Simulated fMRI toolbox
FMRI simülasyonu uygulaması
- Tez No: 255613
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. DİDEM GÖKÇAY
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrol, Computer Engineering and Computer Science and Control
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2009
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Enformatik Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıp Bilişimi Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 71
Özet
Bu tez çalışmasında, farklı fonksiyonel manyetik rezonans görüntüleme analizi metodlarını karşılaştırmak ve değerlendirmek amacıyla simule edilmiş veri yaratmak için bir simule edilmiş fMRG uygulaması geliştirilmiştir. Bu uygulama, yüksek çözünürlüklü anatomik beyin görüntülerini yükleyebilme, anatomik beyin görüntüsü ile aynı veri alanında 4 boyutlu fMRG verisi yaratabilme ve kullanıcıya blok ve uyarana bağlı deney tasarımı yaptırabilme yeteneklerine sahiptir. Tarayıcı kayması, kalp atışları, alışma ve kafa hareketleri gibi sık görülen fMR görüntüleme parazitleri 4D fMRI verisi ile birleştirildi. Uygulamaya girdi MINC 2.0 dosya formatı ile mümkündür, çıktı ise ANALYZE formatı ile sağlanır. Bu uygulamanın en büyük katkısı, fMRI analiz metodlarının değişen gürültü ve deney parametreleri altında birbirinden farklı fMRG verisi yaratarak fMRG analiz metodlarının karşılaştırılmasını kolaylaştırmasıdır.
Özet (Çeviri)
In this thesis a simulated fMRI toolbox is developed in order to generate simulated data to compare and benchmark different functional magnetic resonance image analysis methods. This toolbox is capable of loading a high resolution anatomic brain volume, generating 4D fMRI data in the same data space with the anatomic image, and allowing the user to create block and event-related design paradigms. Common fMRI artifacts such as scanner drift, cardiac pulsation, habituation and task related or spontaneous head movement can be incorporated into the 4D fMRI data. Input to the toolbox is possible through MINC 2.0 file format, and output is provided in ANALYZE format. The major contribution of this toolbox is its facilitation of comparison of fMRI analysis methods by generating several different fMRI data under varying noise and experiment parameters.
Benzer Tezler
- Wavelet based deconvolution techniques in identifying fMRI based brain activation
fMRG tabanlı beyin aktivasyonlarının saptanmasında dalgacık dönüşümü teknikleri
EMİNE ADLI YILMAZ
Yüksek Lisans
İngilizce
2011
Elektrik ve Elektronik MühendisliğiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiElektrik-Elektronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYDAN ERKMEN
YRD. DOÇ. DR. DİDEM GÖKÇAY
- 3T MRI tarayıcıda Ag/AgCl elektrotların ısınma etkisi üzerine MR termografi ve benzetim çalışması
MR thermography and simulation study on the heating effects of the Ag/AgCl electrodes in a 3T MRI scanner
ABDULLAH KEPCEOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2012
Fizik ve Fizik MühendisliğiUludağ ÜniversitesiFizik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. CENGİZ AKAY
- Optimization and machine learning in MRI: Applications in rapid mr image reconstruction and encoding models of cortical representations
MRG'de optimizasyon ve makine öğrenimi: Hızlı mr görüntü rekonstrüksiyonu vebeyindeki temsillerin kodlama modellerine uygulanışı
MOHAMMAD SHAHDLOO
Doktora
İngilizce
2020
Elektrik ve Elektronik Mühendisliğiİhsan Doğramacı Bilkent ÜniversitesiElektrik-Elektronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. TOLGA ÇUKUR
- Analyzing effective connectivity of brain using FMRI data: DCM and PPI
FMRI verileri kullanılarak beyindeki etkili konnektivite analizi: DCM ve PPI
SİNA MOJTAHEDI
Yüksek Lisans
İngilizce
2013
BiyomühendislikOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyomedikal Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. UĞUR HALICI
PROF. DR. METEHAN ÇİÇEK
- Yüz ve kol transplantasyon ve kol skapular replantasyon hastalarında beyin plastisitesinin fmrg tabanlı analizi
Fmri based analysis of brain plasticity in face and arm transplantation and arm scapular replantation patients
AYHAN ŞAVKLIYILDIZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
Elektrik ve Elektronik MühendisliğiAkdeniz ÜniversitesiElektrik-Elektronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ÖMER HALİL ÇOLAK