Geri Dön

Endotoksinin N9 fare mikroglial hücre hattında mikroRNA ekspresyon profiline olan etkisi

The effect of endotoxin on microRNA expression profile in N9 mouse microglial cell line

PDF İndir

  1. Tez No: 316649
  2. Yazar: SERPEN DURNAOĞLU
  3. Danışmanlar: PROF. DR. KEMAL KÜRŞAD GENÇ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Nöroloji, Biyoloji, Genetik, Neurology, Biology, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Endotoksinler, Fareler, Hücre dizisi, Lipopolisakkaritler, Mikro RNA, Endotoxins, Mice, Cell line, Lipopolysaccharides, Micro RNA
  7. Yıl: 2012
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Dokuz Eylül Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Sinir Bilimi Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Temel Sinirbilimler Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Mikroglia, beyin makrofajı olarak tanınan glial hücre tipidir. İmmunofenotipik ve fonksiyonel olarak monosit ve makrofaj hücreleriyle benzerlik göstermektedir. Merkezi sinir sisteminde (MSS) mikroglia inflamatuar süreçlerde önemli bir role sahiptir. Post-transkripsiyonel gen regülasyonunda büyük rol oynayan MikroRNA'lar (miRNA), küçük, kodlama yapmayan RNA'lardır. Bu çalışmada amacımız mikroglial aktivasyonda miRNA'ların rolünü araştırmaktır.Çalışmanın ön aşamasında, N9 fare mikroglial hücreleri lipopolisakkaridin (LPS) 100 ng/ml LPS dozu kullanılarak aktive edildi. Mikrorray yöntemi kullanılarak miRNA ekspresyon değişimleri belirlendi. Bu yöntemle ekspresyon değişimi belirlenen miRNA'lardan miR-191, miR-193 ve miR-431'ün gen ekspresyonu kantitatif PCR (qPCR) yöntemiyle incelendi. Daha sonra bu miRNA'ların hedef genleri biyoinformatik yöntem aracılığıyla belirlendi. Belirlenen hedef genlerin validasyonu Lusiferaz testi ile yapıldı.Mikroarray sonuçlarına göre ekspresyon değişimi en fazla olan 30 adet miRNA belirlendi. qPCR sonuçlarına göre miR-191, miR-193 ve miR-431'in ekspresyonun arttığı gösterildi. Biyoinformatik yöntemle belirlenen hedef genlerin ( IL-6, IL-10 ve IRAK1 ) validasyonu yapıldı. Bu miRNA'lardan miR-191'in IL-6'yı, miR-193'ün IL-10'u ve miR-431'in IRAK1'i hedeflediği gösterildi.

Özet (Çeviri)

Microglia is a type of glial cell that are known as macrophages of the brain. They are immunophenotypically and functionally similar to monocytes and macrophages. In the central nervous system (CNS), microglia plays an important role in the inflammatory process. MicroRNAs (miRNAs) which are small, non-coding RNAs have a crucial role in gene regulation at the post-transcriptional level. In this study we aimed to search the role of miRNA on microglial activation.In the experiment, N9 cells were treated with 10-1000ng/ml doses of Lipopolysaccharide (LPS). In preliminary study, by using 100 ng/ml LPS, N9 mouse microglial cells were activated. By using microarray method, miRNA expression changes were determined. Among miRNAs which were determined by microarray, the gene expression of miR-191, miR-193 and miR-431 were examined by qPCR. Afterwards, target genes of those miRNAs were determined by bioinformatics analysis. The validation of target genes which were determined before was done by Luciferase assay.According to qPCR data, its shown that the expression of miR-191,miR-193 and miR-431 increased. The validation of target genes (IL-6, IL-10 ve IRAK1 ) which were determined by bioinformatic method, were done. Of these miRNAs, it has shown that miR-191 targets IL-6, miR-193 targets IL-10 and miR-431 targets IRAK1.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    315825

    Benign ve malign tıkanma sarılıklı hastalarda serum oksidan, antioksidan ve CA19-9 düzeyleri

    Serum oxydant, anti-oxydant and CA19-9 levels in benign and malign obstructive jaundice patients

    GÖKHAN ATEŞ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    Genel CerrahiAtatürk Üniversitesi

    Genel Cerrahi Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. BÜLENT AYDINLI

  2. Tez No

    637137

    Sepsis tedavisinde nutrisyonel destek vererek yanlış mı yapıyoruz? Çözüm fizyolojik açlık mı?

    Are we doing wrong by providing nutritional support in sepsis treatment? Is physiological starving the key solution ?

    GİZEM BAKIR ÜSTÜNDAĞ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıDokuz Eylül Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HASAN ÖZKAN

  3. Tez No

    499048

    Tip 2 diyabetik hastalarda serum endotoksin düzeyinin diyabetin komplikasyonları ile ilşkisi

    Serum endotoxin level is associated with diabetic complications in type 2 diabetic patients

    MUSTAFA BÜYÜKÜNLÜER

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    Endokrinoloji ve Metabolizma HastalıklarıSağlık Bilimleri Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. FÜSUN ERDENEN

  4. Tez No

    282865

    Likopen'in sitoprotektif etkileri

    Cytoprotective effects of lycopene

    BİLGE ÖZKAL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    BiyolojiEskişehir Osmangazi Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ADNAN AYHANCI

  5. Tez No

    68404

    An Optimization study on antidipteran (CRYIV type) toxin production

    Antidipyera (CRYIV tipi) toksin üretiminin optimizasyonu

    MELEK ÖZKAN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    1997

    Bilim ve TeknolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GÜLAY ÖZCENGİZ

Geri Dön