Geri Dön

Bitki patojenleri Pectobacterium carotovorum, Pectobacterium atroseptıcum ve Erwinia amylovora'da rela proteininin western blot yöntemiyle araştırılması

Investigation of the rela protein in plant-pathogens Pectobacterium carotovorum, Pectobacterium atrosepticum and Erwinia amylovora by the method of western blot

PDF İndir

  1. Tez No: 237294
  2. Yazar: ŞULE ÜRÜN
  3. Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. F. FİLİZ COŞKUN ARI
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2008
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Süleyman Demirel Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 69

Özet

Mikroorganizmaların çoğu amino asit eksikliği, karbon kaynağı yokluğu veya besin azlığı gibi olumsuz çevre koşullarında yaşamlarını sürdürebilmek için ?Çevresel Strese Cevap? adı verilen özel bir mekanizmaya sahiptir. Bu mekanizma, RelA enzimi tarafından sentezlenen (p)ppGpp molekülü ile kontrol edilir. Tarımsal ve ekonomik öneme sahip bitkilerde ciddi hastalıklara sebep olan Pectobacterium carotovorum (havuç, patates ve soğanda ?yumuşak çürüklük?), Pectobacterium atrosepticum (patateste ?kara bacak?) ve Erwinia amylovora (elma, armut ve ayvada ?ateş yanıklığı?) Gram negatif fitopatojenlerdir. P. atrosepticum'un relA geni nükleotid dizilimi olmasına karşın, bu organizmaların hiç birinde RelA proteininin teşhisine yönelik bir bilgiye rastlanamamıştır.Bu çalışmada öncelikle, P. atrosepticum'a ait relA gen dizisinden tasarlanmış özgün primerler kullanılarak, P. carotovorum'da 569 bç.'lik bir DNA bölgesi PZR ile çoğaltılmıştır. PZR ürünü DNA dizi analizi, bu bölgenin P. atrosepticum'daki ilgili bölge ile %91 oranında homolog olduğunu göstermiştir. Daha sonra western immünoblot analizi ile P. carotovorum ve P. atrosepticum'da ilk kez RelA proteininin varlığı ortaya konmuştur. İlginç olarak E. amylovora'da RelA proteini saptanmamıştır.

Özet (Çeviri)

In order to survive unfavorable environmental conditions such as amino acid deficiency, carbon source depletion or nutrient limitation, the most of microorganizms have a special mechanism named ?Stringent Response?. This mechanism is controlled by the (p)ppGpp molecule, which is synthetize by RelA enzyme. Pectobacterium carotovorum, Pectobacterium atrosepticum and Erwinia amylovora are Gram negative phytopathogens causing serious diseases in agriculturally and economically important plants, ?soft-rod? in carrot, potato and onion, ?black leg?in potato and ?fire blight? in apple, pear and quince, respectively. While the nucleotide sequence of P. atrosepticum relA gen is available, we did not encounter any information about the detection of RelA protein in none of these organizms.In this study, firstly, a 569 bp. DNA fragment of P. carotovorum was amplified by using a pair of primers designed specifically based on the P. atrosepticum relA gene sequence. The DNA sequencing of this PCR product revealed a 91% homology with the related region of P. atrosepticum. The presence of RelA protein was then shown for the first time in P. carotovorum and P. atrosepticum using the metod of western immunoblotting. Interestingly, the RelA protein could not detected in E. amylovora.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    237317

    Bitki patojenleri Pectobacterium carotovorum, Pectobacterium atrosepticum ve Erwinia amylovora'da SpoT proteininin western blot yöntemi ile araştırılması

    Investigation of the SpoT protein in plant-pathogenes Pectobacterium carotovorum, Pectobacterium atrosepticum and Erwinia amylovora by the method of western blot

    FATİH YAPRAK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    BiyolojiSüleyman Demirel Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. FATMA FİLİZ ARI

  2. Tez No

    730652

    Konya ve Karaman illerindeki önemli patates ekim alanlarında karşılaşılan fungal ve bakteriyel hastalıkların belirlenmesi

    Determination of fungal and bacterial diseases encountered in major potato fields in Konya and Karaman provinces

    OSMAN TOKETTİ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    ZiraatHatay Mustafa Kemal Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SONER SOYLU

  3. Tez No

    705186

    Determination and identification of bacterial soft rot pathogens on potato tubers in Erbil province-Iraq

    Irak-Erbil ilinde patates yumrularında bakteriyel yumuşak çürüklük patojenlerinin belirlenmesi ve tanımlanması

    WALEED AHMED HAMADAMEEN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2021

    ZiraatVan Yüzüncü Yıl Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. AHMET AKKÖPRÜ

  4. Tez No

    488348

    Gümüş nanopartikül uygulamasıyla biber (Capsicum annuum) bakteriyel gövde ve meyve çürüklüğü etmeni Pectobacterium carotovorum kontrolü

    Application of silver nanoparticles for the control of pepper (Capsicum annuum) soft rot disease factor Pectobacterium carotovorum

    MELİSA AYIŞIĞI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    BiyolojiEge Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. LALE AKTAŞ

  5. Tez No

    879517

    Şeker pancarı (Beta vulgaris L.) rizosferindeki bakteriyel mikrobiyatanın belirlenerek metagenomun değerlendirilmesi ve yumuşak çürüklük etmenlerine karşı biyolojik mücadele olanaklarının araştırılması

    Evaluation of the metagenome by determining the bacterial microbiota in the rhizosphere of sugar beet (Beta vulgaris L.) and investigation of biological control possibilities against soft rot agents

    MUSTAFA ALPARSLAN UMARUSMAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    ZiraatSelçuk Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. KUBİLAY KURTULUŞ BAŞTAŞ

Geri Dön