Bitki patojenleri Pectobacterium carotovorum, Pectobacterium atrosepticum ve Erwinia amylovora'da SpoT proteininin western blot yöntemi ile araştırılması
Investigation of the SpoT protein in plant-pathogenes Pectobacterium carotovorum, Pectobacterium atrosepticum and Erwinia amylovora by the method of western blot
- Tez No: 237317
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. FATMA FİLİZ ARI
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2009
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Süleyman Demirel Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bakteriler besinsel strese adaptasyon sağlayan ?Çevresel Strese Cevap = Stringent Response? adı verilen bir mekanizmaya sahiptir. Gram negatif bakterilerde bu mekanizmayı kontrol eden ve RelA enzimi tarafından sentezlenen (p)ppGpp molekülü besin stresi ortadan kalktığında da SpoT enzimi tarafından yıkıma uğrar. Pectobacterium türleri patates, havuç ve soğan gibi ekonomik bitkilerde yumuşak çürüklük ve karabacak hastalıklarına ve Erwinia amylovora elma, armut ve ayva gibi meyve ağaçlarında ateş yanıklığı hastalığına neden olan önemli bitki patojenleridir. P. atrosepticum'un spoT dizilimi bilinmesine rağmen bu Gram negatif bakterilerin hiç birinde SpoT proteininin tanımlanması henüz yapılmamıştır.Bu çalışmada önce, P. atrosepticum SCRI1043 suşunun spoT gen dizisine göre tasarlanan özgün primerler kullanılarak, P. carotovorum'da 599 baz çiftlik bir bölgesi Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PZR) ile çoğaltılmıştır. Dizi analizi ve BLAST araştırması PZR ürünün P. atrosepticum'daki ilgili bölge ile %93 oranında homolog olduğunu göstermiştir. Daha sonra western immünoblot analizi ile P. carotovorum ve P. atrosepticum'da ilk kez SpoT proteininin varlığı ortaya konulmuştur. E. amylovora'da ise SpoT proteini saptanamamıştır.
Özet (Çeviri)
Bacteria have the ability to adapt nutritional stress by a mechanism called ?Stringent Response?. In Gram negative bacteria, control of this mechanism is achived by the (p)ppGpp molecule which is synthesized by RelA enzyme and hydrolized by SpoT enzyme upon relief of the nutritional stress. Pectobacterium species which are causing diseases named soft-rot and black-leg in economically important plants such as potato, carrot and onion, and E. amylovora which is causing fire blight disease in fruit trees such as apple, pear and quince, are important plant pathogens. While the sequence of P. atrosepticum spoT is known, SpoT protein has not been identified yet in none of these Gram negative bacteria.In this study, firstly, a 599 base pair DNA fragment of P. carotovorum was amplified by Polimerase Chain Reaction (PCR) using a pair of primers designed specifically based on P. atrosepticum SCRI1043 spoT gene sequence. The DNA sequencing and BLAST search revealed %93 homology between this PCR product and the related region of P. atrosepticum. The presence of SpoT protein was then shown for the first time in P. carotovorum and P. atrosepticum using the method of western immunoblotting. The SpoT protein however could not be detected in E. amylovora.
Benzer Tezler
- Bitki patojenleri Pectobacterium carotovorum, Pectobacterium atroseptıcum ve Erwinia amylovora'da rela proteininin western blot yöntemiyle araştırılması
Investigation of the rela protein in plant-pathogens Pectobacterium carotovorum, Pectobacterium atrosepticum and Erwinia amylovora by the method of western blot
ŞULE ÜRÜN
Yüksek Lisans
Türkçe
2008
BiyolojiSüleyman Demirel ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. F. FİLİZ COŞKUN ARI
- Peyzaj düzenleme çalışmalarında kullanılan ve kullanılmaya uygun çeşitli taşların özellikleri ile İzmir ve yakın çevresinde bunlara ilişkin kaynaklar üzerinde araştırmalar
Başlık çevirisi yok
E. VECDİ KÜÇÜKERBAŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
1985
Peyzaj MimarlığıEge ÜniversitesiPeyzaj Mimarlığı Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. İLÇİN ASLANBOĞA
- Samsun ve çevresinde tarla sarmaşığı (conuolvulus arvensis L.)'na karşı biyolojik savaşa esas olacak fauna tespiti
Investigations on the insect fauna of the field binweed (Conuolvulus arvensis L.) related to its biological control in Samsun Province
YASEMİN UFUK GERMAN
- Marmara bölgesindeki kavun ve karpuz yetiştiriciliğinin bugünkü durumu, sorunları ve öneriler
The Status of melon and water melongrowing in Marmara region at present and its Problems and recommedations
MEHMET GÜLER