Hastane enfeksiyonu etkeni pseudomonas aeruginosa suşlarının metallo-ß-laktamaz aktivitesinin fenotipik ve genotipik yöntemler ile saptanması
Phenotypic and genotypic identification of the metallo-ß-lactamase activity in nosocomial Pseudomonas aeruginosa strains
- Tez No: 256788
- Danışmanlar: DOÇ. DR. ATAÇ UZEL
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları, Mikrobiyoloji, Biotechnology, Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Pseudomonas aeruginosa, Metallo-ß-Laktamaz, BlaIMP, BlaVIM, Antibiyotik duyarlılık, Hastane enfeksiyonları, Pseudomonas aeruginosa, Metallo-ß-Lactamase, BlaIMP, BlaVIM, Antimicrobial susceptibility, Nosocomial infections
- Yıl: 2009
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ege Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 138
Özet
Pseudomonas aeruginosa klinik mikrobiyolojide en önemli nozokomiyal fırsatçı patojenlerden biridir. P. aeruginosa üriner sistem enfeksiyonları, menenjit, göz enfeksiyonları ve septisemi gibi ciddi hastane enfeksiyonlarına yol açmaktadır ve tedavi süreci için ciddi problemlere neden olan birçok antibiyotiğe karşı dirençlidir. Metallo-ß-Laktamazlar (MßL), tüm beta-laktam ajanlara karşı dirence neden olan enzimlerdir. P. aeruginosa'da MßL üretimi beta-laktamlara karşı dirençte hala ana mekanizmadır. Dolayısı ile, MßL'ların klinik mikrobiyolojide tanılanması oldukça önemlidir. Bu çalışmaya Tepecik Eğitim ve Araştırma Hastanesi'nde 2006'dan 2008'e kadar izole edilen 80 P. aeruginosa suşu dahil edilmiştir. İzolatlar; kan, idrar, balgam, yara, göz ve kulağı içeren çeşitli klinik materyallerden toplanmıştır. Klinik materyaller ayrıca, yoğun bakım ünitesi, cerrahi, ortopedi, yeni doğan ünitesi, nöroloji, üroloji, hemodiyaliz, dahiliye ve intaniyeyi içeren farklı bölümlerden toplanmıştır. E-test ve disk difüzyon metotları ile belirlenen P. aeruginosa izolatlarının duyarlılıkları üç antibiyotiğe karşı araştırılmıştır. Duyarlılık sonuçları, Klinik ve Laboratuar Standartları Enstitüsü'ne (CLSI) göre belirlenmiştir. Bu çalışmaya dahil edilen toplam 80 P. aeruginosa suşunun 28'i (%35) imipeneme (IMP) dirençli, 10'u (%12,50) IMP'e orta duyarlı, 27'si (%33,75) Sefeperazon-Sulbaktam'a (SCF) dirençli ve 23'ü (%28,75) Piperasilin-Tazobaktam'a (TZP) dirençlidir. Ayrıca MßL üretici suşlar IMP, TZP ve SCF'ye dirençli bulunmuştur. IMP'e direnç gösteren izolatların 26'sında (%32,50) MßL üretimi belirlenmiştir. P. aeruginosa klinik izolatları arasında MßL üretimini izlemek için double disk sinerji metodu kullanılmıştır. P. aeruginosa suşlarının 27'sinde (%33,75) MßL üretimi pozitif olarak bulunmuştur. MßL genlerini saptamak içn Multipleks PCR (Polimeraz zincir reaksiyonu) metodu kullanılmıştır. IMP'e dirençli ve orta duyarlı toplam 38 P. aeruginosa suşu analize alınmıştır. 80 izolat arasından, 8 (%10) P. aeruginosa suşunda MßL genleri (blaIMP and blaVIM) PCR ile saptanmıştır. P.aeruginosa izolatları arasındaki klonal ilişkiyi belirlemek amacıyla AP PCR gerçekleştirilmiştir. SPSS (13.00) analizine göre toplam 17 farklı küme belirlenmiştir. BlaIMP ve BlaVIM genlerini taşıyan toplam 8 P. aeruginosa izolatına ait amplikonlara dizi analilizi yapılmıştır. Amplikonların dizi homolojileri dizi veritabanlarında BLAST analizi ile araştırılmıştır. P.aeruginosa sınıf 1 integronu, E.coli sınıf 1 integronu, plazmidleri ve transpozonları ile homoloji saptanmıştır.
