Geri Dön

Bitki patojenleri Pectobacterium carotovorum, Pectobacterium atrosepticum ve Erwinia amylovora'da SpoT proteininin western blot yöntemi ile araştırılması

Investigation of the SpoT protein in plant-pathogenes Pectobacterium carotovorum, Pectobacterium atrosepticum and Erwinia amylovora by the method of western blot

PDF İndir

  1. Tez No: 237317
  2. Yazar: FATİH YAPRAK
  3. Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. FATMA FİLİZ ARI
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2009
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Süleyman Demirel Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 67

Özet

Bakteriler besinsel strese adaptasyon sağlayan ?Çevresel Strese Cevap = Stringent Response? adı verilen bir mekanizmaya sahiptir. Gram negatif bakterilerde bu mekanizmayı kontrol eden ve RelA enzimi tarafından sentezlenen (p)ppGpp molekülü besin stresi ortadan kalktığında da SpoT enzimi tarafından yıkıma uğrar. Pectobacterium türleri patates, havuç ve soğan gibi ekonomik bitkilerde yumuşak çürüklük ve karabacak hastalıklarına ve Erwinia amylovora elma, armut ve ayva gibi meyve ağaçlarında ateş yanıklığı hastalığına neden olan önemli bitki patojenleridir. P. atrosepticum'un spoT dizilimi bilinmesine rağmen bu Gram negatif bakterilerin hiç birinde SpoT proteininin tanımlanması henüz yapılmamıştır.Bu çalışmada önce, P. atrosepticum SCRI1043 suşunun spoT gen dizisine göre tasarlanan özgün primerler kullanılarak, P. carotovorum'da 599 baz çiftlik bir bölgesi Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PZR) ile çoğaltılmıştır. Dizi analizi ve BLAST araştırması PZR ürünün P. atrosepticum'daki ilgili bölge ile %93 oranında homolog olduğunu göstermiştir. Daha sonra western immünoblot analizi ile P. carotovorum ve P. atrosepticum'da ilk kez SpoT proteininin varlığı ortaya konulmuştur. E. amylovora'da ise SpoT proteini saptanamamıştır.

Özet (Çeviri)

Bacteria have the ability to adapt nutritional stress by a mechanism called ?Stringent Response?. In Gram negative bacteria, control of this mechanism is achived by the (p)ppGpp molecule which is synthesized by RelA enzyme and hydrolized by SpoT enzyme upon relief of the nutritional stress. Pectobacterium species which are causing diseases named soft-rot and black-leg in economically important plants such as potato, carrot and onion, and E. amylovora which is causing fire blight disease in fruit trees such as apple, pear and quince, are important plant pathogens. While the sequence of P. atrosepticum spoT is known, SpoT protein has not been identified yet in none of these Gram negative bacteria.In this study, firstly, a 599 base pair DNA fragment of P. carotovorum was amplified by Polimerase Chain Reaction (PCR) using a pair of primers designed specifically based on P. atrosepticum SCRI1043 spoT gene sequence. The DNA sequencing and BLAST search revealed %93 homology between this PCR product and the related region of P. atrosepticum. The presence of SpoT protein was then shown for the first time in P. carotovorum and P. atrosepticum using the method of western immunoblotting. The SpoT protein however could not be detected in E. amylovora.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    237294

    Bitki patojenleri Pectobacterium carotovorum, Pectobacterium atroseptıcum ve Erwinia amylovora'da rela proteininin western blot yöntemiyle araştırılması

    Investigation of the rela protein in plant-pathogens Pectobacterium carotovorum, Pectobacterium atrosepticum and Erwinia amylovora by the method of western blot

    ŞULE ÜRÜN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2008

    BiyolojiSüleyman Demirel Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. F. FİLİZ COŞKUN ARI

  2. Tez No

    730652

    Konya ve Karaman illerindeki önemli patates ekim alanlarında karşılaşılan fungal ve bakteriyel hastalıkların belirlenmesi

    Determination of fungal and bacterial diseases encountered in major potato fields in Konya and Karaman provinces

    OSMAN TOKETTİ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    ZiraatHatay Mustafa Kemal Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SONER SOYLU

  3. Tez No

    705186

    Determination and identification of bacterial soft rot pathogens on potato tubers in Erbil province-Iraq

    Irak-Erbil ilinde patates yumrularında bakteriyel yumuşak çürüklük patojenlerinin belirlenmesi ve tanımlanması

    WALEED AHMED HAMADAMEEN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2021

    ZiraatVan Yüzüncü Yıl Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. AHMET AKKÖPRÜ

  4. Tez No

    488348

    Gümüş nanopartikül uygulamasıyla biber (Capsicum annuum) bakteriyel gövde ve meyve çürüklüğü etmeni Pectobacterium carotovorum kontrolü

    Application of silver nanoparticles for the control of pepper (Capsicum annuum) soft rot disease factor Pectobacterium carotovorum

    MELİSA AYIŞIĞI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    BiyolojiEge Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. LALE AKTAŞ

  5. Tez No

    879517

    Şeker pancarı (Beta vulgaris L.) rizosferindeki bakteriyel mikrobiyatanın belirlenerek metagenomun değerlendirilmesi ve yumuşak çürüklük etmenlerine karşı biyolojik mücadele olanaklarının araştırılması

    Evaluation of the metagenome by determining the bacterial microbiota in the rhizosphere of sugar beet (Beta vulgaris L.) and investigation of biological control possibilities against soft rot agents

    MUSTAFA ALPARSLAN UMARUSMAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    ZiraatSelçuk Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. KUBİLAY KURTULUŞ BAŞTAŞ

Geri Dön