Identification and analysis of PEA3 transcription factor target promoters
PEA3 transkripsiyon faktörünün olası hedef promotörlerinin belirlenmesi ve analizi
- Tez No: 317910
- Danışmanlar: PROF. DR. IŞIL AKSAN KURNAZ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Genetik, Biotechnology, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2012
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Yeditepe Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 87
Özet
Transkripsiyon faktörleri gen anlatımını düzenleyen proteinlerdir. PEA3 grubu transkripsiyon faktörleri, ETS ailesinin bir üyesi olup 5'-GGAA/T-3' DNA dizisine bağlanırlar. PEA3/ETV4 transkripsiyon faktörünün motor nöron bağlantıları ve dendrit şekillenmesinde rol oynadığı gösterilmiştir. Bunun yanında, PEA3/ETV4 proteininin sinirsel başkalaşım, sinirsel gelişim ve aksonal yokbulma ile birlikte akciğer ve prostat kanserleri başta olmak çok sayıda kanser türünün metastazında aktif olarak yer aldığı ispatlanmıştır. Bu çalışmada, PEA3/ETV4 transkripsiyon faktörünün hedef genlerinin belirlenmesi amaçlanmış ve bu kapsamda in silico ve moleküler teknikler bir arada kullanılmıştır. Aynı zamanda, PEA3/ETV4 ve diğer transkripsiyon faktörleri için genomu tarayan ve olası hedefleri analiz eden yeni bir çevrimiçi araç tasarlanmıştır.
Özet (Çeviri)
Transcription factors are the proteins which regulate the expression of the target genes. Improper alterations in the activity of transcription factors may lead to severe diseases.The PEA3 group of transcription factors belong to the ETS family and bind to conserved core DNA sequences 5'-GGAA/T -3' It has been showed that, PEA3/ETV4 transcription factor participates in the motor neuron connectivity and dendritic patterning. In addition to this, it is believed that, PEA3/ETV4 protein is able to regulate the genes involved not only in neuronal differentiation, neuronal development and axonal pathfinding but also in metastatic cases of several cancer types, especially lung and prostate cancer.In this study, we aim to identify the downstream targets of PEA3/ETV4 transcription factor to reveal its signaling pathway. For this purpose, we merged the in silico search and molecular biology techniques. Meanwhile, we developed a novel bioinformatics tool which screens and analyze candidate target promoters for PEA3/ETV4 and other transcription factors.
Benzer Tezler
- Promoter elements analysis of katanin p80 gene
Katanin p80 geninin promotor elementlerinin analizi
GÜHER IŞIK CESUR
Yüksek Lisans
İngilizce
2009
Biyolojiİstanbul Teknik Üniversitesiİleri Teknolojiler Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ARZU KARABAY KORKMAZ
- Mukâtil b. Süleyman'ın et-Tefsîrü'l-Kebîradlı eserinde yer alan Hz. Peygamber Dönemi Hıristiyanlarıyla ilgili bilgilerin tespit ve analizi
Identification and analysis of the information on the Christians of the Prophet's Period in Muqātil b. Sulayman's at-Tafsīr al-Kabīr
HALİL AKINCIOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
TarihSakarya Üniversitesiİslam Tarihi ve Sanatları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ESRA ATMACA
- Asenkron motorlarda rulman arızasının ve eksen kaçıklığının tanısı ve analizi
Identification and analysis of bearing damage and eccentricity in induction motors
ENES YÜCEL
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
Mühendislik BilimleriNecmettin Erbakan ÜniversitesiElektrik-Elektronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ MUSTAFA YAĞCI
- Klasik hadis meclis yapısının tespit ve tahlili
Identification and analysis of the structure of classical hadith assemblies
RUKİYE ALTIN
Yüksek Lisans
Türkçe
2025
DinFırat ÜniversitesiTemel İslam Bilimleri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. VEYSEL ÖZDEMİR
- Türk bankacılık sektöründe konsolidasyona neden olan sektör kaynaklı faktörlerin tepit ve analizi
Identification and analysis of the sector specific factors which cause to the consolidation in the Turkish banking sector
DERYA KUMRU