Geri Dön

Proteinlerin kontak lensdeki katı difüzivitesinin hesaplanması: Göze yerleştirilen kontak lensde ve bunun rutin temizleme işlemi sırasında protein konsantrasyon gradientinin zamanla değişiminin simülasyonu

Determination of solid diffusivities of proteins in a contact lens: Simulation of time change of protein concentration gradient of a contact lens placed onto the eye and during its routine cleaning practice

PDF İndir

  1. Tez No: 305942
  2. Yazar: ECE MİNDEK
  3. Danışmanlar: PROF. DR. AHMET RIFAT ÖZDURAL
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Kimya Mühendisliği, Chemical Engineering
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2012
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Kimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 111

Özet

Bu tez çalışmasında, kontak lenslere gözyaşı içerisinde bulunan lizozimin adsorpsiyonu ve yıkama çözeltisi içerisinde bırakılan kontak lensten lizozim desorpsiyonu işlemleri sırasında kontak lenste meydana gelen konsantrasyon profilleri simülasyonu gerçekleştirilmiştir. Genel hız modeli yaklaşımıyla gerçekleştirilen proteinin lenste adsorpsiyonu simülasyonunda, lizozimin yığın sıvı faz içerisindeki konsantrasyonu, ara yüzeyde sıvı ve katı faz konsantrasyonları ile katı içerisindeki konsantrasyonu ayrı ayrı tanımlanmış ve bu konsantrasyonlar arasındaki denge koşullara göre belirlenmiştir. Türetilen matematiksel ifadeler sonucunda konsantrasyon profillerini elde edebilmek için gerekli olan algoritma, tez kapsamında hazırlanmıştır.Tezde Etafilcon A kontak lenslerle çalışılmıştır. Kontak lensin göze takılı olduğu durumda gözyaşı içerisindeki lizozim aktarımını incelemek amacıyla yapılan simülasyonlarda PBS tampon çözeltisindeki lizozim kullanılmıştır. Kontak lenste biriken lizozimin desorpsiyonu ise başlangıçta protein içermeyen PBS çözeltisi ile yıkama durumu için ele alınmıştır.Tezin bir diğer safhasında, simülasyon için geliştirilen model parametrelerinden biri olan, lizozimin kontak lensteki homojen difüzyon katsayısı, Ds değerinin bulunması amacıyla, grubumuz tarafından ileri sürülen ve genel hız modeli yaklaşımına dayanan yeni bir yöntem kullanılmıştır. Tarafımızca ileri sürülen yöntem ile homojen difüzyon katsayısı Ds, 1.3x10-8 cm2/s olarak tayin edilmiştir. Literatürde bulunan değerler ile bu tezde elde edilen Ds değerinin uyum içerisinde olduğu görülmüştür.

Özet (Çeviri)

In this thesis study, concentration profiles occuring in a contact lens during lysozyme adsorption from human tear and lysozyme desorption when the contact lens is placed in cleaning solution are simulated. For the simulation of protein adsorption in the lens based on the general rate model approach, concentration in the bulk liquid phase, liquid and solid concentrations at the interphase and solid phase concentration are defined individually and the equilibrium between these concentrations are defined according to circumstances. The required algorithm for the concentration profiles based on the derived mathematical expressions has been prepared within the thesis study.In the thesis study, Etafilcon A contact lenses are used. Lysozyme in PBS buffer solutions are used in the simulations in order to analyse the lysozyme transport from human tear during contact lens wear. Use of protein free PBS solution as a cleaning solution is examined for desorption of lysozyme accumulated in the contact lens.In another part of the thesis, a new technique based on general rate model approach proposed by our group is used for the calculation of homogeneous diffusion coefficient (Ds) of lysozyme in the contact lens which is one of the model parameters used for the simulation. The homogeneous diffusion coefficient (Ds) is determined as 1.3x10-8 cm2/s by the technique proposed by our group. Ds value obtained in this thesis study is seen to be in accordance with those given in the literature.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    566522

    Proteinlerin kontak lensteki difüzyon katsayısının ve derişim profillerinin incelenmesi

    Investigation on the solid diffusivities and concentration profiles of proteins in contact lenses

    SİNEM YURTSEVER

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Kimya MühendisliğiKonya Teknik Üniversitesi

    Kimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MUSTAFA ESEN MARTI

  2. Tez No

    379274

    Farklı karmaşıklık seviyeleri içeren protein modelleri için paralel programlar ve algoritmalar geliştirilmesi

    Developing parallel programs and algorithms for protein models containing different types of complexity

    GÖKHAN SELAMET

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    Tıbbi BiyolojiGaziantep Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. HÜSEYİN KAYA

  3. Tez No

    270439

    A study on protein conformational transitions by Monte Carlo simulations

    Monte Carlo simülasyonu ile proteinlerde konformasyonel geçişlerin incelenmesi

    BAHAR AYDIN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2010

    BiyofizikBoğaziçi Üniversitesi

    Kimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. PEMRA DORUKER TURGUT

    PROF. TÜRKAN HALİLOĞLU

  4. Tez No

    449263

    The role of tissue transglutaminase (dTG) in renal cell carcinoma cell adhesion and cell migration

    Doku transglutaminaz (dTG)'ın böbrek hücre karsinomlu hücre yapışması ve metastazındaki rolü

    YEŞİM BAĞATUR

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2014

    BiyoteknolojiYeditepe Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DİLEK TELCİ

  5. Tez No

    152846

    Binding proteins in the small world of residue networks

    Aminoasit ağlarının küçük dünyasında bağlanan proteinler

    GÜNGÖR ÖZER

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2004

    Kimya MühendisliğiSabancı Üniversitesi

    Kimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ.DR. CANAN BAYSAL

Geri Dön