Geri Dön

Küçük hücreli olmayan akciğer kanserlerinde 'Excision Repair Cross-Complementing Group 1' (ERCC1) Geni T19007C ve C8092A tek nükleotid polimorfizmlerinin klinikopatolojik parametrelerle ilişkilerinin belirlenmesi

The determination of relationship between 'Excısıon Repaır Cross-Complementıng Group 1' (ERCC1) Gene T19007c And C8092a single nucleotide polymorphisms and clinicopathological parameters in non-small cell lung cancer

  1. Tez No: 272524
  2. Yazar: ESİN KOÇ
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. VİLDAN CANER
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Genetik, Tıbbi Biyoloji, Genetics, Medical Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2010
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Pamukkale Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 82

Özet

Kanser gelişimi çok aşamalı bir olaydır ve bugüne kadar elde edilen verilerle, akciğer karsinogenez sürecinde başlıca tümör baskılayıcı genler, onkogenler ve `'Excision Repair Cross-Complementing Group 1'' (ERCC1)'in de içinde yer aldığı DNA tamir mekanizmasından sorumlu genler olmak üzere farklı türdeki genlerin etkili olduğu bilinmektedir. Bu çalışmada küçük hücreli olmayan akciğer kanseri (NSCLC)'nde ERCC1 mRNA stabilitesini etkiledikleri bilinen T19007C (rs11615) ve C8092A (rs3212986) tek nükleotid polimorfizmlerinin (SNP) belirlenmesi ve bu polimorfizmlerin yaş, cinsiyet, sigara içimi, TNM evre ve histolojik tip olmak üzere klinikopatolojik parametrelerle olası korelasyonlarının araştırılması amaçlanmıştır.Bu çalışmada, histopatolojik olarak incelenen ve NSCLC tanısı alan 80 olguya ait formalinle fikse edilmiş, parafine gömülmüş arşiv doku örnekleri kullanılmış ve T19007C ve C8092A SNP'leri gerçek-zamanlı PCR ile analiz edilmiştir. ERCC1 geni T19007C SNP ile ilişkili TT, TC ve CC genotiplerinin dağılımı sırasıyla %40, %44, %16 olarak belirlenirken, C8092A SNP ile ilişkili CC, CA, AA genotiplerinin dağılımı sırasıyla %38, %51, %11 olarak belirlenmiştir. C8092A SNP'nin klinikopatolojik parametrelerle ilişkili olmadığı, ancak T19007C SNP'inin TNM evre ile anlamlı olarak ilişkili olduğu bulunmuştur (p=0.046). Bu bulgular, T19007C SNP'ne özgü genotip dağılımının Avrupa populasyonunda gözlenen dağılımla büyük bir benzerlik gösterdiğini ve aynı zamanda bu polimorfizmin NSCLC'nde progresyonla ilişkili olduğunu desteklemektedir.

Özet (Çeviri)

The development of cancer is a multistep process and it has been reported that the different types of genes such as tumor supressor genes, oncogenes and DNA repair genes including ?Excision Repair Cross-Complementing Group 1?? (ERCC1) are involved in human lung carcinogenesis. In this study, the determination of T19007C (rs11615) and C8092A (rs3212986) single nucleotide polymorphisms (SNP) thought to affect mRNA stability of ERCC1 and the determination of any correlation between the profiles and clinopathological parameters including age, sex, the history of smoking, TNM stage and histological subtypes were aimed.In this study, the archival formalin-fixed, paraffin-embedded tissues of 80 cases which were histopathologically diagnosed as non-small cell lung cancer were used and T19007C and C8092A SNPs were analyzed using real-time PCR. Regarding T19007A SNP, the distribution of TT, TC, and CC genotypes was 40%, 44% and 16%, respectively. As for C8092A SNP, the distribution of CC, CA, and AA genotypes was 38%, 51% and 11%, respectively. No relationship was observed between C8092A SNP and clinicopathological parameters, but T19007A SNP was significantly associated with TNM stage (p=0.046). This study indicated that T19007A SNP genotypes in this study was similar to those in Europe. It was also supported that the SNP may associated with tumor progression in NSCLC.

Benzer Tezler

  1. Platin bazlı adjuvan kemoterapi alan küçük hücreli dışı akciğer kanserli hastalarda ercc1 ekspresyonun prognostik önemi

    The prognostic importance of ercc1 gene expression on the nsclc patients treated with platinum based adjuvant chemotherapy

    ERDEM ÇUBUKÇU

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2008

    OnkolojiUludağ Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. OSMAN MANAVOĞLU

  2. Küçük hücreli olmayan akciğer kanserlerinde kras gen mutasyonlarının Real-Time PCR: yöntemi ile tespiti ve klinikopatolojik parametrelerle ilişkilerinin belirlenmesi

    Determination of Kras Gene Mutations in Non-Small Cell Lung Cancer Using Real-Time PCR: Association with Clinicopathological Parameters

    LEVENT ELMAS

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    Tıbbi BiyolojiPamukkale Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. VİLDAN CANER

    PROF. DR. GÜLSEREN BAĞCI

  3. Küçük hücreli olmayan akciğer kanserlerinde O6-Metilguanin DNA Metiltransferaz geni promoter metilasyon profilinin belirlenmesi

    Determination of O6- Methylguanine DNA Methyltransferase promoter methylation pattern in non-small cell lung cancer

    MEHMET EKİM

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2010

    GenetikPamukkale Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GÜLSEREN BAĞCI

  4. Küçük hücreli olmayan akciğer kanserlerinde egfr mutasyonlarının taranması ve bu mutasyonların PTEN ve Mcl-1 protein ekspresyon seviyeleri ile ilişkisinin incelenmesi

    Screening of egfr mutations in nonsmall cell lung cancer and evaluation of its relations between PTEN and MCL-1 protein ekspression levels

    ZAFER ÇETİN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2008

    GenetikAkdeniz Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SİBEL BERKER KARAÜZÜM

  5. Küçük hücreli olmayan akciğer kanserlerinde oksidatif DNA hasarı

    Oxidative DNA damage in non small cell lung cancer

    ÖZLEM ŞENOL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    BiyokimyaDokuz Eylül Üniversitesi

    Biyokimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FATOŞ GÜLDAL KIRKALI