Staphylococcus aureus'un vankomisin ve metisiline karşı stres yanıtı
Stress response of staphylococcus aureus against vancomycin and methicillin
- Tez No: 316892
- Danışmanlar: DOÇ. DR. NEŞE AKIŞ SANSA
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2012
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Trakya Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 99
Özet
Bu çalışma, antibiyotik stresi karşısında farklı Staphylococcus aureus suşlarının ifade ettiği stres yanıtlarını karşılaştırmalı incelemek amacıyla yapıldı. Metisilin duyarlı 4 ve metisilin dirençli 3 suş sıvı kültürde ve 1MİK değerde (MRSA suşları için standart suşun 10 MIK değerinde) oksasilin (Sigma, Almanya) veya vankomisine (Hospira, UK) 5 veya 24 saat maruz bırakıldı. Suşların duvar ve membran proteinleri izole edilerek tek boyutlu SDS-PAGE elektroforezde elektroforetiplendirme yapıldı ve muhtemel proteinlerin oluşturduğu kısıtlı proteom evreni kullanılarak stres yanıtları analiz edildi.Antibiyotik stresine maruziyet sonrasında bakterinin 5 saat içinde bir stres yanıtı geliştirdiği, sonraki 19 saat içinde yanıtın yeni karakterine değiştiği görüldü. Elektroforetiplendirme çalışmasında saptanan 32 adet farklı elektroforetik banttan 20 adedinin tüm suşlarda ortak ifade edildiği ve 23 adedinin strese yanıtta rol aldığı saptandı. Proteom evrenini tahmin çalışmasında 32 adet elektroforetipik bantın 72 adet proteinle eşleştiği, bu proteinlerin 32'siyle oluşan bir havuzun strese yanıtta rol aldığı ve mega analizde bunun 23 adedinin tüm bakterilerde stres karşısında mutlaka değiştiği saptandı. 32 adet proteinin işlevsel incelemesi yapıldığında bunun %41,6'lık kısmının virülans ve stres/direnç yanıtından, geri kalanının sinyal, duvar yapımı, transport ve biyofilm/adezyondan sorumlu olduğu bulundu. Antibiyotik stresi karşısında ifadesi değişen muhtemel proteinler incelendiğinde, LPXTG motifli SasG proteininin ifadesinin arttığı, serin-aspartat tekrarlı protein-C, klamping faktör B, SasG, PBP1, PBP-2 ve SasH proteinlerinden oluşan havuzundan bazılarının ifadesinin azaldığı saptandı. Bakterilerin antibiyotiğe duyarlılığı ile strese yanıtları arasında bir ilişki gözlenmedi.Bu çalışmanın sonuçları S. aureus enfeksiyonuna karşı geliştirilebilecek ve bakteride stres yanıt proteinlerini hedefleyecek drug tasarımı çalışmalarına veri sağlamaktadır. Bu tip tedavi ajanları antibiyotiklere alternatif veya kombine tadavi ajanı olarak düşük doz antibiyotik kullanımı için ümit vaad edicidir.
Özet (Çeviri)
Stress response of Staphylococcus aureus strains were comparatively investigated following antibiotic treatment. Four methicillin-sensitive and three methicillin-resistant strains were treated with MIC of oxacillin (Sigma, Germany) or vancomycin (Hospira, UK) for 5 or 24 hours (10 x MIC of oxacillin of the standard strain for MRSA strains). Cell wall and membrane proteins were isolated, their electrophoretyping were identified using one dimensional SDS-PAGE electrophoresis, and the stress responses of the strains were analyzed using a particular set of possible proteins.The strains developed stress response in 5 hours and changed it to new character in consecutive 19 hours. 20 out of 32 bands of the electrophoretyping study expressed in all strains, and 23 of them involved in stress response. In prediction of a particular set of possible proteins, 72 proteins matched with 32 electrophoretyping bands, a 32 protein pool had a role in stress response, and 23 of them changed in all strains in mega analysis. %41,6 of the 32 proteins were responsible from stress/resistance and virulence, and the rest from signalization, cell wall biogenesis, transport and biofilm formation/adhesion. Expression of SasG protein with LPXTG motive increased, and some members of protein-C with serine-aspartate repeats, clamping factor B, SasG, PBP-1 and -2 and SasH group decreased in response to stress. No correlation was detected between sensitivity level of the strains and stress responses.The results of this study provide data for drug design studies targeting S. aureus stress response proteins. These types of drugs can be alternative for antibiotics and promising agents in combination therapy with low-dose antibiotics.
Benzer Tezler
- Metisiline dirençli stafilokoklarda azalmış vankomisin duyarlılığının araştırılması
Investigation of reduced vancomycin susceptibility in methicillin-resistant staphylococci
FATMA AVCIOĞLU
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2014
MikrobiyolojiDüzce ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. C. ELİF ÖZTÜRK
- Kan kültürlerinden izole edilen ve slime üretimi pozitif olan staphylococcus aureus kökenlerinde MIC ve MBEC yöntemleriyle antibiyotik duyarlılıklarının saptanması
Detection of antibiotic susceptibility of slime positive S.aureus strains isolated from blood cultures by using MIC and MBEC methods
BERRİN TANIDIR
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2008
MikrobiyolojiMarmara ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. K. FUNDA BABACAN
- Trakya Üniversitesi Sağlık Araştırma ve Uygulama Merkezi sağlık çalışanlarında Metisiline Dirençli Staphylococcus Aureus (MRSA) taşıyıcılık oranlarının belirlenmesi
Prevalence for Methicilline Rezistance Staphylococcus Aureus health care workers at Trakya University Hospital
AŞKIN TEKİN
Yüksek Lisans
Türkçe
2010
BiyolojiTrakya ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. H. MURAT TUĞRUL
- Afyonkarahisar'da insan ve hayvanlarda metisiline dirençli Staphylococcus aureus'un (MRSA) nazal taşıyıcılığının araştırılması
Investigation of nasal carriage of methicillin-resistant staphylococcus aureus (MRSA) in humans and animals in afyonkarahisar
MUKADDES GARİPÇİN
Yüksek Lisans
Türkçe
2012
HemşirelikAfyon Kocatepe ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. ESRA ŞEKER
- MEMS based electrochemical dna sensor to detect methicillin resistant Staphylococcus aureus and vancomycin resistant enterococcus species
Metisilin dirençli Staphylococcus aureus ve vankomisin dirençli enterococcus suşlarının tanısı için MEMS tabanlı elektrokimyasal sensör
HATİCE CEYLAN KOYDEMİR
Doktora
İngilizce
2013
BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiKimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. CANAN ÖZGEN
DOÇ. DR. HALUK KÜLAH