Geri Dön

SMN2 gen ifadesi üzerinde kafeik asit ve bütanoik asit ester türevlerinin etkisinin araştırılması

Investigation of the effect of caffeic acid and butanoic acid?s ester derivates on SMN2 gene expression

PDF İndir

  1. Tez No: 266784
  2. Yazar: GÖZDE UZUNALLI
  3. Danışmanlar: PROF. HAYAT ERDEM YURTER
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2010
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 80

Özet

Otozomal resesif geçiş gösteren Spinal musküler atrofi'den sorumlu olan SMN (survival motor neuron) geninin SMN1 ve SMN2 olmak üzere iki kopyası bulunmakta ve SMN1 kopyasındaki homozigot delesyon hastalığa yol açmaktadır. SMN2 geninden splicing hatası nedeniyle yetersiz miktarda ifade edilen tam uzunluktaki SMN (FL-SMN2) proteini hastalığın ortaya çıkmasını engelleyemese de SMN2 kopya sayısı hastalığın şiddetini değiştirebilmektedir. Henüz uygulanabilir bir tedavisi bulunmamakla birlikte tedavi yaklaşımı olarak histon deasetilaz (HDAC) inhibitörleri ile SMN2 geninden ifade edilen FL-SMN2 seviyesinin artırılması yönünde araştırmalar yapılmaktadır. Ancak bugüne kadar tanımlanan HDAC inhibitörlerinin sahip oldukları olumsuzluklar araştırıcıları yeni bileşik arayışına yönlendirmiştir. Bu tez çalışmasında SMN2 gen ifadesini artırdığı bilinen kafeik asit ve bütanoik asit bileşiklerinden yola çıkılarak tasarlanan ve yüksek HDAC inhibisyon aktivitesi bulunan bileşiklerin gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu yöntemi ile SMN2 gen ifadesi üzerindeki etkileri araştırılmıştır. İncelenen bileşikler (E)-metil 4-(3,4-dihidroksifenil)-2-okzobüt-3-enoat (türev 1), ?-?-kafeoil-3,4-dihidroksifenil-laktik asit (türev 2), 3,3',4',5,7-pentahidroksiflavon (türev 3) ve (E)-4-(4-metoksifenil)-1-(2,6-dimetilmorfolino) büt-3-en-1,2-dion (türev 4)'dur. SMA'lı hücre hattına türev 1 uygulandığında en yüksek artış 80 µM konsantrasyonda 1,3 kat; türev 2 uygulandığında ise 50 µM konsantrasyonda 1,9 kat olarak saptanmıştır. Türev 3 ve 4, ilk iki türeve oranla daha etkili bulunmuş ve iki farklı SMA'lı hücre hattına uygulanmıştır. Türev 3 her iki hücre hattında da en yüksek artışları 20 µM konsantrasyonda 3,1 kat ve 4,4 kat; türev 4 ise 160 µM konsantrasyonda 5,5 kat ve 2,8 kat olarak göstermiştir. Araştırılan türevlerin hücre canlılığı üzerinde olumsuz etkisine rastlanmamıştır. Türev 3'ün HDAC aktivitesinin %50'sini inhibe ettiği IC50 değeri 647 µM ve türev 4'ün IC50 değeri ise 527 µM olarak hesaplanmış, köken aldığı bileşiklerden daha güçlü HDAC inhibiyonu yaptıkları gösterilmiştir. Çalışmamız sonucunda; türev 3 ve türev 4 potansiyel ilaç adayları olarak değerlendirilmiş in-vivo ve farmakolojik yöntemlerle ileri araştırmalara değer bulunmuştur.

