RNA fractions of 8 hour embryos. Also there are 2 miRNAs in all fractions of both stages in Drosophila embryos. It can be concluded that most of them were expressed in late embryonal development and there does not appear to be a switch in microRNA profiles in fractions for different stages of embryos. The preliminary results suggest that microRNAs may suppress protein synthesis at pre-initiation and initiation phases based on the microarray data. Further studies are required to solidify the preliminary findings.
Benzer Tezler
- Düşük vakalarında plasenta ve anne serumunda mikroRNA profilin karşılaştırılması
Comparison of placental and maternal serum microRNA profile in miscarriage
MOHAMMADKAZEM HOSSEINI
Doktora
Türkçe
2016
Genetikİstanbul ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. TUBA GÜNEL
- Integration of multi-omics data for enlightening the molecular mechanisms of cancer: a case study on breast cancer subtype identification
Kanserin moleküler mekanizmalarını aydınlatmak için multi-omik verilerin entegrasyonu: meme kanseri alt tip tanımlaması üzerine bir vaka çalışması
MİRAY ÜNLÜ YAZICI
Doktora
İngilizce
2023
Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve KontrolAbdullah Gül ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ BURCU GÜNGÖR
- Genome-wide microRNA identification in drought tolerant wild emmer wheat: Assesment of antimicrobial activity of surface active antimic agent on raw fruit and vegetable packaging
Kuraklığa dirençli yabani buğday genomunda mikroRNA tesbiti: Yüzey aktif antimikrobiyal antimic ürününün yaş meyve ve sebze paketlemede etkinliğinin değerlendirilmesi
REYYAN FATİMA BULUT
Yüksek Lisans
İngilizce
2016
GenetikSabancı ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HİKMET BUDAK
- Menengiomalarda mirna-21, mirna107, mirna137 ve mirna-29b ekspresyonu
Menengi̇omalarda mirna-21, mirna107, mirna137 ve mirna-29b ekspresyonu
SALİM KATAR
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2016
NöroşirürjiSağlık BakanlığıBeyin ve Sinir Cerrahisi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ADEM YILMAZ
- Anaplastik Tiroid Kanserinde BRAF, NRAS, TERT, TP53 genleri için somatik mutasyon analizi
BRAF, NRAS, TERT, TP53 gene expression analysis in Anaplastic Thyroid Carcinoma
MESUDE ANGIN
Doktora
Türkçe
2024
Endokrinoloji ve Metabolizma HastalıklarıEge ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. EMİN KARACA