Bazı laktobasil suşlarının genetik tanısının yapılması ve faj dirençliliklerinin belirlenmesi
Genetically identification of some lactobacilli strains and determination of their phage resistances
- Tez No: 234172
- Danışmanlar: PROF. DR. AYNUR GÜL KARAHAN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Mikrobiyoloji, Genetik, Microbiology, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2009
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Süleyman Demirel Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu çalışmada insan dışkı örneklerinden izole edilmiş ve probiyotik olma özelliklerinden bazıları test edilmiş laktik asit bakterilerinin 16S rRNA dizi analizleri ile tanımlamaları gerçekleştirilmiştir. Genetik tanının yanı sıra Fourier Transform Infrared (FTIR) Spektroskopi yönteminin uygulanabilirliği ve izolatların teknolojik açıdan üretime elverişliliğinde faj dirençlilik özellikleri araştırılmıştır.Araştırma sonucunda tanısı gerçekleştirilen 116 adet laktik asit bakterisinin 16S rRNA dizi analizlerine göre 2 farklı cins ve 4 farklı türe ait olduğu belirlenmiştir. Bakterilerin 21 adedi Lactobacillus plantarum, 15 adedi L. fermentum, 79 adedi Enteroccoccus faecium ve 1 adedi E. durans olarak adlandırılmıştır.FTIR ile tanı amacıyla ise 21 adet L. plantarum, 15 adet L. fermentum, 25 adet E. faecium kullanılmıştır. FTIR okumaları 4000-450 cm-1 bölgelerinde gerçekleştirilmiştir. Absorbans değerleri 4000-450, 3000-2700 ve 1600-800 cm-1 olmak üzere üç farklı gruba ayrılarak, varyans, kümeleme ve adımsal tanımlama analizi ile değerlendirilmiştir. Araştırma sonucunda, FTIR spektroskopisinin L. plantarum, L. fermentum ve E. faecium'un tanısında başarı ile kullanılabileceği belirlenmiştir.Faj çalışmalarında ise öncelikle lizogenik suşların belirlenmesi amacıyla Mitomisin C ve UV ile laktobasil suşlarına indüksiyon uygulanmıştır. Mitomisin C indüksiyonu 0,2 ve 0,5 µg/ml konsantrasyonlarla denenmiştir. Yapılan araştırmada indüklenen bakterilerde lizogeni gözlemlenmemiştir.Litik fajların izolasyonu için turşu, siyah zeytin salamurası, peynir ve yoğurt kültürü, çiğ süt, ekşi hamur, ahır toprağı, göl ve deniz suyu, kanalizasyon örneği ve sağlıklı birey gaytası olmak üzere toplam 58 farklı örnek kullanılmıştır. Ekşi hamur dışındaki örnekler için 6 adet L. plantarum ve 6 adet L. fermentum, ekşi hamur örnekleri için ise 15 adet L. fermentum kullanılmıştır. Ancak izolasyon materyali olarak kullanılan örneklerde litik faja rastlanmamıştır.
Özet (Çeviri)
In this study, lactic acid bacteria isolated from human feces samples were evaluated for some potential probiotic properties and identified by using 16S rRNA sequencing analysis. Fourier Transform Infrared (FTIR) Spectroscopy was also applied as an identification method along with genetical identification. The phage resistance properties of isolates having probiotic properties were also investigated for possible industrial production purposes.The results of 16S rRNA sequencing analysis indicated that 116 lactic acid bacteria were belong to two different genus and four different species. Out of 116 bacteria, 21 L. plantarum, 15 L. fermentum, 79 E. faecium and 1 E. durans were identified.Twenty one strains of L. plantarum, 15 of L. fermentum and 25 of E. faecium isolates were used in FTIR analysis. Spectra were recorded between 4000-450 cm-1. Spectra on 4000-450, 3000-2700 and 1600-800 cm-1 spectral windows were evaluated by variance, cluster and stepwise analysis. Results showed that FTIR spectroscopy can be used successfully for discriminating L. plantarum, L. fermentum and E. faecium.Lactobacilli strains were induced with Mitomicin C and UV application for the purpose of determining lysogenic strains. Induction of Mitomicin C was applied in 0,2 and 0,5 µg/ml concentrations. Lysogeny was not observed in bacteria induced by both Mitomicin C and UV.Total of 58 samples including pickle, black olive brine, cheese and yogurt starter culture, raw milk, sour dough, barn soil sample, lake and sea water, sewage and faeces of healthy people were used for isolation of lytic phages. Six strains of L. plantarum and L. fermentum were used as sources for isolating lactobacilli phages from all samples except sour dough. 15 strains of L. fermentum were also used for isolating lactobacilli phages from sour dough samples. However, lytic phages were not determined in any of the 58 different samples.
Benzer Tezler
- Genetik karakterizasyonu yapılmış çeşitli laktik asit bakterilerinin bazı özeliklerinin belirlenmesi
Determination of some characteristics of various genetically characterized lactic acid bacteria
EDİBE RABİA ÖZKAN
Doktora
Türkçe
2021
Gıda MühendisliğiSelçuk ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NİHAT AKIN
- Evaluation of probiotic activity of lactobacillus casei strains
Lactobacillus casei bakterisinin probiyotik aktivitesinin degerlendirilmesi
BÜŞRA AKTAŞ MANSUROĞLU
Doktora
İngilizce
2015
BiyoteknolojiUnıversıty Of Wısconsın-MadısonGıda Bilimleri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. JAMES L STEELE
- Salamura beyaz peynirden izole edilen bazı laktokok, enterekok ve laktobasil suşlarının proteolitik aktivite, bakteriyosin etkenliği ve biyogen amin oluşumu açısından karşılaştırılması
A Comparative study on proteolytic activity, bacteriocin efficiency and biogenic amine formation of some lactoccucus enteroccoccus and lactobacillus strains isolated from white pickled cheese
FÜGEN DURLU ÖZKAYA
Doktora
Türkçe
2001
Gıda MühendisliğiAnkara ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NEZİHE TUNAİL
- Peynir suyu laktoz permeatının mikrobiyolojik besiyerlerinde kullanılabilirliği
The Utilization of whey lactose permate in microbiological media
REMZİYE YILMAZ
- Doğal fermente gıdalar ve anne sütünden enterokokların izolasyonu, karakterizasyonu ve bunların probiyotik kültür olarak kullanılabilme potansiyelinin araştırılması
Isolation and characterization of enterococci from naturally fermented foods and human milk and investigation of their usage potential as probiotic culture
SİNE ÖZMEN TOĞAY
Doktora
Türkçe
2010
Gıda MühendisliğiHacettepe ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYHAN TEMİZ