Molecular characterization of Blumeria graminis f. sp. hordei using AFLP markers
Arpa Blumeria graminis f. sp. hordei izolatlarının AFLP markörleri kullanılarak moleküler karakterizasyonu
- Tez No: 259204
- Danışmanlar: PROF. DR. MAHİNUR AKKAYA
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2009
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 137
Özet
Külleme (Blumeria graminis f. sp. hordei ) arpada (Hordeum vulgare) hastalığa sebep olan bir zorunlu parazittir. Külleme arpadan elde edilen verimi çok büyük ölçüde azaltan, arpayı en tahrip edici patojenlerdendir. Arpadaki kaybı azaltabilmek ve hastalığı yenebilmek için, gerek hastalığı gerekse konağı inceleyen pek çok çalışma yapılmaktadır. Ancak patojenin çok hızlı evrim geçirebilme özelliği, mantar öldürücü gibi tarım ilaçlarının işlevsel kullanımı ya da ırka-özgü direnç geni taşıyan varyetelerle, duyarlı ancak yüksek verimli varyetelerin çaprazlaması ile dayanıklı ve yüksek verimli ırk elde edilmesi gibi faktörleri etkisiz hale getirmektedir. Patojen ile konağın arasındaki ilişkinin çalışma mekanizmasını anlayabilmek ve arpadaki verim kaybına uzun soluklu çözümler üretebilmek için moleküler yöntemler kullanılmalıdır.Bu çalışmada, Türkiye?de Çukurova Bölgesi?nden toplanan Türk Blumeria graminis f. sp. hordei varyeteleri, moleküler karakterizasyonu yapılmak üzere Çoğaltılmış Parça Uzunluk Polimorfizmi (ÇPUP) moleküler markör yöntemi ile incelenmiştir. Otuzsekiz örnek, sekiz virülens genleri önceden çalışılmış, evrensel ırklar ile analiz edilmiştir. ÇPUP çalışmaları LI-COR 4300 DNA Analizör cihazı ile yapılmıştır.Biyoinformatik çalışmalar NTSYS programı ile yapılmıştır. Bu Sayısal Taksonomi Sistemi?nin yardımı ile benzerlik, başkalık, gruplama, dendogram, iki-boyutlu dağılım grafiği, üç-boyutlu perspektif grafiği elde edilmiştir. Bu bilgilerin ışığında Türk Blumeria graminis f. sp. hordei varyeteleri üç gruba ayrılmıştır.Sonuç olarak, Türk Blumeria graminis f. sp. hordei varyetelerini çalışmak ve onları evrensel ırklarla karşılaştırmak, ilk kez Türk külleme varyetelerinin karakterizasyonu ve direnç genlerinin ters genetik yöntemler ile çalışılması için ön çalışma olması bakımından önemlidir.
Özet (Çeviri)
Blumeria graiminis f. sp. hordei (powdery mildew) is an obligate biotroph infecting hordeum vulgare (barley). It is one of the most devastating pathogens of barley, decreasing barley yield in great extent. In order to decrease barley loss, numerous studies are being conducted for overcoming the disease from the sides of both pathogen and host. However the pathogen is evolving very rapidly preventing the effective use of pesticides such as fungisides or development of resistant barley varieties by crossing race-specific resistance varieties, varieties having R genes, with susceptible but high yield producing varieties. In order to understand the mechanism of pathogen-host interactions, and producing enduring solutions for the problem of yield loss in barley molecular tools need to be used.In this thesis study, Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP) molecular marker method is used in order to reveal the molecular characterization of Turkish Blumeria graminis f. sp. hordei varieties collected from Çukurova region in Turkey. Thirty-nine samples were analyzed with eigth universal races, of which virulence genes are studied. AFLP studies were conducted on LI-COR 4300 DNA Analyzer system. Bioinformatics analysis was performed with NTSYS program. By the helpof this Numerical Taxonomic System, similarity, dissimilarity, clustering, dendograms, two-dimensional scatter plots, and three-dimensional perspective plots were obtained. By the light of these analyses Turkish Blumeria graminis f. sp. hordei varieties together with universal races are grouped into three clusteres.In conclusion, studying Turkish Blumeria graminis f. sp. hordei isolates and comparing them with universal races is a unique study in terms of characterizing the Turkish Bgh isolates for the first time, and can be used as a frontier study for studying Resistance genes, by reverse genetic tools.
Benzer Tezler
- Kayseri ilinde yetişen iğde (Elaeagnus angustifolia L.) genotiplerinin moleküler karakterizasyonu
Molecular characterization of russian olive (Elaeagnus angustifolia L.) genotypes grown in Kayseri province
BUKET ÇELİK KARADEMİR
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
GenetikOrdu ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. TURAN KARADENİZ
DOÇ. DR. AYDIN UZUN
- Mardi̇n yöresi̇ndeki̇ koyunlarda coenurus cerebrali̇s'i̇n moleküler karakteri̇zasyonu
Molecular characterization of coenurus cerebralis in sheep in mardin province of Turkey
BETÜL SÖNMEZ
- Ankara'daki çeşitli hastanelerde değişik yöntemler ile toksin pozitifliği saptanan dışkı örneklerinden elde edilen clostridium difficile izolatlarının toksin genlerinin araştırılması, pcr ribotiplendirimi ve ribotipler ile antimikrobiyal duyarlılıkları arasındaki ilişkinin ortaya çıkarılması
Molecular characterization of toxin genes in clostridium difficile isolates from toxin positivite stool samples obtained by different methods from several hospitals in ankara and association between PCR ribotypes and antimicrobial susceptibility among clostridium difficile isolates
EMRAH SALMAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2015
MikrobiyolojiAnkara ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZEYNEP CEREN KARAHAN
- Buğdaydan izole edilen bakteriyel çizgi yanıklığı etmeni Xanthomonas translucens'in moleküler karakterizasyonu
Molecular characterization of Xanthomonas translucens causes bacterial leaf streak blight isolated from wheat
KEZİBAN BÜYÜKDEVECİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
ZiraatSelçuk ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
DOÇ. KUBİLAY KURTULUŞ BAŞTAŞ
- Niğde yöresi kaplumbağa kenelerinde wolbachia endosimbiyontlarının moleküler karakterizasyonu
Molecular characterization of wolbachia endosymbionts in ticks on tortoises in Niğde province
ZEYNEP ERGÜLEŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
BiyoteknolojiNiğde Ömer Halisdemir ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BİLGE KARATEPE