Kanser hücrelerini tanıma potansiyeli bulunan elektroaktif yüzeylerin oluşturulması, karakterizasyonu ve ın vitro uygulamaları
Design, characterization and implementation of modified surfaces: electrochemical detection of cancer cells
- Tez No: 315620
- Danışmanlar: PROF. DR. SUNA TİMUR
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyokimya, Biochemistry
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2012
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ege Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyokimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 79
Özet
Kanser günümüzde sık görülen ve öldürücülüğü yüksek olan önemli bir sağlık problemidir. Erken tanısı, bu hastalığın tedavi edilebilme şansını yükseltmektedir. Biyolojik tanıma özelliğine sahip fonksiyonel yüzeylerin geliştirilmesi, kanser tanısı ve tedavisi açısından son derece önemlidir. Tez projesi kapsamında, kanser hücrelerine özgü biyomoleküllerle fonksiyonlandırılmış elektroaktif yüzeyler tasarlanıp karakterize edilmiştir. Substrat olarak kullanılan altın yüzeylerin sırasıyla PAMAM (Poliamidoamin) molekülleri ve biyolojik ligandlarla (Folik asit, Anti-HER2, Anti-MTDH) modifikasyonu gerçekleştirilmiştir. Sonrasında, bu modifiye yüzeylerin hücrelerle spesifik olarak bağlanabilme özellikleri elektrokimyasal (döngüsel voltammetri, diferansiyel puls voltammetrisi) yöntemlerin kullanımıyla belirlenmiştir. Hazırlanan yüzeylerin belirli bir kanser türüne spesifik olabilme potansiyelleri pozitif (MCF-7) ve negatif (PC-3) kontrol ile karşılaştırma grubu (HMEC) oluşturularak test edilmiştir.İlk olarak çalışma koşullarının optimizasyonu kapsamında çalışma pH'sı ve yüzey modifikasyonunda kullanılan optimum biyomolekül konsantrasyonları bulunmuştur. Ardından, bu biyomoleküller ile modifiye farklı yüzeylerin, her üç hücre hattına ilişkin doğrusal tayin aralıkları belirlenmiştir. Hücre hatları kendi içlerinde karşılaştırıldığında en yüksek sinyal cevapları (?I, µA) beklenildiği gibi MCF-7 hücrelerinde görülmüştür. Hedef olarak farklı biyomolekülleri içeren modifiye yüzeyleri MCF-7 hücrelerine karşın kendi içlerinde değerlendirildiklerinde, spesifik etkileşime bağlı en yüksek sinyalin, folik asit ile modifiye yüzey ile elde edildiği görülmektedir. Yüzeylere ait temas açısı, AFM ve SEM ölçümleri elektrokimyasal olarak elde edilen sonuçları doğrular niteliktedir ve hücrelerin PAMAM molekülleri ile spesifik olmayan etkileşimleri göz ardı edilebilecek düzeydedir.Bu çalışmadan elde edilen çıktılar hücre-yüzey etkileşimlerinin izlenebilmesi ve yüzeyinde hücre kültürü yapılan çip sistemlerinin geliştirilmesine yönelik veri toplanması açısından önemlidir.
Özet (Çeviri)
Cancer is one of the most common healthy problem to cause death at the present time. The chance of being cured of cancer increases with early diagnosis. The development of functional surfaces with biological recognition has significant importance for teragnostic applications.In this study, electroactive surfaces functionalized with biomolecules specific to cancer cells has been designed and characterized. Gold surfaces were modified by Polyamidoamine (PAMAM) molecules and biological ligands, folic acid, anti-HER2 and anti-MTDH antibodies, respectively. Then, interaction of the modified surfaces with the selected cell lines were monitored via electrochemical methods such as cyclic voltammetry and differential puls voltammetry. Potential use of the surfaces which are expected to be specific to cancer types, were examined by using different cell lines (MCF-7, PC-3 and HMEC).Initially, optimization of working conditions (pH and biomolecules amount on the surfaces) was carried out. Afterwards, interaction of different surfaces modified with the targeting biomolecules, and different cell lines were examined. Comparing to cell lines, the highest signal response (?I, µA) was obtained from MCF-7 cells as expected. On the other hand, in comparison to the biomolecules versus MCF-7 cells, the highest response due to the interaction was observed from folic acid. Also, contact angle measurements, SEM and AFM images were investigated. It was also found that non-specific interaction of PAMAM and cells were negligible level.The outputs from this study offer an insight into studies of surface-cell interactions and monitoring cell culture systems on the chip.
Benzer Tezler
- The regulatory mechanisms of matrix metalloproteinases and tissue inhibitors of metalloproteinases in human eosinophils
Matriks metalloproteinaz enzimlerinin ve doku inhibitörlerinin insan eozinofil hücrelerinde regülasyon mekanizmalarının incelenmesi
ECE OYLUMLU
Yüksek Lisans
İngilizce
2021
Allerji ve İmmünolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. CEREN ÇIRACI
- Siglek proteinleri ile alternatif siglek ligandları arasındaki etkileşimlerin protein docking metodu ile analizi
Analysis of interactions between siglec proteins and alternative siglec ligands via protein docking method
BARIŞ BARIN
- Immunoreceptors modulate eosinophilic functions in viral immunity
Eozinofillerde viral bağışıklık yanıtının oluşumunda hücre zarına bağlı ve hücre içi reseptörlerin rollerinin araştırılması
LÜBEYNE DURMUŞ
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
Allerji ve İmmünolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. CEREN ÇIRACI
- Elektrokimyasal impedimetrik sensörlerin geliştirilmesi ve uygulamaları
Development of electrochemical impedimetric sensors and applications
YEŞİM TUĞÇE YAMAN
- Analysis of LSAMP gene as a tumor suppressor in neuroblastoma
LSAMP geninin nöroblastomalarda tümör baskılayıcı olarak analizi
ATIL ÇAĞDAŞ SAYDERE
Yüksek Lisans
İngilizce
2009
Biyolojiİhsan Doğramacı Bilkent ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. CENGİZ YAKICIER
