Geri Dön

Cloning and chararacterization of a novel abscisic acid (ABA)-induced HVA22-like protein from Triticum turgidum spp. dicoccoides in response to drought stress

Kuraklık koşulları altında ABA ile indüklenen HVA22-türü bir proteinin yabani buğdaydan (Triticum turgidum ssp. dicoccoides) klonlanması ve karakterizasyonu

PDF İndir

  1. Tez No: 309378
  2. Yazar: ESEN DOĞAN
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. HİKMET BUDAK
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biyomühendislik, Biyoteknoloji, Biology, Bioengineering, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2010
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Sabancı Üniversitesi
  10. Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Bilimleri ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 102

Özet

Uzun kuraklık koşulları altında, HVA22-türü bir proteinin yabani buğday (Triticum turgidum ssp. dicoccoides) kök dokusunda farklı olarak ekspres edildiğini göstermiştir. Bu çalışmada, yabani buğdayın kuraklığa dayanıklı olduğu önceden gösterilen TR39477 numaralı çeşidinin kök dokusundan HVA22-türü bir proteinin açık okuma çerçevesi (ORF) klonlanmış ve karakterize edilmiştir. Sekans analizi, protein ürününün dört adet olası transmembran bölgesi (domain) olduğuna işaret etmektedir. Proteinin varlığı hem E. coli'de hem de S. cerevisiae'de gerçekleştirilen ekspresyonlarla gösterilip SDS-PAGE yöntemi ile analiz edilmiştir. Proteinin hücre içindeki lokalizasyonu yeşil florosan protein (GFP) geni taşıyan bir vektörün kullanılması ile S. cerevisiae'de gözlenmiştir. Konfokal lazer mikroskobu kullanılarak elde edilen sonuçlar sadece boş vektör ile transforme edilen maya hücrelerinin galaktoz ile indüklenmesi sonrasında ekspres edilen GFP'nin hücre içinde homojen olarak dağıldığını gösterirken, HVA22-türü protein sekansını barındıran vektörün ekspresyonunun indüklenmesi sonrası GFP ile işaretlenmiş HVA22-türü proteinin hücre içinde lokalize olduğunu göstermektedir. GFP ile işaretlenmiş HVA22-türü proteinin ekspresyonu ayrıca western blot tekniği kullanılarak fare anti-GFP'si ile doğrulanmıştur. Bu tezde sunulan çalışma, HVA22-türü bir proteinin Triticum turgidum ssp. dicoccoides bitkisinden izole edilip karakterize edilmesini gösteren ilk çalışmadır.

Özet (Çeviri)

An HVA22-like protein was found to be differentially expressed in root tissue of wild emmer wheat (Triticum turgidum ssp. dicoccoides), under prolonged drought stress conditions. In this study we were able to clone and characterize the open reading frame of HVA22-like protein from root tissue of wild emmer wheat accession number TR39477, which was previously shown to be a drought-tolerant genotype. Sequence analysis indicated that HVA22-like protein product was a membrane protein and had four hypothetical transmembrane domains. Presence of the protein was shown by expressing it both in Escherichia coli and Saccharomyces cerevisiae and analyzing with sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE) analysis. Localization of the protein in the cell was observed in S. cerevisiae utilizing a vector containing green fluorescent protein (GFP) gene. Results obtained using a confocal laser microscope indicated that the transformation of yeast cells with only the empty vector containing GFP gene yielded in a homogenous distribution of the GFP upon induction with galactose whereas the HVA22-like protein tagged with GFP was localized in the cell. Expression of GFP tagged HVA22-like protein was further confirmed with western blot analysis using mouse anti-GFP antibody. The work presented in this thesis was the first study to identify and characterize the HVA22-like protein and its protein product from Triticum turgidum ssp. dicoccoides.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    450935

    Cloning of a cDNA encoding laccase from coriolopsis polyzona MUCL 38443 and expression in Pichia pastoris

    Coriolopsis polyzona MUCL 38443'ten lakkaz kodlayan bir cDNA'nın klonlanması ve Pichia pastoris'te ifade edilmesi

    ORKUN PİNAR

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2017

    Biyoteknolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYTEN KARATAŞ

  2. Tez No

    394619

    Isolation and characterization of a novel tyrosinase enzyme from native bacterial straine, production of the enzyme by cloning, characterization of the recombinant enzyme and analysis of its biotechnological applications such as production of l-dopa and melanin

    Doğal bakteri suşlarından tirozinaz enzim izolasyonu, karakterizasyonu, üretici genin klonlanması, rekombinant enzimin karakterizasyonu ve l-dopa ve melanin üretimi gibi biyoteknolojide kullanılabilirliği

    EBRAHİM VALİPOUR

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2015

    BiyolojiÇukurova Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. BURHAN ARIKAN

  3. Tez No

    465047

    Cloning and characterization of a lipase enzyme isolated from metagenomic libraries

    Metagenomik kütüphanelerinden izole edilen bir lipaz enziminin klonlanması ve karakterizasyonu

    FATMA FEYZA ÖZGEN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2017

    Biyoteknolojiİstanbul Üniversitesi

    Genetik ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. EMİNE ŞEKÜRE NAZLI ARDA

  4. Tez No

    286417

    Cloning and characterization of novel NOD like receptors as cytoplasmic immune sensors

    Sitoplazmik bağışıklık alıcıları olarak yeni NOD ailesi alıcıların klonlanması ve karakterizasyonu

    YETİŞ GÜLTEKİN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2011

    BiyolojiBoğaziçi Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. NESRİN ÖZÖREN

  5. Tez No

    862974

    Functional characterization of snurportin-1 C-terminal domain in the context of a novel muscular dystrophy

    Yeni bir musküler distrofi bağlaminda snurportin-1 C-terminal bölgesinin i̇şlevsel karakterizasyonu

    BURAK SARIBAŞ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    Moleküler TıpKoç Üniversitesi

    Hücresel ve Moleküler Tıp Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. NATHALIE SONIA ESCANDE BEILLARD

Geri Dön