Geri Dön

Tipe özgü multipleks real-time PCR ile yaygın görülen yüksek riskli HPV'lerin saptanması

Detection of major HPVs by a type specific multiplex real-time PCR

PDF İndir

  1. Tez No: 311708
  2. Yazar: FATİH ŞAHİNER
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. MEHMET YAPAR
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Moleküler Tıp, Microbiology, Molecular Medicine
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2011
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: GATA
  10. Enstitü: Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 65

Özet

HPV'lerin servikal kanser ve prekanseröz lezyonlarla ilişkili olan ve ?yüksek-riskli? HPV'ler olarak tanımlanan bir alt grubu vardır. Servikal kanser dünya genelinde kadınlarda en sık görülen ikinci kanserdir. Servikal kanserlerin önlenmesi ve azaltılmasında çok büyük önem taşıyan erken tanı büyük ölçüde doğru tarama stratejilerinin belirlenmesine bağlıdır. Servikal sitoloji ve HPV-DNA saptama yöntemleri bu amaç için en sık başvurulan tarama testleridir.Bu çalışmada, HPV enfeksiyonlarının tanısında kullanılmak üzere maliyet-etkin, pratik ve duyarlılığı yüksek bir tanı-tarama yönteminin geliştirilmesi amaçlanmıştır. Çalışmamıza toplam 315 servikal smear örneği dahil edilmiş ve örneklerin 68'i (%21,6) HPV-DNA pozitif olarak bulunmuştur. Laboratuvarımızda dizayn edilen yeni real-time PCR temelli yöntemler ile bu 68 örneğin 62'sinde tiplendirme analizleri başarılı olarak yapılırken, 6 örnekte sadece genel primerler ile pozitiflik saptanmış fakat genotiplendirme yapılamamıştır. HR-HPV ve LR-HPV tipleri birlikte olmak üzere, tip spesifik real-time PCR ile 62 örneğin 50'sinde (%80,6) tek, 12'sinde ise (%19,4) birden fazla HPV tipi saptanmıştır. Bu örneklerde toplam 11 farklı HR-HPV genotipi saptanmış olup en sık görülen HR-HPV tiplerinin dağılımı ise şu şekildedir; HPV tip 16; 26 (%37,7), tip 52; 9 (%13,0) ve tip 58; 8 (%11,6).Servikal kanser ve ilişkili prekanseröz lezyonların önlenmesine yönelik aşı geliştirme çalışmaları devam etmektedir. Bu aşılar genellikle HPV tip 16 ve 18'e karşı etkilidir. Her ne kadar bizim çalışmamız istatistiksel önem açısından küçük bir grup olsa da, tip 16 ve 18 dışındaki HPV tiplerinin onkojenik tiplerin yarısından fazlasını (%55,1) oluşturduğunu saptadık. Bu nedenle, ülkemizdeki tip dağılımının doğru olarak belirlenmesi için geniş kapsamlı çalışmaların yapılmasına ve daha çok HPV tipine karşı etkili aşıların geliştirilmesine ihtiyaç olduğu açıktır.

Özet (Çeviri)

A sub-group of Human Papilloma Viruses (HPVs) that has been called as“high-risk”HPV has associated with cervical precancerous lesions and cervical cancer. Cervical cancer is the second most frequently occurring cancer worldwide in women. Early diagnosis is crucial for prevention and reducing the cervical cancer and it is depends on greatly the determination of accurate screening strategy. Cervical cytology and HPV-DNA tests are the most commonly used screening methods, for this purpose.In this study, we aimed to develop a cost-effective, practical and sensitive diagnostic and screening method that to be used in the detection of HPV infections. A total of 315 cervical smear samples were included in this study and 68 of them (21.6%) were determined as HPV-DNA positive. Genotyping analyses were performed successfully in 62 of these samples, but in the other 6 samples that were positive only by general primers genotyping analyses could not be performed successfully by new real-time PCR based methods that were designed in our laboratory. Single HPV type was detected in 50 (80,6%) and multiple HPV types were detected in 12 (19,4%) of these 62 samples by type specific real-time PCR (including both HR-HPV and LR-HPV types). A total of 11 different HR-HPV genotypes were detected in this samples and the distribution of the most frequent HR-HPV genotypes were as follows: HPV type 16; 26 (%37,7), type 52; 9 (%13,0) and type 58; 8 (%11,6).Vaccine development is underway to the prevention of cervical cancer and associated precancerous lesions. These vaccines are usually effective against HPV types 16 and 18. Although our study includes smaller sample size for gaining epidemiological significance, more than half of high-risk types (55,1%) were detected as non-16-18 HPV types. Therefore, clearly there is a need to comprehensive studies to determine HPV type distribution in our country and develop HPV vaccines that protect against more HPV types.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    855306

    Optimization of conventional and CRISPR-dcas9-based overexpression systems against root-knot nematodes in tomato

    Domateste kök-ur nematodlarına karşı geleneksel ve CRISPR-dcas9 tabanlı aşırı ifade sistemleri optı̇mı̇zasyonu

    KARAM MOSTAFA SHAHAT ALI

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    BiyoteknolojiOndokuz Mayıs Üniversitesi

    Tarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MUSA KAVAS

  2. Tez No

    722457

    Systems biomedicine approaches in renal cell carcinomas to identify subtype-specific molecular signatures and potential therapeutics

    Alt tipe özgü moleküler işaretçileri ve potansiyel terapötikleri tanımlamak için renal hücreli karsinomlarda sistem biyotıp yaklaşımları

    AYŞEGÜL ÇALIŞKAN İŞCAN

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    BiyoistatistikMarmara Üniversitesi

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. KAZIM YALÇIN ARĞA

  3. Tez No

    797877

    Meme kanseri hastalarında neoadjuvan kemoterapi yanıtının mr volumetrik değerlendirilmesi ve patolojik korelasyonu

    Mr volumetric evaluation and pathological correlation of neoadjuvant chemotherapy response in breast cancer patients

    AZADEH HAYERI

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Radyoloji ve Nükleer TıpSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Radyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ABDULLAH SOYDAN MAHMUTOĞLU

  4. Tez No

    850798

    Cell subtype specific roles of glial cells in alzheimer's disease by network-based analysis of single-cell multi-omic data

    Tek hücreli çoklu omik verilerin ağ tabanlı analizi ile alzheimer hastalığında glial hücrelerin hücre alt tipine özgü rolleri

    ATILAY İLGÜN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    BiyomühendislikGebze Teknik Üniversitesi

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. TUNAHAN ÇAKIR

  5. Tez No

    352934

    Kronik hepatit C hastalarında pyrosekanslama yöntemi ile hepatit C virusu (HCV) genotiplerinin belirlenmesi

    Detection of hepatitis c virus (HCV) genotypes by pyrosequencing in chronic HCV patients

    OĞUZHAN HANCI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    MikrobiyolojiFırat Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. YASEMİN BULUT

Geri Dön