Geri Dön

Analysis of LSAMP gene as a tumor suppressor in neuroblastoma

LSAMP geninin nöroblastomalarda tümör baskılayıcı olarak analizi

  1. Tez No: 246753
  2. Yazar: ATIL ÇAĞDAŞ SAYDERE
  3. Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. CENGİZ YAKICIER
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Genetik, Onkoloji, Biology, Genetics, Oncology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2009
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi
  10. Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 74

Özet

Nöroblastoma dünya çapında önemli morbidite ve mortaliteye sahip olup tüm çocukluk çağı tümörlerinin yaklaşık %10'unu oluşturmaktadır. Sıklıkla, 1 yaş altındaki çocuklarda, kendiliğinden gerileyerek ve iyi huylu bir tümör haline dönüşmektedir. Ancak, 1 yaş üzeri çocuklarda genellikle agresif davranır ve diğer organlara metastaz olur. Kaynağı bilinmeyen bu beklenmedik davranış tedavi uygulamalarını etkisiz hale getirir.Kromozom bölgesi 3q13.3 üzerinde bulunan limbik sistem ilişkili membran proteini geni (LSAMP) sinir hücrelerinin büyümesinde ve akson rehberliğinde görevlidir. Ayrıca, bir adezyon ve hücreler arası tanıma molekülü gibi davranır. Son yıllarda yapılan çalışmalarda çeşitli kanser türleriyle ilişkisi gösterilmiş ve potansiyel bir tümör baskılayıcı rolü önerilmiştir.Ayrıca LSAMP geni bölgesindeki markörlerin homozigot kayıplara uğradığı gösterilmiştir. Bu çalışma çerçevesinde, LSAMP geninin nöroblastomada olası bir tümör baskılayıcı rolü araştırıldı. 6 klinik hasta numunesi ve 2 nöroblastoma hücre hattı PCR yöntemi ile LSAMP gen kaybını ortaya çıkarmak için çalışıldı. 6 nöroblastoma doku kesitinde LSAMP protein düzeyindeki değişiklikleri belirlemek için immunohistokimya (İHK) uygulandı. Bir grup beyin tümöründe ifade analizi yapıldı. İki farklı hastada bu çabalar, olası bir LOH ve bir homozigot kayıp sonuçları olarak gözlemlendi. Kontrol grubuna göre tüm tümör örneklerinde LSAMP proteinin düşük seviyeleri kaydedildi. Beyin tümörlerinde LSAMP ifadesinde azalma belirlendi.Bu sonuçlara dayanarak, LSAMP tümör baskılayıcı adayı olarak nöroblastomada ve daha geniş anlamda sinir sistemi tümörlerinde önerilmektedir.

Özet (Çeviri)

Neuroblastoma constitutes approximately 10 % of all childhood tumors with a worldwide considerable morbidity and mortality. Frequently, in children under the age of 1, it can spontaneously regress and transform into a benign tumor. However, in children older than age of 1 the disease often behaves aggressively and metastasizes to other organs. This unpredictable behavior of unknown origin makes therapeutic applications ineffective.Limbic system associated membrane protein gene (LSAMP) functions in neurite growth, axonal guidance and acts as a cell adhesion and recognition molecule. Recent studies revealed its association to several cancer types and proposed a potential tumor suppressor role. Markers in the LSAMP gene region were also shown to be homozygously deleted in neuroblastoma. In the framework of this study, we investigated LSAMP gene in respect of its potential tumor suppressor role in neuroblastoma. 6 clinical patient samples and 2 neuroblastoma cell lines were studied via PCR methodology to detect any loss in LSAMP gene. Immunohistochemistry (IHC) was applied to 6 neuroblastoma tissue sections to determine protein level changes of LSAMP. Moreover, expression analysis in a set of brain tumors was performed. As a result of these efforts, one possible LOH and one homozygous deletion in two different patients were observed. Low levels of LSAMP protein in all of the tumor samples compared to controls were recorded. Downregulation of LSAMP in brain tumors was detected. Based on these results, LSAMP is suggested as a candidate tumor suppressor in neuroblastoma and in broader aspect for nervous system tumors.

Benzer Tezler

  1. Kan-iğne-yaralanma fobisindeki vazovagal senkopta genetik etiyolojinin araştırılması

    Investigation of genetic etiology in vasovagal syncope in blood-needle-injury phobia

    YANKI GEZER

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    GenetikHacettepe Üniversitesi

    Ruh Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SERTAÇ AK

  2. Microneedles for DNA extraction in plant studies

    Bitki çalışmalarında DNA ekstraksiyonu için mikroiğneler

    EMRE ECE

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    Biyoteknolojiİhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi

    Malzeme Bilimi ve Nanoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. FATİH İNCİ

  3. Çukurova bölgesindeki keratokonus olgularında VSX1 ve LOX genlerinin dizileme yöntemi ile analizi

    Sequencing analysis of VSX1 and LOX genes in cases with keratoconus in the Cukurova region

    ASTAN IBAYEV

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    Göz HastalıklarıÇukurova Üniversitesi

    Göz Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MELTEM YAĞMUR

  4. Identification of powdery mildew disease and genetic improvements in hazelnut

    Fındıkta külleme hastalığının tanımlanması ve genetik olarak iyileştirilmesi

    İPEK BİLGE

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2020

    BiyomühendislikSabancı Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET SELİM ÇETİNER

  5. Toz metalurjisi yöntemleri ile üretilen çeşitli W-Ni-Fe ve W-Ni-Cu ağır alaşımların mikroyapısal ve fiziksel karekterizasyonu

    Microstructural and physical characterization of various W-Ni-Fe and W-Ni-Cu heavy alloys manufactured via powder metallurgy methods

    GÜNKUT ERNAS

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1993

    Metalurji Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    DOÇ.DR. M. LÜTFİ ÖVEÇOĞLU