Geri Dön

Metisilin dirençli Staphylococcus aureus suşlarının moleküler tiplendirmesi

Molcular typing of methicillin-resistant staphylococcus aureus strains

PDF İndir

  1. Tez No: 294248
  2. Yazar: ZEYNEP ERDEM
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. SÜHEYLA TÜRKYILMAZ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2011
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Adnan Menderes Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 137

Özet

Metisilin dirençli S. aureus (MRSA) nozokomiyal ve toplum kökenli enfeksiyonlara yol açan önemli bir patojendir. MRSA suşları dünya çapında ortaya çıkmış ve çeşitli antibiyotiklere dirençli hale gelmiştir. Bu bakterinin en önemli özellikleri kolonize olma ve klonal yayılabilmesidir.Bu çalışmada, Ocak-Mayıs 2010 tarihleri arasında Adnan Menderes Üniversitesi Veteriner Fakültesi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı'nda subklinik mastitisli inek sütlerinden (n=90) ve nazal svaplardan [insan (n=35) ve sığır (n=56)] izole edilen 12 MRSA suşunun pulsed field jel elektroforezis (PFGE), stafilokokal protein A (spa), çok lokuslu dizi tiplendirme (MLST) ve stafilokokal kromozom kaset mec (SCCmec) tiplendirmesi yapılarak moleküler özelliklerinin ortaya konulması amaçlandı. İzolatların SCCmec tipleri multipleks polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) ile belirlendi. Stafilokokal protein A'yı kodlayan spa geni ve S. aureus suşlarında bulunan 7 farklı yapısal metabolik gen (arcC, aroE, glp, gmk, pta, tpi ve yqiL) PCR ile amplifiye edildi ve sekanslandı. PFGE analizi sonucunda 12 MRSA izolatında pulsotip A-D olamak üzere dört pulsotip belirlendi. Pulsotip A olan suşların (n=7) sekans tipi (ST) tipi ST 239, spa tipi t030 olarak bulunurken biri hariç hepsinin SCCmec III taşıdığı tespit edildi. Pulsotip B (n=3) ST1294, t459 ve SCCmec Tip III; pulsotip C (n=1) ST1940, t660, SCCmec Tip III ve pulsotip D (n=1) ST737, t542, SCCmec tip II olarak belirlendi. spa tip t030 Türkiye'deki hastanelerde ve doğu ülkelerinde en sık görülen tiptir. Bu klon Amerika ve Avrupa'da nadir olarak görülmekle birlikte ?Türk Klonu? olarak isimlendirilmektedir. Hastane kökenli MRSA suşlarının fazlalığı MRSA suşlarının humanoz olabileceğini düşündürmektedir. Aynı klonla enfekte olan 2 inek sütü, 2 inek burun svabı ve bu hayvanlara bakan veteriner hekimlere ait burun svaplarından oluşan toplam 7 suş, MRSA'un klonal yayılma özelliğinin olduğunu gösterdi. Çalışma sonucunda Aydın yöresinde inek sütü, insan ve inek burun svaplarından izole edilmiş olan en yaygın spa tipi t030, MLST tipinin ise ST 239 olduğu belirlendi.

Özet (Çeviri)

Methicillin resistant S. aureus (MRSA) is a major pathogen causing both nosocomial and community-acquired infections. MRSA strains have emerged worldwide and became resistant to a variety of antibiotics. The most important features of this bacterium are becoming colonization and able to expend clonally.The aim of this study was to determine the molecular characteristics of 12 MRSA strains isolated from milk samples (n=90) and nasal samples of cows (n=56) with subclinical mastitis obtained from Adnan Menderes University, Faculty of Veterinary Medicine, Department of Microbiology between January-May 2010, and from nasal samples (n=35) of veterinarians and farm workers using pulsed field gel electrophoresis (PFGE), staphylococcal protein A (spa), multi locus sequence typing (MLST) and staphylococcal chromosome cassette mec (SCCmec) typing. SCCmec types of these strains were investigated by multiplex polymerase chain reaction (PCR). The spa genes encoding for protein A and 7 housekeeping genes (arcC, aroE, glp, gmk, pta, tpi ve yqiL) for MLST were amplified by PCR and sequenced. PFGE analysis of all 12 MRSA isolates produced four distinct pulsotypes designated as pulsotypes A-D. The pulsotype A (n=7) strains detected the most prevalent sequence type (ST) were ST 239, spa type t030 and SCCmec III except one. The pulsotype B strains (n=3) were ST1294, t459 and SCCmec III, the pulsotype C (n=1) strains were ST1940, t660, SCCmec III detected. The remaining pulsotype D (n=1) strains were ST737, t542, SCCmec II. spa type t030 which were the most common spa type in Turkish hospitals and east country. This clone, which is rare in USA and Europe, called as ?Turkish Clone?. It was thought that the high amount of MRSA strains originated from hospitals would be humanosis. Two bovine milk and nasal swabs obtained from veterinarians who looked after the animal, infected with the same clone, a total of 7 strains of MRSA clonal propagation has shown that property. Consequently, it can be said that t030 and ST239 was the most common spa and MLST types which isolated from cow milk and nasal swabs and nasal swabs from workers of these farms in Aydın.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    272385

    Staphylococcus aureus kökenlerinin multilokus dizi tiplendirmesi

    Multilocus sequence typing of staphylococcus aureus strains

    ŞULE KIRCA YILMAZ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2010

    MikrobiyolojiOndokuz Mayıs Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. İBRAHİM ÇAĞATAY ACUNER

  2. Tez No

    195129

    Hacettepe üniversitesi erişkin hastanesinde 2004-2005 yıllarında hastane kaynaklı infeksiyonlardan izole edilen metisiline dirençli staphylococcus aureus (mrsa) suşlarının moleküler tiplendirmesi

    Molecular characteristics of hospital-acquired methicillin-resistant staphylococcus aureus isolated at hacettepe university adult hospital in 2004-2005

    HADİM AKOĞLU

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıHacettepe Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ.DR. PINAR ZARAKOLU

    PROF.DR. SERHAT ÜNAL

  3. Tez No

    405240

    İzmir ve çevresindeki gıda üretiminde çalışan taşıyıcılardan izole edilen Staphylococcus aureus suşlarının identifikasyonu; epidemiyolojik ve filogenetik olarak gruplandırılması

    Identification of Staphylococcus aureus strains isolated from transporters who are work in food industry in Izmir and the surrounding area; grouping as epidemiologically and phylogenetically

    EMRE MEMO

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    MikrobiyolojiEge Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FÜSUN BAHRİYE UÇAR

  4. Tez No

    290409

    Hastane kökenli metisilin dirençli staphylococcus aureus (MRSA) izolatlarının pulsed field gel electrophoresis ve plazmid profil analizi yöntemleriyle moleküler tiplendirilmesi

    Molecular typing of nosocomial meticillin resistant staphylococcus aureus (MRSA) isolates by using pulsed-field gel electrophoresis and plasmid profile analysis methods

    ABDULLAH KIRAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    BiyolojiMarmara Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AHMET ZEHİR

    PROF. DR. ALİ METİN OTKUN

  5. Tez No

    388768

    Metisilin dirençli staphylococcus aureus suşlarının spa typıng ve pulsed fıeld gel electrophoresıs yöntemleriyle klonal ilişkilerinin tespiti

    Detection of clonal relationship of methicillin resistant staphylococcus aureus strains with spa typing and pulsed field gel electrophoresis methods

    YILDIZ KALAYCI

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    MikrobiyolojiÇukurova Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AKGÜN YAMAN

Geri Dön