Geri Dön

İnsan Xq21-Yp11.2 lokusunun akciğer kanseri ile ilgisi ve moleküler analizi

Molecular analysis of human Xq21-Yp11.2 locus with regard to polymorphism and lung cancer correlation

PDF İndir

  1. Tez No: 245517
  2. Yazar: SEVİLAY BARAK
  3. Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. EKREM DÜNDAR
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Genetik, Onkoloji, Biology, Genetics, Oncology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2009
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Balıkesir Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 89

Özet

Bu çalışmada insan cinsiyet kromozomlarında bulunan; biri X diğeri Y kromozomuna ait iki alelden oluşan bir lokusun polimorfizmiyle akciğer kanseri ilişkisi araştırılmış ve bu bölgenin moleküler analizi yapılmıştır.İlk bulgulara göre, daha önce yapılmış bir çalışmada anlamlı ve şaşırtıcı derecede yüksek olan korelasyonun, bu çalışma kapsamında yapılan analizler sonucunda yüksek olmadığı ancak beklenmedik derecede değişken olduğu tespit edilmiştir. Çalışılan DNA bölgesinin özellikle sağ ve sol kenarlarının çalışılan insan gruplarına göre oldukça farklı polimorfizme sahip olduğu tahmin edilmiş ve bu yüzden ilk çalışılan insan grubunda %100'e yakın başarı oranına sahip bir primer çifti optimize edilmiş olmasına rağmen daha sonraki çalışmalarda en az 4 primer çifti daha dizayn edilmiş ve kullanılmıştır. Bu anlamda oldukça ilginç olan bu DNA bölgesinin yaklaşık 250 nükleotit ilerisinde bir transpozonun bulunduğu yapılan biyoinformatik analiz sonucu ortaya çıkmış ve bu transposon biyoinformatik yönden analiz edilmiştir.Bu çalışmanın en önemli sonuçlarından birisi, iki farklı alelden oluşan bu lokusun, analiz edilen hiç bir bireyde kanserle korelasyon gösteren alel açısından homozigot durumda bulunmaması, dolayısıyla muhtemel bir letal genotipin tespit edilmiş olmasıdır. Bu tahminin testi için bu lokustaki her iki alel ayrı ayrı klonlanmış ve insan hücre hatlarına aktarılarak muhtemel promoter/enhanser potansiyelinin araştırılması için çalışmalar başlatılmıştır.ANAHTAR KELİMELER: Xq21, Yp11.2, akciğer kanseri, tek nükleotit polimorfizmi, transpozon, letal genotip.

Özet (Çeviri)

In this study, polymorhism of human Xq21 / Yp11.2 locus was determined and a molecular analysis with regard to lung cancer was conducted.A surprisingly high correlation between the polymorphism of this locus and lung cancer that was observed based on initial results, was disappeared when the subject group was expanded to different study groups. The left and right border of the DNA sequence was predicted to be highly polymorphic and hence a primer pair optimised with around 100% success did not work for different study groups. Therefore at least 4 more primer pairs were used to complete the polymorphism analysis of the aimed groups. About 250 nuclotides ahead of this highly unusual DNA sequence, a transposon was identified through bionformatic analysis.One of the most important results of this study was the absense of a homozygous genotype consisting of the cancer correlated allel, in all the individuals studied, which suggested a possible lethal genotype. To explore this possibility, both alleles of the locus were cloned, and investigations to test promoter / enhancer potentials of this sequence were started.KEYWORDS: Xq21, Yp11.2, lung cancer, single nucleotide polymorphism, transposon, lethal genotype.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    177867

    İnsan x kromozomu (Xq21) polimorfizminin bazı kanser tipleriyle ilişkisinin belirlenmesi

    Determination of the correlation between human x chromosome (Xq21) and some cancer types

    NURTEN ÇANAKÇI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    BiyolojiBalıkesir Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    Y.DOÇ.DR. EKREM DÜNDAR

  2. Tez No

    200406

    Molecular karyotyping of human hepatocellular carcinoma cell lines using single-nucleotide polymorphism arrays

    İnsan hepatoselüler karsinom hücre hatlarının tek nükleotid polimorfizm yongaları kullanılarak karyotiplendirilmesi

    KUBİLAY DEMİR

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2007

    Biyolojiİhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi

    Moleküler Biyokimya ve Genetik Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. M. CENGİZ YAKICIER

  3. Tez No

    16976

    İnsan

    Başlık çevirisi yok

    ORHAN KURMALI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1991

    Güzel SanatlarHacettepe Üniversitesi

    DOÇ. ZAFER GENÇAYDIN

  4. Tez No

    80251

    Meme dokusu karsinomlarında 7-etoksiresorufin O-deetilaz enzim aktivitesi düzeyinin araştırılması

    Başlık çevirisi yok

    SELMA AYGÖRMEZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1997

    Eczacılık ve FarmakolojiAnkara Üniversitesi

    Farmasötik Toksikoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MÜMTAZ İŞCAN

  5. Tez No

    80827

    İnsan gonadlarının intrauterin gelişiminin histolojik değerlendirilmesi

    Histological evaluation of the intrauterin development of human gonads

    MURAT TOSUN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    1998

    MorfolojiSelçuk Üniversitesi

    Histoloji ve Embriyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SELÇUK DUMAN

Geri Dön