Pamukta lif uzamasıyla ilgili genlerin polimorfizmi
Polimorfizm of the genes relatedto cottonfiber elongation
- Tez No: 300236
- Danışmanlar: DOÇ. DR. YÜKSEL BÖLEK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyomühendislik, Bioengineering
- Anahtar Kelimeler: Gen amplifikasyonu, Lif kalitesi, Lif özellikleri, Pamuk, Polimorfizm-genetik, Gene amplification, Fiber quality, Fiber properties, Cotton, Polymorphism-genetic
- Yıl: 2011
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Tekstil sanayinin önemli hammaddesi olan pamuk özellikle doğal lifleri için yetiştirilmektedir. Bu nedenle lif oluşumu ve olgunlaşma aşamaları birçok araştırmanın konusu olmuştur. Pamukta lif uzamasıyla ilgili genlerin, pamuk ıslah çalışmalarında sıkça kullanılan germplazm içerisinde dağılımlarını ve polimorfizm durumlarını incelemek amacıyla yapılan bu çalışmada farklı türlere ait toplam 247 adet genotip arasından liflerinin uzun, orta, kısa ve lifsizlik özellikleri dikkate alınarak seçilen 35 adet pamuk genotipi materyal olarak kullanılmıştır.Seçilen pamuk genotipleri, Gossypium barbadense L.(1-9), Gossypium hirsutum L.(10-25) ve diğer diploid ve tetraploidler; Gossypium herbaceum L. (26), G.laxum Phillipe (27), G.yucatanense (28), G.marie galante (29), G.mustelinum Miers ex Watt (30), G.darwinii Watt (31), G.nelsonii Fryx. (32), G.Stocksii Mast. ex Hook. (33), G.areysianum Defl. Hutch. (34), G.bickii Prokh (35) türlerinden seçilmiştir.Ayrıca, lifsiz (23), PI 528429 (24) ve PI 528426 (25) genotipleri lifsiz özellikte olup, seçilen yabani genotipler A, D, AD, C, E ve G genomlarını kapsamaktadır.Lif uzamasında etkili olduğu düşünülen genler geniş bir literatür taraması yapılarak belirlenmiş ve bunların homolojilerine bakılarak 4 adet primer tasarlanmıştır. Bu primerlerin tamamı kullanılarak pamuk genotiplerinde amplifikasyon yapılmış ve bu sonuçlar doğrultusunda genotipler arasında önemli farklılık gösteren CesA genine odaklanılmıştır.Fenotipleme neticesinde, G.barbadense genotipleri uzun ve kaliteli lifler, G.hirsutum genotipleri ise orta kalite ve orta uzunlukta lif üretmiştir.Çalışmada, seçilen genotiplerde lif uzunluğunun ortalama değeri 25,25 mm olup, 0- 36 mm arasında değişmiştir. PI 528896 (1) genotipi 36 mm ile en uzun lif özelliğine sahiptir. Genotiplerin birçoğunun lif uzunluğu 22 - 33 mm arasında değişmiştir. Bununla birlikte, yaklaşık olarak 500-510 bp uzunluğundaki allellerin SNP taşıdığı ve 2 allelde bulunan bu SNP'lerin amino asit değişimine neden olduğu belirlenmiştir. Bu değişimlerin lif kalitesiyle ilişkili olabileceği ve daha detaylı çalışmaların yapılması gerektiği sonucuna varılmıştır.
Özet (Çeviri)
Cotton isespecially grown for natural fibers which is an important raw material for textile industry. For this reason, fiber initiation and maturation steps are the subject of many researches. The goal of this study is to determine polymorphism of the genes related to cotton fiber elongation and distribution throughout the germplasm. Plant materials used in the experiment were total of 35 genotypes that were selected out of 247 according to length character of the fiber.The species in which cotton genotypes were belong are Gossypium barbadense L. (1-9), Gossypium hirsutum L. (10-25) and other diploids and tetraploids; Gossypium herbaceum L. (26), G.laxum Phillipe (27), G.yucatanense (28), G.marie galante(29), G.mustelinum Miers ex Watt (30), G.Darwinii Watt(31), G.nelsonii Fryx. (32), G.Stocksii Mast. ex Hook. (33), G.areysianum Defl. Hutch. (34) and G.bickii Prokh (35).Selected genotypes also include fiberless traits in Lifsiz (23), PI 528429 (24) and PI 528426 (25) genotypes. Genes related to fiber elongation were determined after a wide literature search and 4 primers were designed according to their homologies. After screening 35 genotypes with the primers, CesA gene had more polymorphism.Phenotyping resulted long and fine fibers for G.barbadense while medium length and quality fibers for G.hirsutum.Averaged fiber length was 25.25 mm and it ranged from 0 to 36 mm. PI 528896 (1) had the longest fiber length that ranged from 22-23 mm for most of the genotypes. With this, alleles (500-510 bp) with SNPs were determined and two of them caused amino acid change in the sequence. This change may be related to fiber length but detailed work is needed.
Benzer Tezler
- Pamukta (Gossypium hirsutum L.) lif ve tohum özellikleri arasındaki ilişkilerin saptanması
The determination of relationships between lint quality and seed characteristics in cotton (Gossypium hirsutum L.)
NEDİM ÖZBEK
Doktora
Türkçe
2011
ZiraatAdnan Menderes ÜniversitesiTarla Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYDIN ÜNAY
- Pamukta (Gossypium hirsutum L.) farklı dozlarda uygulanan organik gübrenin verim ve lif kalitesine etkisi
The effect of organic fertilizer applied at different doses on the yield and fiber quality of cotton (Gossypium hirsutum L.)
SUAT DAŞKIN
- Pamukta (Gossypium hirsutum L.) su stresi koşullarında verim ve lif kalite özelliklerinin belirlenmesi
Yield and fiber quality traits of cotton (Gossypium hirsutum L.) under water stress conditions
SELİM YAŞA
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
ZiraatÇukurova ÜniversitesiTarla Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ÖZGÜL GÖRMÜŞ
- Pamukta kükürt uygulamasının verim ve lif kalite kriterleri üzerine etkisinin belirlenmesi
Determination effects of sulfur application on yield and fiber quality criteria in cotton
HEVİN KUTAT
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
ZiraatSiirt ÜniversitesiTarla Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ÇETİN KARADEMİR
- Pamukta (Gossypium hirsutum L.) lif verimi ve kalite özelliklerine ilişkin uyum yeteneklerinin belirlenmesi
Determination of combining abilities of fiber yield and quality properties in cotton (Gossypium hirsutum L.)
HÜDA ÇINAR
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
ZiraatHatay Mustafa Kemal ÜniversitesiTarla Bitkileri Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ YAŞAR AKIŞCAN