Özet (Çeviri)

SMN gene that is responsible for the autosomal recessively inherited spinal muscular atrophy has two copies, namely SMN1 and SMN2. Homozygous deletion of the SMN1 copy causes the disease. Although insufficient amount of expression of full-length SMN protein produced by SMN2 gene due to splicing defect cannot prevent the disease, variable numbers of SMN2 copies modulate the disease severity. There is no applicable cure for SMA yet, nonetheless there are researches in the direction of elevating FL-SMN2 mRNA levels generated by SMN2 using HDAC (histone deacetylase) inhibitors as a therapeutic strategy. However, some disadvantages regarding the HDAC inhibitors identified so far have directed researchers to look for new compounds. In this thesis, the effect on the SMN2 gene expression of compounds with high HDAC inhibition activity and designed based on caffeic acid and butanoic acid compounds, which are known to increase SMN2 gene expression, is investigated via real-time polymerase chain reaction method. Compunds are (E)-metil4-(3,4-dihidroksifenil)-2-okzobüt-3-enoat (derivative 1), ?-?-kafeoil-3,4-dihidroksifenil-laktikasit (derivative2), 3,3?,4?,5,7-pentahidroksiflavon (derivative 3) ve (E)-4-(4-metoksifenil)-1-(2,6-dimetilmorfolino) büt-3-en-1,2-dion (derivative 4). The highest increase in the amount of FL-SMN2, when derivative 1 was applied to SMA cell line, was 1.3 fold with 80 µM concentration and was 1.9 fold with 50 µM concentration when derivative 2 was applied. Derivative 3 and 4 were found more effective than the other two and treated to two different SMA cell lines. In both of the cell lines, for derivative 3 the highest increases with 20 µM concentration appeared as 3.1 fold and 4.4 fold and for derivative 4 with 160 µM concentration as 5.5 fold and 2.8 fold. There are no negative effects of the investigated derivatives on the cell viability. The inhibition of HDAC activity by derivative 3 and derivative 4 at a ratio of 50% is calculated as IC50: 647 ?M and IC50: 527 µM, respectively. It is shown that these compounds perform more powerful HDAC inhibition than the compounds that they are originate from.In conclusion, derivative 3 and 4 are evaluated as potential drug candidates, and appreciated for future research with in-vivo and pharmacologic methods

Benzer Tezler

  1. Tez No

    314520

    Polifenolik bileşiklerden resveratrol ve kurkuminin nörit boyu uzamasına etkisinin PC12 hücre hattında araştırılması

    Investigation of the neurite outgrowth effects of resveratrol and curcumin in PC12 cell line

    GAMZE BORA TATAR

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    Tıbbi BiyolojiHacettepe Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HAYAT YURTER

  2. Tez No

    752381

    Sağlıklı insan uyarılmış pluripotent kök hücrelerinden (uPKH'lerden) NGN2, LHX3 ve ISL1 üçlü kasedi kullanarak motor nöron eldesi

    Motor neuron generation from healthy human induced pluripotent stem cells (iPSC) Using NGN2, LHX3 and isl1 triple cassette

    RUMEYSA TAŞPINAR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    GenetikHacettepe Üniversitesi

    Kök Hücre Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FAHRİYE DUYGU UÇKAN ÇETİNKAYA

    DOÇ. DR. AYÇA ARSLAN ERGÜL

  3. Tez No

    850777

    Crıspr prıme edıtıng gen düzenleme yaklaşımları kullanılarak Survıval Motor Nöron-2 (SMN2) geni üzerindeki nokta mutasyonların onarım etkinliğinin araştırılması

    Investigation of the repair efficiency of point mutations on the Survival Motor Neuron-2 (SMN2) gene using crispr prime editing gene editing approaches

    ENES BAL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Moleküler TıpÜsküdar Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ CİHAN TAŞTAN

  4. Tez No

    626959

    ÇOMÜ Tıbbi Genetik Tanı Merkezi'nde spinal musküler atrofi ön tanısı veya taşıyıcılığı açısından genotiplendirilen olguların SMN1/SMN2 genlerinin kopya sayılarının retrospektif analizi

    The retrospective analysis of SMN1/SNM2 copy numbers in sma pre-di̇agnosi̇s patients and in healthy controls tested at COMU medical genetics diagnosis center

    MENEKŞE ÖZTÜRK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    GenetikÇanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi

    Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FATMA SILAN

  5. Tez No

    194397

    Spinal müsküler atrofi’de RNA işlenme hatasının ve tedavinin araştırılması

    The investigation of RNA splicing defects and treatment of spinal muscular atrophy

    DİDEM DAYANGAÇ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2005

    Tıbbi BiyolojiHacettepe Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. HAYAT ERDEM YURTER

Geri Dön