Bazı halofilik ve halotolerant mikroorganizmaların, fenantren, piren ve naftalen parçalayabilme yeteneklerinin araştırılması
The investigation on some halophilic and halotolerant microorganisms? degradation ability of phenanthrene, pyrene, and naphthalene
- Tez No: 309197
- Danışmanlar: PROF. DR. MUHSİN KONUK
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoloji, Biyoteknoloji, Mikrobiyoloji, Biology, Biotechnology, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2012
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Afyon Kocatepe Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 208
Özet
Bu araştırmada, 17 adet halofilik ve halotolerant izolatın PAH'ları (p-hidroksibenzoik asit, naftalen, fenantren ve piren) parçalayabilme yetenekleri ve izolatların PAH'ları parçalama sürecinde kullandıkları metabolik yolun belirlenmesi amaçlanmıştır.İzolatların morfolojik ve kültürel özellikleri belirlenmiştir. Farklı PAH konsantrasyonlarında izolatların üreme durumları saptanmıştır. PAH'ların parçalanmasında intradiol halka parçalama yolundaki (orto yol) katekol 1,2-dioksijenaz ve/veya protokatekhuat 3,4-dioksijenaz enzimlerini kullandıkları spektrofotometrik yöntem kullanılarak belirlenmiştir. İzolatların dioksijenaz enzimlerini kodlayan gen bölgelerini belirleyebilmek için PCR amplifikasyonları yapılmıştır. Amplifikasyon ürünleri %1'lik agaroz jelde yürütülerek görüntülenmiştir. Katekol 1,2 dioksijenaz ve protokatekhuat 3,4 dioksijenaz enzimlerini kodlayan muhtemel gen bölgeleri saptanmıştır. Bu gen bölgelerinin nükleotid sekans analizleri belirlenmiştir.Sonuç olarak; C-24, C-27, C-37, C-41, C-43, C-46, C-50, C-51, C-52, CH izolatlarının çalışmada kullanılan PAH'ları parçalayabildikleri ve yüksek tuzluluk koşullarına sahip ortamlarda PAH'ların biyoremediasyonu için potansiyel olarak kullanılabileceği tespit edilmiştir.
Özet (Çeviri)
In this research, we aimed to determine PAHs (p-hydroxybenzoic acide, naphthalene, phenanthrene and pyrene) degradation ability of 17 halophilic and halotolerant isolates and the methabolic pathway used by the isolates during the degradation.Morphological and cultural features, and growing conditions of these isolates were determined. The PAH degradation ways used by the isolates were also identified by using spechtrophotometric method. It was observed that the isolates use catechol 1,2 dioxygenase and/or protocatechuate 3,4 dioxygenase in intradiol ring cleavage. PCR amplification was carried to define the gene zones which codify dioxygenases of these isolates. The amplified products were also analysed on 1% (w/v) agarose gels, and possible gene zones of catechol 1,2 dioxygenase and protocatechuate 3,4 dioxygenase were determined. Nucleotide sequence analysis of these gene regions were performed.Concequently, it was found that C-24, C-27, C-37, C-41, C-43, C-46, C-50, C-51, C-52, CH isolates could degrade the PAHs tested and these isolates could be used in bioremediation of the environments contaminated with PAH containing high salinity.
Benzer Tezler
- Recombinant production and characterization of serine protease enzyme from Virgibacillus sp. AGTR strain
Virgibacillus sp. AGTR suşundan izole edilen serin proteaz enziminin rekombinant üretimi ve karakterizasyonu
BEGÜM ÖZDEN
Yüksek Lisans
İngilizce
2019
Biyoteknolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NEVİN GÜL KARAGÜLER
- Halofilik ve halotolerant aktinomisetlerin izolasyonu, karakterizasyonu, NRPS ve PKS Gen kümelerinin moleküler tanımlanması
Isolation, characterization of halophilic and halotolerant actinomycetes and molecular identification of their NRPS and PKS Gene clusters
DEMET TATAR
- Ilımlı halofilik bakterilerin izolasyonu, saflaştırması, tanısı ve bazı moleküler özelliklerinin belirlenmesi
Isolation, purification and identification of moderately halophilic bacteria and determination of some molecular properties
EBRU TEKİN
- Functional significance of fructan biosynthesis in halophilic archaea and eubacteria
Halofilik arke ve öbakterilerde fruktan biyosentezinin fonksiyonel önemi
ONUR KIRTEL
Doktora
İngilizce
2021
BiyomühendislikMarmara ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. EBRU TOKSOY ÖNER
PROF. DR. WİM VAN DEN ENDE
- Bor madenlerinden izole edilen bazı Zhihengliuella suşlarının tuz tolerans genlerinin araştırılması
The investigation on salt tolerance genes of some Zhihengliuella strains isolated from boron mines
ESRA ESMERAY
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
BiyolojiMuğla Sıtkı Koçman ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. BEKİR ÇÖL