Proteomic analysis of boron stress response in yeast saccharomyces cerevisiae
Ekmek mayası saccharomyces cerevisiae'da bor stres yanıtının proteomik analizi
- Tez No: 299182
- Danışmanlar: DOÇ. DR. AHMET KOÇ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2011
- Dil: İngilizce
- Üniversite: İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü
- Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 40
Özet
Bor her çevresel alanda bulunabilen çok yönlü bir elementtir, fakat maden rezervleri birkaç ülkeye dağılmıştır ki Türkiye burada öne çıkar. Bor bileşikleri en az bin yıldır bilinmektedir ve son zamanlarda teknolojide yeni kullanım alanları edinmektedir. Borun yeryüzündeki yaşamın evriminde rol oynadığına inanılır. Bor elementinin güçlü elektrofilik organik bileşikleri vardır ve bunların en önemli fizyolojik formu borik asittir. Borik asit aynı yönde yerleşmiş hidroksil ve bazı amino gruplarını bağlama kapasitesine sahiptir.. Bu gruplar bazı enzimlerin aktif bölgelerinde ve 5 karbonlu furanoz halkalı karbohidratlarda bulunur. S-adenozil metyonin, nikotinamid adenin dinükleotidler, adenozin fosfatlar, diadenozin fosfat ailesi üyeleri ve RNA'ların 3' uçları gibi metabolizmada önemli moleküllerin ribozları borik asitle etkileşmeye açıktır. Borun bitkiler ve bazı hayvanlar için esansiyel bir besin olduğu bilinmektedir. Diğer esansiyel elementler gibi bor da yüksek konsantrasyonlarda toksiktir. Toksiklik mekanizması ve bor stres yanıtının organizmalardaki elemanları henüz açığa kavuşmamıştır. Burada ekmek mayasında bor stres yanıtı proteomik yaklaşımla araştırıldı. Bora maruz kalan hücreler nispeten fazla miktarlarda karbohidrat metabolik enzimleri, protein sentezinde, protein katlanması ve yıkımında , redoks homeostazisinde ve nükleotid sentezinde yer alan proteinler eksprese ettiler. Tüm bu proteinler mayada metal stres yanıtında da yer alan proteinlerdi. Bazıları peroksit, tuz, veya herbisid stresleri gibi diğer streslerde de yer alan bu proteinler değişik streslere özgü yanıtların kendi aralarında iletişim halinde olduğunu göstermektedir.
Özet (Çeviri)
Boron is a versatile element distributed in every part of the environment but most of its deposit reserves are localized in a few countries, Turkey being one of the most prominent. Boron is known to be an essential micronutrient for plants and some animals. Like any other essential element it has toxicity in high concentrations. Herein the mechanism of toxicity and the elements of the boron stress response were investigated in Saccharomyces cerevisiae with a proteomics approach. Boron is believed to have played a role in the evolution of life on earth. It has strongly electrophile organic compounds, the most important physiological form being boric acid. Boric acid has a capacity to bind cis-located hydroxl groups and some amino groups. Some of these groups are located at the active sites of some enzymes and at the carbohydrates with five-membered furanose rings. The riboses of some metabolically important molecules like S-adenosyl methionine, diadenosine phosphate family members and 3'end of RNAs are prone to be affected. The yeast cells subjected to boron in this study expressed higher amounts of carbohydrate metabolic enzymes, proteins involved in protein synthesis, protein folding and catabolism, redox homeostasis and nucleotide synthesis. All of these proteins are common to metal stress responses in yeasts. Some of them involve in other stress responses like peroxide, salt or herbicide stresses showing complex interplay between responses.
Benzer Tezler
- Omic analyses of stress-resistant Saccharomyces cerevisiae
Strese dirençli Saccharomyces cerevisiae'nin omik analizleri
ENES FAHRİ TEZCAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
Biyomühendislikİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZEYNEP PETEK ÇAKAR
PROF. DR. ŞEFİKA KUTLU ÜLGEN
- Detection and characterization of plant genes involved in various biotic and abiotic stress conditions using ddrt-pcr and isolation of interacting proteins
Çeşitli biyotik ve abiyotik stres koşullarında bitkilerde rol alan genlerin farklılık gösterim yöntemiyle bulunması, fonksiyonlarının belirlenmesi ve ilişkide bulunan proteinlerin belirlenilmesi
TURGAY ÜNVER
Doktora
İngilizce
2008
BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoteknoloji Bölümü
DOÇ. DR. CANDAN GÜRAKAN
PROF. DR. MAHİNUR S. AKKAYA
- Kırka bor madeninden izole edilen Bacillus aquimaris'e benzer bir izolatın bor'a bağlı proteomik analizi
Proteomic analysis of highly boron tolerant bacterium isolated from Kirka boron mine and is similar to Bacillus aquimaris
BİLGE UÇAR
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
BiyokimyaMuğla Sıtkı Koçman ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. BEKİR ÇÖL
- Bacillus Subtilis suşu'nun bor'a bağlı proteomik analizi
Boron-dependent proteomic analysis of Bacillus Subtilis strain
GÜLŞAH KAPISUZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
BiyokimyaMuğla Sıtkı Koçman ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. BEKİR ÇÖL
- Escherichia coli'de aşırı ifade edilen genlerin bor toleransına etkisinin araştırılması ve bora bağlı gen ekspresyon analizleri
Investigating the effects of over expressed genes on boron tolerance in Escherichia coli and gene expression analyzes pertaining to boron
ESRA DİBEK