Identification of levansucrase gene in Halomonas sp.
Halomonas sp.? de levansukraz gen bölgesinin tanımlanması
- Tez No: 275970
- Danışmanlar: DOÇ. DR. EBRU TOKSOY ÖNER
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyomühendislik, Bioengineering
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2010
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Marmara Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 148
Özet
Fruktanlar, gelişmiş bitkilerin % 15' inin yani yaklaşık 40000 türün temel karbonhidrat kaynağını oluşturmakla birlikte, bakteri ile mantar türlerinin geniş bir kısmında bulunmaktadır.Fruktanların transfruktosilasyon reaksiyonuyla sentezi, sukroz molekülüne, hidrolize olmuş başka bir sukroz molekülünden gelen bir fruktosilin bağlanmasıyla başlar ve polimer zincirinin büyümesi, bağların tipi ve fruktan zincirinin dallanma özellikleri enzim ve organizmaya göre değişmektedir. Bakterilerde, çok fonksiyonlu bir adet enzim gerekmektedir. Bu enzimin adı; ürün bir fruktan tipi olan levan olduğunda levansukraz (EC 2.4.1.10), başka bir fruktan tipi olan inulin olduğunda ise inulosukraz (EC 2.4.1.9)' dır.Levansukraz, birçok mikroorganizma tarafından üretilmektedir ve bu enzimin katalitik aktivitesi ile sentezlenmiş levan polimerlerinin, kozmetik, gıda ve ilaç endüstrilerinde ve aynı zamanda hipokolesteromik ajan ve anti-tümör ajanı olarak bir çok potansiyel kullanım alanı da vardır. Levan yanında, bazı levansukraz enzimleri, potansiyel prebiyotik etkileri olan fruktooligosakkaritlerin üretimini de katalizlemektedir. Günümüzde, fruktooligosakkaritlerin endüstriyel üretimi esas olarak fungal levansukraz enzimine dayanmaktadır. Bundan dolayı, fruktooligosakkarit üretimini artıracak, bakteriyel yeni levansukraz gen kaynaklarının belirlenmesi, biyoteknolojik açıdan çok önemlidir. Halomonas sp., araştırma grubumuz tarafından ilk defa levan üreten bir mikroorganizma olarak tanımlanmıştır. Bu çalışmanın amacı ise, levansukraz enzimini kodlayan genin bakteri genomundaki lokasyonunun ve DNA dizisinin belirlenmesidir.Bu amaç doğrultusunda, Halomonas sp.' den genomik DNA izolasyonu ve primer tasarımından sonra, primerler kullanılarak optimize edilmiş PCR şartlarında gen bölgesinin seçici amplifikasyonu sağlanacaktır. Beklenen boyuttaki DNA bantları saflaştırılıp dizileri belirlenecektir.
Özet (Çeviri)
Fructans constitute the primary carbohydrate reserve in 15% of higher plants comprising approximately 40000 species and appear in a wide range of bacterial and fungal species.The synthesis of fructans starts with a transfructosylation reaction in which a sucrose molecule plays the role of fructosyl donor and with a second molecule of sucrose as the initial acceptor of the fructosyl moiety. Following initiation, the extension, the type of linkage and the branching of the fructan chain varies according to the enzyme and organism. In bacteria, fructan biosynthesis is somewhat simpler than the synthesis in plants because only one multifunctional enzyme is involved. This enzyme is named levansucrase (EC 2.4.1.10) when the product is a fructan of the type levan or inulosucrase (EC 2.4.1.9) when the fructan is of the type inulin.Levansucrase is produced by various microorganisms and synthesizes a levan that has a variety of applications in the fields of cosmetics, foods and pharmaceuticals, as a hypo-cholesterolemic agent, and an anti-tumor agent. Hence the availability of levansucrase and its gene from bacteria as an alternate source of a fructooligosaccharide-producing enzyme might be of biotechnological interest. The use of levansucrase (EC 2.4.1.10) as a biocatalyst in levan synthesis has been the object of increasing interest in recent years. Halomonas sp. has been described as a levan producer microorganism for the first time by our research group. Consequently, the main objective of this thesis study was the identification of the gene coding for levansucrase activity by this microorganism.For this purpose, after purification genomic DNA from Halomonas sp. and design of primers, PCR conditions were optimized for the selective amplification of the regions enclosed by designed primers. The DNA bands at the expected size were purified and their DNA sequence was determined.
Benzer Tezler
- Doğu karadeniz bölgesinde osteoporoz için risk faktörlerinin tespiti
Identification of risk factors for osteoporosis in the region of east black sea
MÜNEVVER SERDAROĞLU BEYAZAL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2007
Fiziksel Tıp ve RehabilitasyonKaradeniz Teknik ÜniversitesiFiziksel Tıp ve Rehabilitasyon Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET TOSUN
- İntrakranial meningiomlardaMGMT, CDKN2A, GSTP1 ve THBS1 genlerinin promotor bölge metilasyon kalıplarının belirlenmesi
Identification of promoter region methylation patterns seen at the MGMT, CDKN2A, GSTP1 and THBS1 genes of intrakranial meningiom patients
FATİH AYDEMİR
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2009
GenetikBaşkent ÜniversitesiNöroşirürji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET NUR ALTINÖRS
- Identification of Colchicum L. species of Turkey's flora by sequence analysis of nrDNA its region
Türki̇ye florasına ai̇t Colchi̇cum L. türleri̇ni̇n nrDNA its bölgesi̇ di̇zi̇ anali̇zleri̇ i̇le beli̇rlenmesi̇
SEREN METE
Yüksek Lisans
İngilizce
2015
BiyomühendislikMarmara ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AHU ALTINKUT UNCUOĞLU
- Niğde ilinde doğal yayılış gösteren Crambe türlerinin teşhisi ve kalite özelliklerinin belirlenmesi
Identification of Crambe sp. naturally grown in the province Nigde and determination of quality features
CEMİLE GÖKÇE
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
ZiraatÇukurova ÜniversitesiTarla Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. LEYLA SEZEN TANSI
- Nörogenetik hastalıklarda ekzom dizileme analizi ile aday genlerin belirlenmesi ve zebrafish modellerinin oluşturulması
Identification of candidate genes in neurogenetic disorders by whole exome sequencing and modeling in zebrafish
AYŞEGÜL OZANTÜRK