Özet (Çeviri)
Pseudomonas aeruginosa is one of the most important nosocomial opportunistic pathogens in the clinical microbiology. P. aeruginosa is leading serious nosocomial infections such as urinary system infections, meningitis, eye infections and sepsis and is resistant to many antibiotics causing serious problems for therapeutic process. Metallo-ß -Lactamases (MßL) are enzymes which cause resistance to all beta-lactam agents. The production of MßL is still the main mechanisms is resistance to beta-lactams in P. aeruginosa. Thereby, identification of MßL is very important in clinical microbiology. A total 80 P. aeruginosa strains were isolated from 2006 to 2008 at Tepecik Training and Research Hospital were included in the study. Isolates were collected from various clinical materials including blood, urine, sputum, wound, eye and ear. Clinical materials were also collected from diverse departments including intensive care unit, surgery, orthopaedics, new-born unit, neurology, urology, haemodialysis, internal medicine and infectious diseases. The susceptibility of P. aeruginosa isolates investigated against 3 antibiotics and determined by E-Test and disc diffusion methods. Susceptibility results were determined according to CLSI (The Clinical and Laboratory Standards Institute). ATotal Of the 80 P. aeruginosa strains included in this study 28 (35%) were resistant to IMP (Imipenem), 10 (12.5%) intermediate to IMP, 27 (33.75%) resistant to SCF (Sefaperazone-Sulbactam) and 23 (28.75%) resistant to TZP (Piperacillin-Tazobactam). MßL producer strains were also found resistant to IMP, TZP and SCF. MßL production was determined in the 26 (32.50%) isolates which were showed to resistance IMP. Double disc synergy method was used to screen MßL production among the P. aeruginosa clinical isolates. MßL producion was found as positive in 27 (33.75%) P. aeruginosa strains. Multiplex PCR (polymerase chain reaction) method were used for identifying MßL genes. A Total of 38 P. aeruginosa strains showed resistance and intermediate resistance to IMP were analyzed. MßL genes (blaIMP and blaVIM ) were determined in 8 (10%). P. aeruginosa strains among 80 isolates by PCR. To determine the clonal reletedness between the P. aeruginosa isolates AP PCR was carried on. A total of 17 different cluster were determined according to the SPSS (13.00) analysis. A total of 8 amplicons belonging to P. aeruginosa isolates which carried on blaIMP and blaVIM genes were sequenced. Sequence homology of the amplicons were searched at sequence databeses by BLAST analysis. Homology was determined with P. aeruginosa class 1 integron, E.coli class 1 integron, plasmids and transposons.
Benzer Tezler
- Pseudomonas aeruginosa suşlarında virülans faktörlerinin fenotipik yöntemlerle araştırılması
The investigation of virulence factors of pseudomonas aeruginosa isolates BY phenotypic methods
ZEHRA BÜŞRA ATCIYURT
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
MikrobiyolojiErciyes ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. DUYGU PERÇİN RENDERS
- Hastane enfeksiyonu etkeni pseudomonas aeruginosa suşları arasındaki klonal ilişkinin araştırılması
Investigation of clonal relatedness among the nosocomial pseudomonas aeruginosa isolates
AYŞE BİLGE SİPAHİ
- Klinik örneklerden izole edilen pseudomonas aeruginosa ve acinetobacter suşlarının antibiyotik duyarlılıklarının disk diffüzyon yöntemi ile araştırılması
Investigation of antibiotic susceptibilities of P. aeruginosa and acinetobacter strains isolated from clinical samples by disc diffusion techniques
AYNUR ÖZEN ÇELİK
Yüksek Lisans
Türkçe
2001
MikrobiyolojiFırat ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. ZÜLAL AŞÇI TORAMAN
- Yoğun bakım hastalarından izole edilen pseudomonas aerugınosa suşlarının moleküler epidemiyolojisi ve antibiyotik duyarlılığı
Investigation of antibiotic susceptibility and molecular epidemiology of pseudomonas aeruginosa strains isolated from intensive care unit patients
DEMET TİMUR
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2016
MikrobiyolojiErciyes ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ESMA KAYA
- Klinik pseudomonas aerugınosa izolatlarının antibiyotiklere duyarlılık durumu ve serotiplendirilmesi
Antibiotic susceptibilities and serotyping of clinical pseudomonas aeruginosa isolates
PINAR EKİNCİOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2012
MikrobiyolojiErciyes ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. DUYGU PERÇİN