SETD2, JMJD2C ve TIP60 genlerinin mRNA düzeyindeki ifadesi ile küçük hücreli dışı akciğer kanseri gelişimi arasındaki ilişkinin belirlenmesi
Determınatıon of the relatıonshıp between SETD2, JMJD2C ve TIP60 mRNA expressıon levels and non small cell lung carcınoma
- Tez No: 299044
- Danışmanlar: PROF. DR. ABDULLAH İRFAN TAŞTEPE
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Göğüs Kalp ve Damar Cerrahisi, Thoracic and Cardiovascular Surgery
- Anahtar Kelimeler: Akciğer neoplazmları, Genler, Kantitatif genetik, Karsinoma-küçük hücreli olmayan-akciğer, Polimeraz zincirleme reaksiyonu, RNA-haberci, Lung neoplasms, Genes, Quantitative genetic, Carcinoma-non small cell-lung, Polymerase chain reaction, RNA-messenger
- Yıl: 2011
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Gazi Üniversitesi
- Enstitü: Tıp Fakültesi
- Ana Bilim Dalı: Göğüs Cerrahisi Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Akciğer kanseri, dünyada kadın ve erkeklerde kansere bağlı ölümlerin en yaygın nedenidir. Epigenetik değişimler DNA metilasyonu ve histon modifikasyonunu içerir. Epigenetik yolaklarda meydana gelen değişimler çok sayıda hastalığın gelişiminde rol alır. Histon modifikasyonları histon modifiye eden enzimlerle kontrol edilir. Bu çalışmanın amacı, histon modifikasyonunda görevli üç genin mRNA düzeyindeki ifadeleri ile KHDAK gelişimi arasındaki ilişkinin belirlenmesidir. Çalışmamızda, 44 küçük hücreli dışı akciğer kanserli hastadan alınarak normal ve malign oldukları histopatolojik olarak doğrulanan doku örneklerinde üç histon modifikasyonu enziminin mRNA düzeyindeki ifade düzeyi araştırıldı. Doku örneklerinden total RNA elde edildi. SETD2, JMJD2C ve TIP60 genlerinin mRNA ifade düzeyleri kantitatif Real time PCR (qPCR) yöntemi ile ölçüldü. İfade düzeylerini normalize etmek için gliseraldehit -3-fosfat dehidrogenaz (GAPDH) housekeeping geni kullanıldı. Tümör ve normal doku örneklerine ait sonuçlar karşılaştırıldığında, JMJD2C mRNA ifade düzeyinde herhangi bir farklılık belirlenmedi (p>0.05). Ancak SETD2 ve TIP60 genlerinin mRNA düzeylerinin, hastaların tümör dokularında kontrol dokularına göre anlamlı olarak azaldığı bulundu (p<0.05). Bulgularımız, küçük hücreli dışı akciğer kanseri patogenezi ile SETD2 ve TIP60 genlerinin mRNA düzeyindeki ifadesi arasında ilişki olabileceğini göstermektedir. Bu sonuçların doğrulanması için ileri moleküler araştırmalara ihtiyaç vardır.
Özet (Çeviri)
Lung cancer is the most common cause of death due to cancer in both men and women throughout the world. The epigenetic alterations include DNA methylation, and histone modification. Alterations in epigenetic pathways have been shown to be implicated in common human diseases. Histone modifications are controlled by histone modifying enzymes. Aim of this study is to identify the relationship between mRNA expression of histone modifying genes and development of NSCLC. In this study, the expression profiles of three histone modifying genes of cancer tissue and noncancerous part from 44 patients of non small cell lung cancer were investigated. Total cellular RNA was isolated from tissue samples. The mRNA expression levels of SETD2, JMJD2C and TIP60 genes were measured by quantitative real-time polymerase chain reaction (RT-PCR). Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH) gene was used as the housekeeping gene in order to normalize expression levels. When the mRNA expression levels of these genes in lung cancer tissues were compared with those of normal lung tissues, mRNA expression level of JMJD2C did not differ significantly (p>0.05). However, there were a significant decrease in mRNA levels of SETD2 and TIP60 genes in malign tissues (p>0.05). Our findings indicate a possible association of SETD2 and TIP60 genes mRNA expression with the pathogenesis of NSCLC. To confirm these findings, further molecular investigation is needed.
Benzer Tezler
- Çok gruplu ayırma analizinin bazı yeni kriterler yardımıyla gerçekleştirilmesi ve bir uygulama
Discriminant analysis between two or more groups with respect to the some new criteria and an application
HALİL BAYRAKÇI
- Değişken kalınlıklı halka plakların statik ve dinamik stabilitesi
Static and dynamic stability of variable thickness annular plates
VAHİT MERMERTAŞ
- Temelband iletişim sistemlerinde kafes kodlama tekniğine dayanan yeni hat kodlarının tasarımı
Design of new line codes in baseband transmission systems based on trellis coding technique
ÜMİT AYGÖLÜ
Doktora
Türkçe
1989
Elektrik ve Elektronik Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiPROF.DR. ERDAL PANAYIRCI
