Evolutionary engineering of iron-resistant Saccharomyces cerevisiae for biomimetics
Evrimsel mühendislik yöntemi ile demire dirençli Saccharomyces cerevisiae?nın biyomimetik amaçlı eldesi
- Tez No: 293925
- Danışmanlar: DOÇ. DR. ZEYNEP PETEK ÇAKAR
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Genetik, Mikrobiyoloji, Biotechnology, Genetics, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2010
- Dil: İngilizce
- Üniversite: İstanbul Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: İleri Teknolojiler Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 76
Özet
Bu çalışmada, bir tersine metabolik mühendisliği stratejisi olan evrimsel mühendislik uygulanarak, demire dirençli Saccharomyces cerevisiae mayaları elde edilmiştir. Başlangıç kültürüne, kimyasal mutajen olan etil metan sülfonat uygulanarak, genetik çeşitliliği arttırılmıştır. Demire dirençli mutantların seçimi, hem hücrelere 5 ve 30mM FeCl2 aralığında sürekli stres uygulanarak, hem de eksponansiyel büyüme fazında, 5 ve 180mM FeCl2 aralığında ani stres, uygulanarak elde edilmiştir. Sürekli stres seçilim yöntemi ile 30mM FeCl2'e kadar hayatta kalabilen 15 nesil ve ani stres seçilim yöntemi ile 180mM ani FeCl2 stresine dirençli 25 nesil elde edilmiştir. Son mutant nesillerden, mutant bireyler seçilmiş ve bunların demir direnç seviyeleri ile diğer metallere ve diğer stres çeşitlerine karşı çapraz dirençleri belirlenmiştir. Demire dirençli mutantların kobalt ve nikel streslerine de çapraz direnç gösterdikleri belirlenmiştir. Sonuçlar demir, kobalt ve nikel stres direncinin moleküler mekanizmalarının mayada benzer olabileceğine işaret etmektedir.
Özet (Çeviri)
In this study, evolutionary engineering, an inverse metabolic engineering strategy, was applied to improve iron resistance of Saccharomyces cerevisiae. Chemical mutagenesis by ethyl methane sulfonate was performed to the initial culture to increase genetic diversity. Selection for iron resistant mutants was applied in batch cultures, under continuously applied stress conditions ranging between 5 and 30mM FeCl2, as well as under pulse stress conditions between 5 and 180mM FeCl2 that were applied to the cells for 90 minutes during their exponential phase of growth. From continuous stress selection; 15 generations were obtained that could survive up to 30mM FeCl2 and the pulse selection yielded 25 generations which resisted up to 180mM FeCl2 applied as a pulse stress. Individual mutants were selected from the final mutant populations and their iron resistance levels, as well as their cross-resistance to other metals and other stress types were determined and discussed. It was found that iron-resistant mutants also had cross-resistance against cobalt and nickel stresses. The results imply that the molecular mechanisms of iron, cobalt and nickel stress resistance may be similar in yeast.
Benzer Tezler
- Molecular and physiological characterization of iron resistant Saccharomyces cerevisiae
Demire dirençli Saccharomyces cerevisiae'nın moleküler ve fizyolojik karakterizasyonu
BERRAK GÜLÇİN BALABAN
Doktora
İngilizce
2016
Biyokimyaİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZEYNEP PETEK ÇAKAR
- Evolutionary engineering of nickel-resistant Saccharomyces cerevisiae
Evrimsel mühendislik yöntemi ile nikele dirençli Saccharomyces cerevisiae suşlarının eldesi
GÖKHAN KÜÇÜKGÖZE
Yüksek Lisans
İngilizce
2012
Biyoteknolojiİstanbul Teknik Üniversitesiİleri Teknolojiler Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZEYNEP PETEK ÇAKAR
- Omic analyses of stress-resistant Saccharomyces cerevisiae
Strese dirençli Saccharomyces cerevisiae'nin omik analizleri
ENES FAHRİ TEZCAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
Biyomühendislikİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZEYNEP PETEK ÇAKAR
PROF. DR. ŞEFİKA KUTLU ÜLGEN
- Optimization and use of DNA sequencing by capillary electrophoresis for comparative yeast genotype analysis
Kapiler elektroforezine dayalı DNA dizileme yönteminin optimizasyonu ve mayada karşılaştırmalı genotip analizi için kullanılması
CİHAN ERDİNÇ GÜLSEV
Yüksek Lisans
İngilizce
2014
Biyoteknolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZEYNEP PETEK ÇAKAR
- Evolutionary engineering of freeze-thaw stress-resistant yeasts without using chemical mutagenesis
Donma-erime stresine dirençli mayaların kimyasal mutajen kullanılmadan evrimsel mühendislik ile elde edilmesi
İREM BALABAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
Biyoteknolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZEYNEP PETEK ÇAKAR