Ülkemizde akut viral hepatit A enfeksiyonlu hastalardan elde edilen hepatit A virüsünün moleküler karakterizasyonu
Molecular characterization of hepatitis A virus isolated from acute infections in Turkey
- Tez No: 301035
- Danışmanlar: PROF. DR. A. MİTHAT BOZDAYI
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biyoloji, Biotechnology, Biology
- Anahtar Kelimeler: Genotip, Hepatit A virüsü, Genotype, Hepatitis A virus
- Yıl: 2011
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ankara Üniversitesi
- Enstitü: Biyoteknoloji Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Hepatit A virüsü (HAV) özellikle gelişmekte olan ülkelerde yaygın olmak üzere küresel bir sağlık problemidir. Özellikle çocukluk döneminde meydana gelen hepatitinde en yaygın sebebidir. HAV pozitif tek zincirli bir RNA virüsü olup, 3 insan 3 maymunumsu genotipi olmak üzere toplam 6 genotipi vardır. Bu çalışmanın amacı ise, Türkiye'nin farklı coğrafi bölgelerinden HAV ile enfekte olmuş hasta serumlarının analizlerine bağlı olarak en yaygın HAV genotipini saptamaktır.Farklı coğrafi bölgelerden serumları elde edilen 137 hastanın VP1-2A bölgelerinin sekans ve filogenetik analizleri sonucunda Türkiye'de ki en yaygın genotip IB olarak bulundu (%100). Türk izolatları ile genotip IB arasında yapılan karşılaştırmada aradaki benzerlik %94.9 oldu. Türk izolatlar kendi aralarında ?Mean Percentage Nucleotide Distance? analizi ile karşılaştırıldıklarında ise arada ki benzerlik % 95.3 ile % 100 arasında değişkenlik gösterdi.Yapılan filogenetik analizler sonucunda Türkiye'de ki en yaygın genotipin IB olduğu gözlemlendi. Yapılan sekans analizi sonucunda elde edilen veriler, lokal veya büyük bir salgının var olup olmadığının anlaşılmasında önemli bir veri kaynağı oluşturarak, yapılacak olan müdahelelerin doğru ve zamanında olmasına yardımcı olmaktadır.
Özet (Çeviri)
Hepatitis A virus (HAV) is a global public health problem especially in developing countries and the most common cause of hepatitis in childhood. HAV is a single stranded positive RNA virus subdivided to 6 genotypes (3 human, 3 simian). The aim of this study was to determine the prevalent genotype in Turkey using sera of acute HAV infected patients from different geographical regions of the country.Sera of 137 patients with acute HAV were collected for phylogenetic analysis from different geographical regions. Sequencing and phylogenetic analysis of VP1-2A junction of HAV showed that the most prevalent genotype in Turkey is 1B (100%). Comparison of Turkish isolates and reference sequences of genotype IB showed a similarity of 94.9%. When Turkish isolates were compared with each other according to Mean Percentage Nucleotide Distance analysis, similarity varied between 95.3% and 100%.Phylogenetic analysis pointed out that all Turkish isolates belong to genotype IB. Sequence analysis is a useful tool in revealing hepatitis A outbreaks, and allows us to detect and distinguish the presence of epidemic and small outbreaks.
Benzer Tezler
- Solid tümörü olan hastalarda hepatit b virüsü ile temasın araştırılması ve tespit politikasının değerlendirilmesi
Investigation of the hepatitis b virus in solid tumors and their detection policy
SERDAR DURAK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2017
GastroenterolojiRecep Tayyip Erdoğan Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. REMZİ ADNAN AKDOĞAN
- Akut viral hepatitlerde serum TNF-alfa, IL- 1beta ve IF-gama düzeyleri
Başlık çevirisi yok
ÇİĞDEM TORUN EDİS
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2003
Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiAtatürk ÜniversitesiKlinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET A. TAŞYARAN
- Kemik iliği transplantasyonu yapılan hastaların aşı ile önlenebilir hastalıklara karşı bağışıklık durumlarının ve rutin aşılama şemasına göre uygulanan hepatit B, kızamık, kızamıkçık, kabakulak (MMR) aşılarına yanıt oranlarının değerlendirilmesi
Immunity status of bone marrow transplantation recipients against vaccine preventable diseases and evaluation of response rate to hepatitis B, measles, MUMPS, rubella (MMR) vaccines implemented according to routine vaccination schedule
SİBEL KARABULUT
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2022
Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiSağlık Bilimleri ÜniversitesiEnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ALİYE BAŞTUĞ
PROF. DR. AYSEL KOCAGÜL ÇELİKBAŞ
- Aydın Adnan Menderes Üniversitesi Hastanesi Acil Servise başvuran hastalarda HBsAg seroprevalansı ve etki eden faktörler
HBsAg seroprevalance and affecting factors in patients attending Aydin Adnan Menderes University Emergency Department
BABAJIDE EMMANUEL OLADAPO
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2021
Aile HekimliğiAydın Adnan Menderes ÜniversitesiAile Hekimliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SERPİL DEMİRAĞ
- Generation of plasmid-based eukaryotic model to investigate biology of Crimean-Congo hemorrhagic fever virus nucleoprotein and glycoproteins
Kırım Kongo kanamalı ateşi virüsü nükleoproteinin ve glikoproteinlerinin biyolojisinin çalışılmasında plazmit temelli ökaryotik model oluşturulması
NESİBE SELMA ÇETİN
Doktora
İngilizce
2023
BiyoteknolojiBezm-İ Alem Vakıf ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
PROF. DR. MEHMET ZİYA DOYMAZ