Domateste demir kloruzuna toleransın haritalanmasında kullanılacak rekombinant saf hatlarda DNA izolasyonu ve AFLP optimizasyonu
DNA isolation and AFLP optimization in recombinant inbred lines used to map iron chlorosis tolerance in tomato
- Tez No: 233977
- Danışmanlar: DOÇ. DR. SUAT ŞENSOY
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Ziraat, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: AFLP, Domates, DNA izolasyonu, Kloroz, Rekombinant saf hat, AFLP, Chlorosis, DNA isolation, Recombinant inbred lines, Tomatoes
- Yıl: 2009
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Yüzüncü Yıl Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Bahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 46
Özet
Bu tez çalışmasında demir eksikliğine toleransları belirlenmiş olan, duyarlı ve tolerant ebeveynlerden elde edilmiş resiprokal saf hatların, AFLP yöntemi ağırlıkta olmak üzere, bağlantı haritaları oluşturulmadan önce DNA izolasyonu yapılarak uygun PZR reaksiyon şartları ve gümüş nitrat tekniğiyle etkin bir şekilde görüntülenebilme etkinliklerini belirlemek amaçlanmıştır. Bu tezden elde edilecek ön bilgiler ışığında domateste rekombinant saf hatlar kullanarak Fe eksikliğine toleransta etkili QTL'leri içeren bir genetik harita ortaya çıkarılmasının ön adımı atılmış olacaktır. Domateste Roza x 227/1 ve 227/1 x Roza resiprokal melezlemelerinden elde edilen 224 adet rekombinant saf hattan (107 A hattı ve 117 B hattı) DNA izolasyonu, CTAB'lı ve ticari bir kitin prosedürüne göre olmak üzere iki farklı yöntemle yapılmış ve ebeveynler kullanılarak moleküler AFLP ön çalışmaları gerçekleştirilmiştir.Çalışmada denenen 64 primer çiftinden 57 tane primer çifti olumlu sonuç vermiştir. Sonuç veren 57 primer çiftinden 1535 toplam bant ve yaklaşık 126 polimorfik bant elde edilmiştir. Denenen primer kombinasyonlarının toplam okunabilir bant sayıları genelde beklenen düzeyde çıkmıştır. Ebeveyn hatlar arasındaki polimorfizm (%8,27) tür içi melezleme olması nedeniyle, beklediğimiz düzeyden az fakat yeterli düzeyde çıkmıştır.
Özet (Çeviri)
This thesis aimed to isolate DNA and to optimize PCR reaction -basically with AFLP- and silver nitrate visualization in recombinant inbred lines obtained from tolerant and intolerant parents which will be used to molecularly map quantitative trait locus related to iron chlorosis tolerance in tomato. The information obtained from this thesis will be the first step used to molecularly map quantitative trait locus related to iron chlorosis tolerance in tomato. DNAs of 224 recombinant inbred lines (107 A lines and 117 B lines) from reciprocal crosses from (A line: Roza x 227/1 and B line: 227/1 x Roza) were isolated with two methods- one with CTAB and one with a commercial kit- and pre-AFLP works were done by using parents.Of the tried 64 primer combinations, 57 gave encouraging results. Total and polymorphic band numbers of these 57 primer combinations were 1535 and 126, respectively. Total band numbers from the primer combinations were a predictive level. Polymorphism (8.27 %) between parents was low, but adequate when considering intra-specific cross.
Benzer Tezler
- Domateste dayanıklı ve duyarlı genotiplerin melezlenmesinden elde edilen saf hatlarda demir (Fe) eksikliğine tolerans
Iron (Fe) deficiency tolerance in tomato recombinant inbreed lines obtained from resistant and sensitive genotypes
MAHMUT BAYRAM
- Domateste demir eksikliğine dayanıklılığın morfolojik, fizyolojik ve genetiksel açıdan incelenmesi
Morphological, physiological and genetic studies in tomato under iron (Fe) deficiency conditions
HAYRİYE YILDIZ DAŞGAN
Doktora
Türkçe
1999
ZiraatÇukurova ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. KAZIM ABAK
PROF. DR. İSMAİL ÇAKMAK
- Domates, biber, patlıcan ve karpuzda tohum çimlenme hızının fide kalitesine etkisi
The effect of germination rate on seedling quality in tomato, pepper, aubergine and watermelon seeds
NURTEN LÖKOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2010
ZiraatAnkara ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İBRAHİM DEMİR
- Domateste (Solanum lycopersicum L.) potasyum, salisilik asit ve humik asit uygulamalarının Fusarium solgunluğuna (Fusarium oxysporum f.sp. lycopersici), bitki gelişimi ve besin elementi alımına etkileri
Effects of potassium, salicylic acid and humic acid applications on Fusarium wilt (Fusarium oxysporum f.sp. lycopersici), plant growth and nutrient uptakes in tomato (Solanum lycopersicum l.)
EFDAL GÜLSER
Yüksek Lisans
Türkçe
2010
BiyomühendislikYüzüncü Yıl ÜniversitesiToprak Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SEMRA DEMİR
PROF. DR. ŞEFİK TÜFENKÇİ
- Bazı sebzelerin B1, B2 ve B3 vitamini değerlerinin in vitro gastrointestinal sistemde biyoerişilebilirliğinin incelenmesi
Vitamin B1, B2 and B3 values of some vegetables in the in vitro gastrointestinal system investigation of bioaccessibility
BÜŞRA DEMİR
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
Beslenme ve Diyetetikİstanbul Sabahattin Zaim ÜniversitesiBeslenme ve Diyetetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MUSTAFA YAMAN